16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1945 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1945  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  147  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5281  hypothetical protein  51.47 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.144137  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0197  hypothetical protein  54.69 
 
 
69 aa  61.2  0.000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0303  hypothetical protein  46.03 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5372  hypothetical protein  47.14 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.475394 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4544  hypothetical protein  37.1 
 
 
78 aa  54.3  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.926534 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5274  hypothetical protein  44.26 
 
 
108 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1763  hypothetical protein  44.83 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.632113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4198  hypothetical protein  60 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4237  hypothetical protein  60 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00284091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4363  hypothetical protein  40.98 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4425  hypothetical protein  40.98 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.134542 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3290  hypothetical protein  37.29 
 
 
65 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10622  hypothetical protein  43.14 
 
 
127 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00404257  normal  0.439556 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3918  hypothetical protein  42.59 
 
 
64 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2171  hypothetical protein  42.31 
 
 
66 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0676004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>