41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3018 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_3018  hypothetical protein  100 
 
 
188 aa  378  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2684  hypothetical protein  69.57 
 
 
187 aa  232  3e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541852  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2648  hypothetical protein  69.57 
 
 
187 aa  228  3e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.48447  normal  0.069264 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2674  hypothetical protein  61.29 
 
 
186 aa  201  5e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0450375  normal  0.833176 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1584  hypothetical protein  54.35 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1405  hypothetical protein  50 
 
 
196 aa  176  2e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.272336  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4633  hypothetical protein  53.67 
 
 
206 aa  162  3e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.412738  normal  0.0320025 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4383  hypothetical protein  38.1 
 
 
168 aa  110  9e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3381  hypothetical protein  35.23 
 
 
204 aa  96.3  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.656171  normal  0.096953 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0827  hypothetical protein  34.64 
 
 
183 aa  93.6  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138174 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0767  hypothetical protein  34.46 
 
 
185 aa  92  5e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0774  hypothetical protein  34.46 
 
 
185 aa  92  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2521  hypothetical protein  33.33 
 
 
185 aa  89  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.606897  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1664  hypothetical protein  36.72 
 
 
193 aa  88.6  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0636  hypothetical protein  30.59 
 
 
185 aa  88.2  6e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.350402  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6228  hypothetical protein  34.91 
 
 
166 aa  86.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.117044  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7077  protein of unknown function DUF177  36.69 
 
 
172 aa  85.9  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.791761  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1284  protein of unknown function DUF177  32.95 
 
 
184 aa  84  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1144  hypothetical protein  32.2 
 
 
182 aa  82  0.000000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1195  hypothetical protein  32.39 
 
 
184 aa  82.4  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2013  hypothetical protein  36.47 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2327  hypothetical protein  37.14 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.253948  normal  0.342087 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2052  hypothetical protein  36.69 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.311209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3290  hypothetical protein  34.44 
 
 
181 aa  76.3  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.519069 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3970  hypothetical protein  32.74 
 
 
176 aa  75.9  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00778287 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1627  hypothetical protein  32 
 
 
187 aa  75.1  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3035  hypothetical protein  34.48 
 
 
181 aa  73.6  0.000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2921  hypothetical protein  30.34 
 
 
185 aa  73.2  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00102807 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0654  protein of unknown function DUF177  33.33 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0156122 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1929  hypothetical protein  38.94 
 
 
176 aa  63.5  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2615  hypothetical protein  33.56 
 
 
197 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.795639  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1273  hypothetical protein  33.56 
 
 
197 aa  49.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.119168 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0917  hypothetical protein  35.48 
 
 
182 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.502721  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2638  hypothetical protein  31.93 
 
 
171 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2795  hypothetical protein  36.36 
 
 
176 aa  47.4  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.377616  normal  0.315987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1909  hypothetical protein  33.33 
 
 
197 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47222  predicted protein  26.4 
 
 
262 aa  45.1  0.0007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.610283  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1670  hypothetical protein  38.1 
 
 
165 aa  44.3  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1895  hypothetical protein  34.75 
 
 
175 aa  44.3  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.780196  normal  0.465482 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1426  hypothetical protein  29.41 
 
 
181 aa  44.3  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.120339  normal  0.649251 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1787  hypothetical protein  35.25 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.173538  normal  0.464632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>