13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2070 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2070  putative exported protein of unknown function  100 
 
 		 260 aa  530  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1950  hypothetical protein  70.77 
 
 		 258 aa  386  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.155338 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3509  hypothetical protein  74.71 
 
 		 258 aa  374  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.219797 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1784  hypothetical protein  71.95 
 
 		 260 aa  340  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.124772  normal  0.0720334 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3050  hypothetical protein  65.83 
 
 		 249 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.756515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1147  hypothetical protein  68.3 
 
 		 281 aa  329  3e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1400  hypothetical protein  65.52 
 
 		 256 aa  325  5e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.475046  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1118  hypothetical protein  32.72 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.464221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0717  hypothetical protein  32.62 
 
 		 261 aa  82  0.000000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00932246  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0873  hypothetical protein  32.86 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0875  hypothetical protein  33.17 
 
 		 289 aa  79  0.00000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  hitchhiker  0.000654596 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0937  hypothetical protein  32.54 
 
 		 261 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.233485 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0898  hypothetical protein  31.71 
 
 		 261 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.683763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>