More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3118 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2960  recombinase A  96.32 
 
 		 353 aa  661    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0334216  hitchhiker  0.0000660744 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3118  recombinase A  100 
 
 		 353 aa  712    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000163831  unclonable  0.0000179844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1747  recombinase A  82.44 
 
 		 351 aa  603  1.0000000000000001e-171  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000101073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  79.82 
 
 		 358 aa  565  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  71.12 
 
 		 344 aa  488  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1627  recombinase A  71.52 
 
 		 341 aa  490  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1079  recA protein  69.44 
 
 		 348 aa  481  1e-135  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0676  recA protein  69 
 
 		 347 aa  482  1e-135  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169949  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3106  recA protein  70.47 
 
 		 346 aa  481  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000524014  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1034  recombinase A  67.25 
 
 		 343 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0682579  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1986  recombinase A  69.02 
 
 		 361 aa  476  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1958  recombinase A  70.25 
 
 		 362 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.212458 
 
 
-
 
NC_004310  BR1202  recombinase A  69.02 
 
 		 361 aa  475  1e-133  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1473  recA protein  66.77 
 
 		 355 aa  475  1e-133  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.000000112388  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1165  recombinase A  69.02 
 
 		 424 aa  475  1e-133  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.165606  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2169  recombinase A  70.55 
 
 		 364 aa  474  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.423968  normal  0.0596488 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1263  recombinase A  66.18 
 
 		 360 aa  477  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.778933  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1041  recA protein  69.85 
 
 		 364 aa  476  1e-133  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1492  recA protein  70.25 
 
 		 345 aa  474  1e-133  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.211084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23200  protein RecA  69.33 
 
 		 359 aa  471  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.930258  normal  0.114189 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1833  recA protein  68.21 
 
 		 363 aa  472  1e-132  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0352919  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2819  recombinase A  65.81 
 
 		 366 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1927  recombinase A  69.44 
 
 		 352 aa  473  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1645  recombinase A  69.14 
 
 		 352 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2403  recA protein  66.08 
 
 		 343 aa  471  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.104177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0513  recA protein  66.76 
 
 		 350 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.213728 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4376  recombinase A  65.98 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1545  recA protein  67.79 
 
 		 346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.259692  normal  0.07485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3524  recA protein  66.28 
 
 		 355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00288101 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  68.4 
 
 		 361 aa  469  1.0000000000000001e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2558  recombinase A  66.98 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.352201  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1280  recombinase A  64.29 
 
 		 362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.118352  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3741  recombinase A  65.8 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.709907 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1730  recombinase A  66.86 
 
 		 363 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00591118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1616  recombinase A  66.28 
 
 		 362 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1725  recombinase A  66.18 
 
 		 360 aa  470  1.0000000000000001e-131  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.971685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27820  protein RecA  68.71 
 
 		 345 aa  468  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0461192 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1006  recA protein  65.31 
 
 		 359 aa  469  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1118  recA protein  68.71 
 
 		 365 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145639  normal  0.0819488 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1473  RecA protein  68.77 
 
 		 364 aa  468  1.0000000000000001e-131  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0213351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10530  protein RecA  70.31 
 
 		 368 aa  465  9.999999999999999e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419207  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1242  recA protein  68.71 
 
 		 376 aa  466  9.999999999999999e-131  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1765  recombinase A  63.66 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1765  recombinase A  63.66 
 
 		 348 aa  467  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1419  recA protein  69.04 
 
 		 347 aa  467  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1219  recombinase A  67.78 
 
 		 347 aa  466  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0979767  normal  0.281308 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1549  recA protein  67.28 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1567  recombinase A  66.57 
 
 		 363 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000432957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5453  recombinase A  66.87 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.658876  normal  0.17766 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1785  recA protein  69.04 
 
 		 350 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17690  RecA protein  67.7 
 
 		 367 aa  464  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.72475  normal  0.370795 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6708  recombinase A  67.67 
 
 		 345 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.141706  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  65.2 
 
 		 347 aa  465  9.999999999999999e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2202  recA protein  68.2 
 
 		 347 aa  464  1e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1581  recA protein  67.69 
 
 		 383 aa  462  1e-129  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3161  recombinase A  66.96 
 
 		 336 aa  461  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11890  recA protein  68.54 
 
 		 357 aa  464  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000128048  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1462  recombinase A  67.48 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000631927 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3525  recombinase A  66.18 
 
 		 345 aa  463  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.551254  normal  0.0703421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1619  recA protein  66.18 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177143  hitchhiker  0.0000000069085 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  68.85 
 
 		 350 aa  463  1e-129  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1423  recA protein  70.59 
 
 		 344 aa  462  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.716578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3994  recA protein  68.42 
 
 		 352 aa  462  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0864938  normal  0.282621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1460  recombinase A  66.87 
 
 		 351 aa  462  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00992179  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3103  recA protein  65.1 
 
 		 343 aa  461  1e-129  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000175278  normal  0.820651 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  66.36 
 
 		 347 aa  461  1e-129  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2420  recombinase A  65.8 
 
 		 350 aa  462  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.157742  normal  0.0782537 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1389  recombinase A  67.69 
 
 		 348 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.384565  normal  0.0556082 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1050  recA protein  70.28 
 
 		 349 aa  458  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4080  recombinase A  66.87 
 
 		 361 aa  459  9.999999999999999e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1425  recombinase A  67.69 
 
 		 348 aa  458  9.999999999999999e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.976211  normal  0.0337506 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2134  recombinase A  67.49 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00345325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2405  recombinase A  67.38 
 
 		 341 aa  460  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07480  RecA protein  64.9 
 
 		 352 aa  458  9.999999999999999e-129  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0526583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3630  recombinase A  69.33 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1275  recombinase A  65.98 
 
 		 356 aa  460  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.138864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3735  recombinase A  69.33 
 
 		 338 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2147  recombinase A  67.49 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10720  protein RecA  64.55 
 
 		 361 aa  458  9.999999999999999e-129  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000907009  unclonable  0.00000000149755 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3975  recombinase A  64.64 
 
 		 350 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2341  recA protein  67.81 
 
 		 350 aa  458  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2193  recombinase A  67.49 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0979046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2578  recA protein  65.9 
 
 		 365 aa  461  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0869161  normal  0.0795722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07230  protein RecA  65.38 
 
 		 351 aa  457  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.533016  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0512  recombinase A  63.48 
 
 		 357 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.759794  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0628  recA protein  63.66 
 
 		 346 aa  456  1e-127  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.067585  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0666  recA protein  65.94 
 
 		 378 aa  456  1e-127  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386455  normal  0.202905 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4183  recA protein  66.56 
 
 		 349 aa  455  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.888096  normal  0.191355 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1610  recA protein  66.26 
 
 		 390 aa  457  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651077 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2179  recA protein  68.44 
 
 		 347 aa  457  1e-127  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.385059  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0711  recombinase A  66.36 
 
 		 345 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1021  RecA protein  64.4 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0284  recombinase A  63.5 
 
 		 418 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0864352  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2216  RecA protein  67.29 
 
 		 366 aa  453  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.139784 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0843  recA protein  67.29 
 
 		 345 aa  451  1e-125  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0527  recombinase A  65.29 
 
 		 353 aa  450  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000554316  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1986  recombinase A  65.12 
 
 		 357 aa  448  1e-125  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.285484  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0671  recombinase A  64.37 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.180955 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  64.69 
 
 		 353 aa  448  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3295  recombinase A  65.38 
 
 		 358 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.303399  normal  0.877549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>