More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3323 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_4913  elongation factor Tu  83 
 
 		 400 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00837266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1479  elongation factor Tu  89.53 
 
 		 401 aa  708    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.008881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3026  elongation factor Tu  89.53 
 
 		 401 aa  708    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4028  elongation factor Tu  96.26 
 
 		 401 aa  758    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.354344  hitchhiker  0.00000974612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1187  elongation factor Tu  99.5 
 
 		 401 aa  808    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.294431  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3323  elongation factor Tu  100 
 
 		 401 aa  812    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000360341  normal  0.122485 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  79.3 
 
 		 400 aa  664    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4323  elongation factor Tu  96.51 
 
 		 401 aa  738    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0230065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0118  elongation factor Tu  83 
 
 		 400 aa  651    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0332354  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1827  translation elongation factor Tu  82.54 
 
 		 400 aa  685    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0713  translation elongation factor Tu  82.54 
 
 		 400 aa  685    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1290  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000272484  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1396  elongation factor Tu  75.62 
 
 		 400 aa  624  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.147055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  74.75 
 
 		 396 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0207  elongation factor Tu  75.94 
 
 		 399 aa  619  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000266697  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1910  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.256474 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2462  elongation factor Tu  75.31 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0594726 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2229  elongation factor Tu  74.5 
 
 		 396 aa  614  1e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0152937 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0223  elongation factor Tu  75.69 
 
 		 400 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.834398  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0318  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000823048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1526  translation elongation factor Tu  74.06 
 
 		 400 aa  611  9.999999999999999e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.358549  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1515  translation elongation factor Tu  74.56 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000283253  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2788  translation elongation factor Tu  72.57 
 
 		 397 aa  612  9.999999999999999e-175  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.117991  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2730  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 400 aa  612  9.999999999999999e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  74.56 
 
 		 400 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1186  translation elongation factor Tu  74.56 
 
 		 397 aa  613  9.999999999999999e-175  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000181174  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1140  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 400 aa  609  1e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000019246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0409  translation elongation factor Tu  74.06 
 
 		 400 aa  610  1e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000794067  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0979  elongation factor Tu  71.92 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.198926  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1378  elongation factor Tu  71.92 
 
 		 405 aa  609  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000000857759  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3669  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3703  elongation factor Tu  72.57 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.871346  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3450  elongation factor Tu  73.07 
 
 		 396 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.939477 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0951  elongation factor Tu  73.13 
 
 		 400 aa  608  1e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000082206  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3204  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  607  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2776  translation elongation factor Tu  72.68 
 
 		 397 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105082  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 400 aa  606  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0792  elongation factor Tu  73.88 
 
 		 399 aa  606  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.640379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2266  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2293  elongation factor Tu  72.07 
 
 		 396 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.404032 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3186  elongation factor Tu  72.32 
 
 		 396 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01150  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.58645e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01010  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 397 aa  606  9.999999999999999e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000907786  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  73.43 
 
 		 400 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1892  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0457981  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1362  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.641297 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2964  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 396 aa  602  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155343  normal  0.97702 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1906  elongation factor Tu  72.82 
 
 		 396 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00245882  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0355  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  72.32 
 
 		 395 aa  600  1e-170  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0371  elongation factor Tu  72.93 
 
 		 396 aa  599  1e-170  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.299108 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1584  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1947  elongation factor Tu  75 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1543  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  600  1e-170  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0213  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00624803  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0199  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000189275  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2335  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00040826  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2350  elongation factor Tu  72.68 
 
 		 400 aa  600  1e-170  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00292725  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0306  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000239655  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0293  elongation factor Tu  72.64 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.197505  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2326  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000632593  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2338  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  595  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000797106  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  72.25 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1355  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.358693  normal  0.0503589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  73.7 
 
 		 397 aa  594  1e-169  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0440  elongation factor Tu  71.5 
 
 		 399 aa  597  1e-169  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000285931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1948  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 395 aa  595  1e-169  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.82 
 
 		 400 aa  593  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0105  elongation factor Tu  75.12 
 
 		 395 aa  592  1e-168  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0109  elongation factor Tu  75.12 
 
 		 395 aa  593  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000245051  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0173  elongation factor Tu  70 
 
 		 399 aa  591  1e-168  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.000168704  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0325  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.275223  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0483  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000918892  hitchhiker  0.00000259901 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0166  elongation factor Tu  70.25 
 
 		 399 aa  588  1e-167  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000496784  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0311  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.171868  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  587  1e-167  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1325  elongation factor Tu  70.75 
 
 		 399 aa  590  1e-167  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000100394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0495  elongation factor Tu  74.06 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0610373  hitchhiker  0.00000000794033 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00000816391  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0520  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.611126  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  71.57 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  587  1e-166  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1465  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.00000111535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0499  elongation factor Tu  69.75 
 
 		 399 aa  585  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240706  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000467982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  70.57 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  69.9 
 
 		 397 aa  584  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000334885  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0265  elongation factor Tu  71.07 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000271632  hitchhiker  0.00214055 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0277  elongation factor Tu  71.32 
 
 		 396 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000015281  unclonable  0.000000133625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>