14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0096 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0096  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  185  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2735  hypothetical protein  49.45 
 
 		 108 aa  89  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.611985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0023  hypothetical protein  42.86 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2688  hypothetical protein  43.82 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.241329  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2401  hypothetical protein  40.66 
 
 		 87 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4135  hypothetical protein  39.06 
 
 		 97 aa  54.7  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.997891  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2920  hypothetical protein  30.43 
 
 		 105 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.694114  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0960  hypothetical protein  36.96 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0904  hypothetical protein  40.85 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.445377  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3875  hypothetical protein  40.85 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.795871  normal  0.0304758 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1158  hypothetical protein  30.43 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1243  hypothetical protein  37.14 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000818777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1240  hypothetical protein  29.21 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.85881 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1622  hypothetical protein  44.19 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>