13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1944 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1944  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  227  4e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0198  hypothetical protein  51.82 
 
 		 137 aa  120  9e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4426  hypothetical protein  42.34 
 
 		 109 aa  100  6e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.207049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4364  hypothetical protein  41.44 
 
 		 109 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5373  hypothetical protein  41.82 
 
 		 113 aa  94  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380497 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4540  hypothetical protein  40 
 
 		 163 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.878379 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3291  adhesin HecA family  37.27 
 
 		 2732 aa  88.6  2e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1762  S-type Pyocin domain protein  35.78 
 
 		 592 aa  77.4  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.842268  n/a   
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5275  hypothetical protein  40.38 
 
 		 115 aa  77.4  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2916  hypothetical protein  34.86 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.355272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6391  hypothetical protein  29.91 
 
 		 552 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2358  hypothetical protein  35.71 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.281652 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4999  hypothetical protein  35.37 
 
 		 116 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.540186  normal  0.462909 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>