More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4596 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0386  serine/threonine protein kinase  66.38 
 
 
785 aa  912    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.462042 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4596  protein kinase  100 
 
 
795 aa  1555    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.675324  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0336  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
777 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2288  serine/threonine protein kinase  34.96 
 
 
771 aa  130  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000513908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3068  serine/threonine protein kinase  34.65 
 
 
621 aa  128  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000268642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.08 
 
 
622 aa  121  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  31.69 
 
 
625 aa  116  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4532  serine/threonine protein kinase  36.5 
 
 
642 aa  116  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000271647  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0023  protein kinase  31.85 
 
 
625 aa  115  3e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0907172  normal  0.984932 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0015  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.230646  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0023  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0133871 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0015  serine/threonine protein kinase  30.74 
 
 
624 aa  113  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.243084 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1465  protein kinase  31.97 
 
 
653 aa  111  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355835  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0717  serine/threonine protein kinase  31.21 
 
 
861 aa  110  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2164  serine/threonine protein kinase  31.23 
 
 
652 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.563698  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10014  transmembrane serine/threonine-protein kinase B pknB  30.46 
 
 
626 aa  110  1e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3730  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
687 aa  107  7e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00433941 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4041  serine/threonine protein kinase  31.7 
 
 
774 aa  105  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.224391  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2278  serine/threonine protein kinase  31.83 
 
 
752 aa  103  9e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0612166  hitchhiker  0.00000196574 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1519  protein kinase  33.33 
 
 
762 aa  102  4e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.171741  hitchhiker  0.00214244 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0035  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  30.07 
 
 
647 aa  101  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.975748  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3040  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.29 
 
 
591 aa  101  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1709  serine/threonine protein kinase  26.44 
 
 
691 aa  101  6e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  26.63 
 
 
485 aa  101  6e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0111  protein kinase  29.03 
 
 
618 aa  101  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1991  protein kinase  26.44 
 
 
692 aa  100  9e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3340  serine/threonine protein kinase  30.5 
 
 
490 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  26.29 
 
 
475 aa  99.4  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.96 
 
 
598 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  31.64 
 
 
599 aa  99.4  3e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0235  serine/threonine protein kinase  32.68 
 
 
415 aa  99.4  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2578  serine/threonine protein kinase  27.55 
 
 
985 aa  99  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.790371  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3893  protein kinase  30.12 
 
 
502 aa  99  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  31.73 
 
 
710 aa  98.6  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0236  serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
357 aa  98.6  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0072  protein kinase  29.79 
 
 
661 aa  98.6  4e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0019  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
582 aa  98.2  5e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  28.95 
 
 
593 aa  98.2  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2767  protein kinase  26.97 
 
 
457 aa  97.8  7e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  29.63 
 
 
612 aa  97.8  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0899  serine/threonine protein kinase  30 
 
 
499 aa  97.4  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000818625  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1340  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.51 
 
 
662 aa  96.7  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.458756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4531  serine/threonine protein kinase  28.08 
 
 
646 aa  97.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.114343  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2486  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.64 
 
 
715 aa  96.7  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2393  serine/threonine protein kinase  30.2 
 
 
457 aa  95.9  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.380399  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1789  serine/threonine protein kinase with Chase2 sensor  26.18 
 
 
666 aa  95.9  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  25.15 
 
 
461 aa  95.5  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.61 
 
 
579 aa  95.1  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3946  serine/threonine protein kinase  28.62 
 
 
587 aa  95.1  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0106209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  28.89 
 
 
673 aa  95.1  5e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1311  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.57 
 
 
584 aa  94.7  6e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.760538  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  28.84 
 
 
776 aa  94.7  6e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1555  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.74 
 
 
707 aa  94.4  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.556964 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1749  protein kinase  27.88 
 
 
625 aa  93.6  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0016249  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0021  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 
666 aa  93.6  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.94 
 
 
632 aa  92.8  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  26.49 
 
 
604 aa  92.4  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2082  serine/threonine protein kinase  26.01 
 
 
625 aa  92  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0077  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.7 
 
 
676 aa  92.4  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.02 
 
 
668 aa  92  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0754  serine/threonine protein kinase  27.99 
 
 
437 aa  92  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0018  serine/threonine protein kinase  29.1 
 
 
502 aa  92  4e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  26.77 
 
 
621 aa  91.3  7e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1279  protein kinase  28.89 
 
 
664 aa  91.3  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1304  protein kinase  28.89 
 
 
664 aa  91.3  7e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1121  serine/threonine protein kinase  30.11 
 
 
719 aa  90.9  8e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.612323  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2282  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 
646 aa  90.9  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1078  serine/threonine protein kinase  27.61 
 
 
419 aa  90.9  8e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000110576  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0021  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.83 
 
 
681 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1479  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
571 aa  90.1  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.336782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3659  protein kinase  32.68 
 
 
599 aa  90.5  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.340098  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0055  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  27.74 
 
 
615 aa  90.1  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.485948  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0786  serine/threonine protein kinase, putative  25.24 
 
 
666 aa  89.7  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2780  serine/threonine protein kinase  32.7 
 
 
642 aa  89.7  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440633  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0789  serine/threonine kinase protein  25.72 
 
 
614 aa  90.1  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.350319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0990  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 
486 aa  89.4  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000407261  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3400  Serine/threonine protein kinase-related protein  25.56 
 
 
1373 aa  89.4  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0780  serine/threonine protein kinase  32.72 
 
 
457 aa  88.6  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.113085 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1004  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 
368 aa  88.6  4e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1535  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.83 
 
 
627 aa  88.2  6e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00750  probable pknB serine-threonine protein kinase  29.32 
 
 
758 aa  87.8  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0027  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.41 
 
 
664 aa  88.2  6e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  25.47 
 
 
650 aa  87.8  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0025  Serine/threonine protein kinase-related protein  27.37 
 
 
635 aa  87.4  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.135449  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0026  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  26.42 
 
 
601 aa  87  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0496  serine/threonine protein kinase  28.19 
 
 
450 aa  87.4  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  33.2 
 
 
1004 aa  87  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3947  serine/threonine protein kinase  26.16 
 
 
602 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0694263  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  29 
 
 
889 aa  87.4  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0801  serine/threonine protein kinase  31.02 
 
 
471 aa  87  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1995  Serine/threonine protein kinase  28.42 
 
 
560 aa  86.7  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0701  serine/threonine kinase protein  28.31 
 
 
500 aa  86.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000041573  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1052  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.24 
 
 
798 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.687735 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0170  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  27.21 
 
 
681 aa  86.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.504438 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3289  serine/threonine protein kinase  28.47 
 
 
428 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5797  serine/threonine protein kinase  28.16 
 
 
707 aa  86.3  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3788  serine/threonine protein kinase  29.57 
 
 
505 aa  85.5  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.987521  normal  0.0424994 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1077  serine/threonine protein kinase  27.2 
 
 
503 aa  85.5  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000527598  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4042  Serine/threonine protein kinase-related protein  26.55 
 
 
528 aa  85.5  0.000000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3543  serine/threonine protein kinase  28.81 
 
 
537 aa  85.5  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0435506  normal  0.170453 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>