13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2056 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 292 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1939  hypothetical protein  53.58 
 
 		 302 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0577581  normal  0.305533 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3520  hypothetical protein  51.81 
 
 		 313 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.936766  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2628  hypothetical protein  41.38 
 
 		 305 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.460391  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3041  hypothetical protein  40.57 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1773  hypothetical protein  39.48 
 
 		 334 aa  149  4e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185989  decreased coverage  0.00548408 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2228  hypothetical protein  37.34 
 
 		 274 aa  144  2e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00178512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3320  hypothetical protein  62.79 
 
 		 263 aa  67  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3299  hypothetical protein  25.59 
 
 		 330 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5904  hypothetical protein  40.91 
 
 		 287 aa  45.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.188041  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1645  hypothetical protein  38.6 
 
 		 393 aa  44.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.46786 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3622  hypothetical protein  25.2 
 
 		 328 aa  44.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.453951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5306  hypothetical protein  35.85 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0325155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>