35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2049 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3026  hypothetical protein  95.48 
 
 
379 aa  741    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2049  hypothetical protein  100 
 
 
385 aa  787    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1034  D-fructose 1,6-bisphosphatase  68.13 
 
 
365 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000176813  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1225  hypothetical protein  66.12 
 
 
365 aa  519  1e-146  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000218903  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1007  fructose 1,6-bisphosphatase  66.12 
 
 
365 aa  519  1e-146  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000103217  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1839  hypothetical protein  65.56 
 
 
370 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0128949  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0432  protein of unknown function DUF100  62.87 
 
 
371 aa  495  1e-139  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2266  D-fructose 1,6-bisphosphatase  64.31 
 
 
379 aa  496  1e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0748752 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0665  protein of unknown function DUF100  64.19 
 
 
378 aa  491  9.999999999999999e-139  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1859  protein of unknown function DUF100  64.27 
 
 
376 aa  477  1e-133  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.792166  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0196  hypothetical protein  63.01 
 
 
368 aa  476  1e-133  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0607  protein of unknown function DUF100  60.38 
 
 
381 aa  469  1.0000000000000001e-131  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2259  D-fructose 1,6-bisphosphatase  59.05 
 
 
383 aa  463  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.287275 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1333  hypothetical protein  60.27 
 
 
371 aa  464  1e-129  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1563  hypothetical protein  62.05 
 
 
365 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1263  protein of unknown function DUF100  57.66 
 
 
382 aa  456  1e-127  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0141  hypothetical protein  58.24 
 
 
406 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.692652  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0111  D-fructose 1,6-bisphosphatase  57.98 
 
 
399 aa  443  1e-123  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.150469 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1538  hypothetical protein  56.56 
 
 
371 aa  442  1e-123  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0000224376  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0133  hypothetical protein  57.6 
 
 
399 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.577746  normal  0.0224851 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1181  hypothetical protein  57.18 
 
 
399 aa  437  1e-121  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1612  hypothetical protein  58.45 
 
 
365 aa  432  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.160162 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1151  hypothetical protein  58.65 
 
 
402 aa  430  1e-119  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0634  hypothetical protein  56.75 
 
 
383 aa  429  1e-119  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.372461  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1328  hypothetical protein  55.86 
 
 
383 aa  431  1e-119  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.328704  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1319  hypothetical protein  56.47 
 
 
383 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1357  D-fructose 1,6-bisphosphatase  56.75 
 
 
383 aa  427  1e-118  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0171  hypothetical protein  53.42 
 
 
383 aa  411  1e-114  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2722  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.73 
 
 
365 aa  311  1e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1035  hypothetical protein  44.15 
 
 
381 aa  295  7e-79  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0625  hypothetical protein  39.26 
 
 
382 aa  241  1e-62  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1562  fructose-1,6-bisphosphatase  38.99 
 
 
382 aa  236  7e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0797  protein of unknown function DUF100  32.63 
 
 
298 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.824742  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0221  fructose 1 6-bisphosphatase-like protein  50 
 
 
83 aa  59.7  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1327  hypothetical protein  36.73 
 
 
223 aa  50.4  0.00006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.372464  normal  0.720842 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>