More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1345 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1345  chaperonin Cpn10  100 
 
 		 95 aa  192  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.234338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1322  chaperonin Cpn10  96.84 
 
 		 95 aa  185  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.071778  normal  0.696919 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2295  chaperonin Cpn10  57.5 
 
 		 88 aa  96.3  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0033  chaperonin Cpn10  47.62 
 
 		 89 aa  84.7  3e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0230  co-chaperonin GroES  44.44 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000701184  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1595  Chaperonin Cpn10  53.25 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000279872  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0958  co-chaperonin GroES  45.56 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2130  chaperonin Cpn10  48.39 
 
 		 95 aa  79  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000318883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0564  chaperonin Cpn10  47.19 
 
 		 102 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1109  co-chaperonin GroES  42.22 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1844  co-chaperonin GroES  45.24 
 
 		 91 aa  78.6  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.986067  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0362  chaperonin Cpn10  42.71 
 
 		 102 aa  77.8  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.686615  normal  0.421985 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00675  co-chaperonin GroES  47.06 
 
 		 91 aa  77.4  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0379  chaperonin Cpn10  41.11 
 
 		 95 aa  77.4  0.00000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000945621  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0251  co-chaperonin GroES  42.22 
 
 		 94 aa  77.4  0.00000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000150313  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1919  chaperonin Cpn10  44.32 
 
 		 100 aa  77  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0053  co-chaperonin GroES  55.22 
 
 		 90 aa  77  0.00000000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00191023  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1405  co-chaperonin GroES  44.94 
 
 		 94 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000307277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3678  chaperonin Cpn10  47.31 
 
 		 100 aa  76.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0684  chaperonin Cpn10  43.48 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.448895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2733  chaperonin Cpn10  45.78 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0391  co-chaperonin GroES  43.96 
 
 		 94 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3660  chaperonin Cpn10  47.83 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.39196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6246  chaperonin Cpn10  44.83 
 
 		 93 aa  75.9  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08630  Co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 98 aa  75.5  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3339  co-chaperonin GroES  44.94 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.148697  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2928  chaperonin Cpn10  41.11 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000296393  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0735  co-chaperonin GroES  42.55 
 
 		 98 aa  75.1  0.0000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.224017  normal  0.240552 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5811  chaperonin Cpn10  41.05 
 
 		 97 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907137  decreased coverage  0.0027447 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2803  co-chaperonin GroES  40.22 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000132343  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3335  chaperonin Cpn10  48.86 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0489  chaperonin Cpn10  46.67 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000458511  hitchhiker  0.00790921 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0512  co-chaperonin GroES  42.7 
 
 		 94 aa  74.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0028  co-chaperonin GroES  42.7 
 
 		 95 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  6.32588e-17  normal  0.625386 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0288  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000514345  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0252  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000529101  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0238  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.27511e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0239  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442423  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1305  co-chaperonin GroES  38.89 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000222526  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0266  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0316  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000403137  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0292  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 94 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1789  co-chaperonin GroES  44.09 
 
 		 103 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2494  chaperonin Cpn10  45.88 
 
 		 87 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000670366  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0833  co-chaperonin GroES  37.78 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000406281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1088  chaperonin Cpn10  46.07 
 
 		 98 aa  73.6  0.0000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000000466109  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4306  co-chaperonin GroES  41.57 
 
 		 96 aa  73.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235031  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0453  chaperonin Cpn10  45.45 
 
 		 95 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0443  chaperonin Cpn10  38.95 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3647  co-chaperonin GroES  40.2 
 
 		 97 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0297  co-chaperonin GroES  40 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000149482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1035  co-chaperonin GroES  48.15 
 
 		 86 aa  73.2  0.000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.281335  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0034  chaperonin Cpn10  40.91 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0295415  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0782  co-chaperonin GroES  37.78 
 
 		 95 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000134232  normal  0.229637 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1407  chaperonin Cpn10  43.33 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.780371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0245  co-chaperonin GroES  40 
 
 		 94 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000139504  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3096  chaperonin Cpn10  42.05 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4326  co-chaperonin GroES  39.13 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.212063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0611  Chaperonin Cpn10  44.94 
 
 		 98 aa  73.6  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.740191  normal  0.337946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5027  co-chaperonin GroES  40 
 
 		 94 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000449913  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0521  co-chaperonin GroES  42.35 
 
 		 89 aa  72.4  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.125145 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0985  chaperonin Cpn10  44.05 
 
 		 98 aa  72.4  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.844996  normal  0.719219 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1007  chaperonin Cpn10  40.43 
 
 		 98 aa  72  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5366  chaperonin Cpn10  41.11 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.676466 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0232  chaperonin Cpn10  42.7 
 
 		 96 aa  72  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4151  co-chaperonin GroES  45.45 
 
 		 96 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0190602  normal  0.541056 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0679  co-chaperonin GroES  35.56 
 
 		 95 aa  72  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.221594 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0668  co-chaperonin GroES  47.5 
 
 		 86 aa  72  0.000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000199289  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0225  chaperonin Cpn10  33.72 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1165  chaperonin Cpn10  45.16 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.731664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1212  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 101 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.694559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1282  chaperonin Cpn10  42.17 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0543961  normal  0.509292 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3627  co-chaperonin GroES  36.96 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.711938  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0756  chaperonin Cpn10  45.12 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.544888  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2078  chaperonin Cpn10  45.45 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.354886  normal  0.301492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1154  co-chaperonin GroES  41.11 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1856  groes  42.55 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.70749  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0309  hypothetical protein  41.38 
 
 		 92 aa  71.2  0.000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1719  chaperonin Cpn10  40.45 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0619  chaperonin Cpn10  39.39 
 
 		 104 aa  70.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.143984  normal  0.40407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0632  co-chaperonin GroES  42.7 
 
 		 101 aa  70.9  0.000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3842  chaperonin Cpn10  43.33 
 
 		 102 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2891  co-chaperonin GroES  41.76 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5848  chaperonin Cpn10  42.05 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2874  chaperonin Cpn10  41.11 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000282007  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1173  co-chaperonin GroES  38.64 
 
 		 98 aa  70.9  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.749354  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0248  chaperonin Cpn10  39.33 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000171869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0160  chaperonin Cpn10  42.7 
 
 		 94 aa  71.2  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1207  chaperonin Cpn10  44.57 
 
 		 99 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.867572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0316  chaperonin Cpn10  42.86 
 
 		 92 aa  70.9  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0011552  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0632  co-chaperonin GroES  43.21 
 
 		 86 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000449182  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0586  chaperonin Cpn10  44.32 
 
 		 95 aa  70.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.515387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0545  chaperonin Cpn10  43.33 
 
 		 94 aa  70.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000554341  normal  0.812353 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5326  co-chaperonin GroES  40.91 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.769005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3359  co-chaperonin GroES  34.41 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.755845  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0497  co-chaperonin GroES  37.78 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000741059  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3375  chaperonin Cpn10  42.05 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0900877 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4453  chaperonin Cpn10  43.48 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4130  chaperonin Cpn10  44.21 
 
 		 101 aa  70.5  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00154355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2920  chaperonin 10 Kd subunit  40.91 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.907264  normal  0.269903 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>