67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2207 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2207  hypothetical protein  100 
 
 		 938 aa  1878    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.120954 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1399  peptidase M23B  71.83 
 
 		 945 aa  1253    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.173601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1915  WD40 domain-containing protein  29.15 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146751  unclonable  0.0000119274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4129  WD40 domain-containing protein  30.17 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000900599 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  37.89 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  40.19 
 
 		 372 aa  58.9  0.0000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0737  Peptidase M23  39.62 
 
 		 580 aa  58.2  0.0000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.200765  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  39.13 
 
 		 305 aa  56.6  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  37.36 
 
 		 271 aa  55.5  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  36.26 
 
 		 271 aa  55.1  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  31.21 
 
 		 278 aa  54.3  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  34.88 
 
 		 216 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  33.04 
 
 		 379 aa  52.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0178  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  39.78 
 
 		 321 aa  52  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6698  Peptidase M23  32.11 
 
 		 271 aa  52  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.145065 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0286  peptidase M23B  36.79 
 
 		 374 aa  52  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1980  Peptidase M23  37.5 
 
 		 460 aa  51.6  0.00007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00339871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  38.64 
 
 		 425 aa  51.6  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3257  peptidase M23  29.77 
 
 		 450 aa  51.6  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000116683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  40.48 
 
 		 324 aa  51.2  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1518  peptidase M23B  38.64 
 
 		 425 aa  50.4  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  35.58 
 
 		 274 aa  51.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0735  M24/M37 family peptidase  33.72 
 
 		 296 aa  50.8  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0510667  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  33.71 
 
 		 307 aa  50.8  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0935  peptidase M23B  30.71 
 
 		 598 aa  50.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  32.04 
 
 		 363 aa  49.7  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3351  peptidase M23B  30.77 
 
 		 687 aa  48.9  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0955739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  32 
 
 		 309 aa  48.1  0.0007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  34.52 
 
 		 430 aa  48.1  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  33.04 
 
 		 443 aa  48.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1615  Peptidase M23  34 
 
 		 299 aa  47.8  0.0009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1618  peptidase M23B  37.5 
 
 		 412 aa  47.8  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278524  normal  0.127445 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1140  peptidase M23B  37.5 
 
 		 421 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1596  peptidase M23B  37.5 
 
 		 400 aa  47.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.559907  normal  0.338058 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2941  peptidase M23B  36.36 
 
 		 454 aa  47  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4765  peptidase M23B  37.5 
 
 		 420 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.467777 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2441  Peptidase M23  34.21 
 
 		 735 aa  47.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00201295  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1620  peptidase M23B  37.5 
 
 		 421 aa  47.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  32.97 
 
 		 271 aa  47.4  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0734  peptidase M23B  32.38 
 
 		 373 aa  47.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0522246  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  34.29 
 
 		 375 aa  47.4  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  34.09 
 
 		 517 aa  46.6  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0192  Peptidase M23  33.02 
 
 		 312 aa  47  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0565  Peptidase M23  33.33 
 
 		 475 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2121  Peptidase M23  31.82 
 
 		 262 aa  46.6  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  36.36 
 
 		 377 aa  47  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004404  membrane protein  34.44 
 
 		 333 aa  46.6  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2852  peptidase M23B  32.38 
 
 		 315 aa  46.6  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0621759  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0798  peptidase M23B  26.45 
 
 		 316 aa  46.6  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000346497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0504  peptidase M23B  34.07 
 
 		 419 aa  46.6  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  34.12 
 
 		 308 aa  46.6  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5107  peptidase M23B  31.31 
 
 		 345 aa  47  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000871581  decreased coverage  0.00235334 
 
 
-
 
NC_002978  WD0483  M23/M37 peptidase domain-containing protein  26.79 
 
 		 312 aa  46.2  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0302091  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4988  peptidase M23B  28.46 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.333903  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  35.56 
 
 		 376 aa  46.2  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3172  peptidase M23B  28.46 
 
 		 457 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.054891 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1579  Peptidase M23  32.11 
 
 		 469 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1555  Peptidase M23  32.11 
 
 		 469 aa  45.8  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  32.79 
 
 		 319 aa  45.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  33.02 
 
 		 377 aa  45.4  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  35.29 
 
 		 429 aa  45.1  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2457  peptidoglycan binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 294 aa  45.1  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.156102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1417  peptidase M23B  37.63 
 
 		 523 aa  45.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  34.21 
 
 		 374 aa  44.7  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.35 
 
 		 569 aa  45.1  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2111  peptidase M23B  36.47 
 
 		 362 aa  45.1  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315561 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4308  peptidase M23B  31.31 
 
 		 457 aa  44.7  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000552586  decreased coverage  0.0000000100746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>