18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2916 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2916  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  265  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1944  hypothetical protein  34.86 
 
 		 110 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  35.24 
 
 		 592 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4364  hypothetical protein  29.36 
 
 		 109 aa  63.9  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4426  hypothetical protein  29.36 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.207049 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0198  hypothetical protein  32.11 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2315  hypothetical protein  34.31 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.3085e-20 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1843  hypothetical protein  33.01 
 
 		 106 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0647  hypothetical protein  31.73 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0152251  normal  0.451427 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  28.7 
 
 		 2732 aa  53.9  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4999  hypothetical protein  32.41 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.462909 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5373  hypothetical protein  32.46 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380497 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4362  hypothetical protein  29.46 
 
 		 111 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0773532 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5275  hypothetical protein  26.47 
 
 		 115 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2358  hypothetical protein  33.65 
 
 		 116 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.281652 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6391  hypothetical protein  26.42 
 
 		 552 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4483  hypothetical protein  31.68 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.886184 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1185  hypothetical protein  31.73 
 
 		 112 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>