More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1161 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1161  30S ribosomal protein S13  100 
 
 		 127 aa  248  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000440374  normal  0.0874065 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4002  30S ribosomal protein S13  96.85 
 
 		 127 aa  205  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000504702  hitchhiker  0.000204187 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4937  30S ribosomal protein S13  69.29 
 
 		 127 aa  193  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000115792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0892  30S ribosomal protein S13  73.98 
 
 		 122 aa  189  9e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000337976  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3000  30S ribosomal protein S13  87.3 
 
 		 126 aa  183  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.947306  hitchhiker  0.00676335 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2307  30S ribosomal protein S13  69.67 
 
 		 122 aa  182  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00023627  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  65.85 
 
 		 123 aa  179  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2929  30S ribosomal protein S13  67.48 
 
 		 123 aa  179  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141788  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1499  30S ribosomal protein S13  68.29 
 
 		 123 aa  179  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2594  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 126 aa  172  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0246557  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0784  30S ribosomal protein S13  68.03 
 
 		 122 aa  172  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0056634  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2882  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 126 aa  171  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.617187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  171  3.9999999999999995e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  68.75 
 
 		 128 aa  170  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  169  7.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1957  30S ribosomal protein S13  68.75 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1922  30S ribosomal protein S13  68.75 
 
 		 128 aa  169  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0447  30S ribosomal protein S13  67.86 
 
 		 123 aa  169  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.219651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1158  ribosomal protein S13  67.46 
 
 		 125 aa  168  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000034359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 123 aa  168  2e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1089  30S ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 122 aa  167  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0717686  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  65.87 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3982  30S ribosomal protein S13  67.2 
 
 		 127 aa  167  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0746926  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0740  ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 124 aa  167  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0703  30S ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  167  4e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  64.75 
 
 		 122 aa  167  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0957  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  167  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.787526  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3304  30S ribosomal protein S13  67.21 
 
 		 122 aa  167  7e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0001925 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  68.75 
 
 		 127 aa  166  8e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3642  30S ribosomal protein S13  68.75 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195969  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01420  ribosomal protein S13  65.57 
 
 		 122 aa  166  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000243035  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0338  ribosomal protein S13  66.39 
 
 		 121 aa  166  1e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 124 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 123 aa  164  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2834  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  163  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.161157  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0220  SSU ribosomal protein S13P  66.96 
 
 		 121 aa  163  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.953183 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 121 aa  163  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 123 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1370  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  160  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0625987  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01420  SSU ribosomal protein S13P  62.6 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.15354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2666  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  65.04 
 
 		 122 aa  160  5.0000000000000005e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 124 aa  159  8.000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0683  30S ribosomal protein S13  63.11 
 
 		 122 aa  160  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0866  ribosomal protein S13  64.57 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.336367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1639  ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 126 aa  159  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.43506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1742  30S ribosomal protein S13  63.93 
 
 		 122 aa  159  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0498579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2807  ribosomal protein S13  59.35 
 
 		 122 aa  158  2e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000334253  hitchhiker  0.00000000478637 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0590  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 126 aa  158  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.635023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1170  30S ribosomal protein S13  59.52 
 
 		 124 aa  158  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.716485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0869  30S ribosomal protein S13  59.84 
 
 		 122 aa  157  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000182214  hitchhiker  0.00600411 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  59.02 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1328  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  157  4e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.74324 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 126 aa  157  4e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0102  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158693 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0607  30S ribosomal protein S13  64.91 
 
 		 126 aa  157  6e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3426  30S ribosomal protein S13  62.3 
 
 		 122 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.968346  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0136  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000207382  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  64.55 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  155  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0961  ribosomal protein S13  57.48 
 
 		 126 aa  155  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0132  30S ribosomal protein S13  66.67 
 
 		 121 aa  155  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2988  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 125 aa  155  2e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.24286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0626  ribosomal protein S13  57.94 
 
 		 125 aa  154  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3672  30S ribosomal protein S13  57.38 
 
 		 122 aa  155  3e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_441  ribosomal protein S13  60.5 
 
 		 129 aa  154  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000306085  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  58.77 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1924  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 125 aa  154  4e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.38502  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3644  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.17106  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 122 aa  154  4e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2317  30S ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 122 aa  154  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.572032  normal  0.403503 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6586  ribosomal protein S13  59.82 
 
 		 126 aa  154  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.240951  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  58.87 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 123 aa  153  7e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0423  ribosomal protein S13  60.66 
 
 		 125 aa  153  7e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0135  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000332211  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0166  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000872047  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0129  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 121 aa  153  8e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000082296  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2234  30S ribosomal protein S13  62.71 
 
 		 122 aa  153  9e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0232268  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0156  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000111603  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0135  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000270668  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0130  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  5.1035300000000006e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0128  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000380498  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0135  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000525555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2752  30S ribosomal protein S13  58.54 
 
 		 123 aa  153  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3162  30S ribosomal protein S13  61.79 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.548712  normal  0.297498 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0148  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03785e-60 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1251  30S ribosomal protein S13  60.63 
 
 		 127 aa  152  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00631403  normal  0.17118 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2758  ribosomal protein S13  62.6 
 
 		 122 aa  152  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.221978 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5170  30S ribosomal protein S13  60.16 
 
 		 121 aa  152  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000106186  unclonable  6.58795e-26 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0476  30S ribosomal protein S13  59.66 
 
 		 129 aa  152  1e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000389275  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5763  30S ribosomal protein S13  57.14 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4776  ribosomal protein S13  61.48 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000216682 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  54.84 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4367  30S ribosomal protein S13  58.73 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.128251  normal  0.316218 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2688  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2373  30S ribosomal protein S13  60.98 
 
 		 121 aa  151  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.768244  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19740  SSU ribosomal protein S13P  57.72 
 
 		 123 aa  152  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00164832  normal  0.957321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>