More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1923 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1923  ABC transporter related  100 
 
 		 163 aa  324  3e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4124  ABC transporter related  75.82 
 
 		 526 aa  241  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316959 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0577  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 		 395 aa  110  8.000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0793  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.9 
 
 		 278 aa  107  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0093  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 		 278 aa  104  5e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1794  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.33 
 
 		 284 aa  103  7e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0728  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.23 
 
 		 281 aa  102  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.216376  normal  0.366989 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1190  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.89 
 
 		 281 aa  101  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1404  cobalt transporter ATP-binding subunit  39.33 
 
 		 277 aa  101  6e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1296  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.76 
 
 		 403 aa  99.8  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.800126  normal  0.0150506 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2330  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 		 403 aa  97.8  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0782  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.06 
 
 		 244 aa  97.4  8e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01480  ABC transporter related  38.16 
 
 		 283 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000123426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02430  ABC transporter related  38.16 
 
 		 283 aa  95.5  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.296301  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0143  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.89 
 
 		 281 aa  95.1  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.13815  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4018  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.58 
 
 		 259 aa  95.1  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0713  ABC transporter related  37.01 
 
 		 282 aa  95.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1478  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.54 
 
 		 277 aa  94  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3208  cobalt transport protein ATP-binding subunit  32.32 
 
 		 398 aa  94  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1572  cobalt ABC transporter ATPase subunit  41.06 
 
 		 242 aa  94  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1045  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.76 
 
 		 277 aa  93.6  9e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.891717 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  36.84 
 
 		 312 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0998  ABC transporter related  37.58 
 
 		 325 aa  92.4  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.241901  normal  0.595675 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0246  ABC transporter related  38.32 
 
 		 283 aa  92.4  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.708185  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1541  ABC transporter related  39.24 
 
 		 548 aa  92.8  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.795149  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1391  cobalt transporter ATP-binding subunit  36.42 
 
 		 310 aa  92.8  2e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0500494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1059  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 		 276 aa  92.4  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12570  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  38.31 
 
 		 344 aa  92  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0528  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  35.06 
 
 		 402 aa  90.9  6e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1384  ABC transporter related  32.52 
 
 		 283 aa  90.9  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2441  ABC transporter related  45.22 
 
 		 449 aa  90.9  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.166443  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5652  ABC transporter related  46.43 
 
 		 488 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.125126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5273  ABC transporter related  46.43 
 
 		 488 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2472  ABC transporter related  35.57 
 
 		 263 aa  90.9  7e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5362  ABC transporter related  46.43 
 
 		 488 aa  90.9  7e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.529783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1219  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.53 
 
 		 456 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2562  ABC transporter, ATP-binding protein  38.97 
 
 		 274 aa  90.1  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.196355 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0995  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.42 
 
 		 243 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5176  ABC transporter related  35.57 
 
 		 246 aa  90.1  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1074  hypothetical protein  35.57 
 
 		 380 aa  89.7  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1041  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  38.82 
 
 		 270 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.286064 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2150  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.87 
 
 		 280 aa  89  2e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2726  ABC transporter related  37.5 
 
 		 258 aa  89.7  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2149  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  29.8 
 
 		 453 aa  89.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.585974 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1087  ABC-type cobalt transport system, ATPase component  31.79 
 
 		 288 aa  89.4  2e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2125  ABC transporter related  37.96 
 
 		 272 aa  88.6  3e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0679248  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0295  ABC transporter related  38.82 
 
 		 263 aa  89  3e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2137  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.58 
 
 		 264 aa  88.2  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1205  ABC transporter related protein  37.58 
 
 		 251 aa  88.2  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00143482  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0226  ABC transporter related  34.59 
 
 		 290 aa  88.2  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00993646  normal  0.660997 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1697  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  27.52 
 
 		 440 aa  88.6  4e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000292327  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2316  ABC transporter related  36.21 
 
 		 258 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.275517  hitchhiker  0.00114798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2760  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36 
 
 		 250 aa  88.2  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2706  ABC transporter related  36.21 
 
 		 258 aa  88.2  5e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1807  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.75 
 
 		 256 aa  87.8  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000072763  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0185  cobalt transporter ATP-binding subunit  32 
 
 		 285 aa  87.8  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2864  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 258 aa  87.4  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.150555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1454  ABC transporter related  35.48 
 
 		 288 aa  87.4  7e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000218483  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2294  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.24 
 
 		 246 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.663382  normal  0.120139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1009  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  36.91 
 
 		 253 aa  87  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0648112  normal  0.387101 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1198  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.04 
 
 		 256 aa  87  9e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0172513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 300 aa  86.7  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0188  cobalt transporter ATP-binding subunit  32 
 
 		 285 aa  87  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.790607  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2734  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.21 
 
 		 285 aa  86.7  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1281  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein  37.75 
 
 		 249 aa  85.9  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.234909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  34.38 
 
 		 280 aa  85.5  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1219  cobalt transport protein ATP-binding subunit  33.33 
 
 		 284 aa  86.3  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0189  ABC transporter related  34.9 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000239046  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1705  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  32.67 
 
 		 411 aa  86.3  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1639  ABC transporter related  38.3 
 
 		 278 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000187307 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4263  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  33.55 
 
 		 259 aa  85.5  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.493384 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0006  ABC transporter related  33.56 
 
 		 273 aa  85.5  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.257411  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28820  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  36.49 
 
 		 641 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1006  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.67 
 
 		 271 aa  85.1  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1930  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 258 aa  85.1  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.58 
 
 		 285 aa  85.1  4e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0131  ABC transporter related  34.46 
 
 		 585 aa  84.7  4e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0630  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.58 
 
 		 433 aa  85.1  4e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.210458  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2564  cobalt transporter ATP-binding subunit  31.54 
 
 		 273 aa  84.7  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000482859  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2438  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  35.34 
 
 		 257 aa  84.7  5e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.326604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2941  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.91 
 
 		 388 aa  84.7  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0311  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  38.94 
 
 		 380 aa  84.7  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.671338  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1228  ABC transporter related  39.82 
 
 		 631 aa  84.3  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1298  ABC transporter component  40.38 
 
 		 263 aa  84.3  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.943578  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  38.39 
 
 		 312 aa  84  7e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  36.69 
 
 		 314 aa  84  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4750  ABC transporter related  33.61 
 
 		 239 aa  84  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000409698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2604  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.44 
 
 		 288 aa  84  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.573166  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.74 
 
 		 319 aa  84  9e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2132  cobalt ABC transporter, ATP-binding protein, putative  26.67 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  36.23 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1764  ABC transporter related  31.76 
 
 		 248 aa  83.6  0.000000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000974865  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0161  cobalt transporter ATP-binding subunit  35.1 
 
 		 293 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00175996  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1984  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.67 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.210104  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1119  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  37.01 
 
 		 257 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.449821 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0649  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.43 
 
 		 373 aa  83.2  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.706338  normal  0.517964 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1269  cobalt ABC transporter, ATPase subunit  30.67 
 
 		 281 aa  83.2  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0526  ABC transporter-related protein  40 
 
 		 253 aa  82.4  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0304047  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  37.27 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1967  ABC transporter related  35.25 
 
 		 557 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000973453  decreased coverage  0.00000019126 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>