43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0598 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0598  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 189 aa  384  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000122537  unclonable  0.00000659676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3900  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  89.36 
 
 		 189 aa  352  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000124121  normal  0.525075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2261  hypothetical protein  74.47 
 
 		 129 aa  83.2  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0193918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3560  hypothetical protein  74.47 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0320162  normal  0.177975 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1757  hypothetical protein  65 
 
 		 122 aa  80.9  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000128985  normal  0.255672 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2436  hypothetical protein  66.67 
 
 		 112 aa  79.7  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000881987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0369  hypothetical protein  49.4 
 
 		 106 aa  78.6  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000011297  normal  0.796638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2041  hypothetical protein  75 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.000112803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1946  hypothetical protein  67.35 
 
 		 105 aa  75.5  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0158676  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3160  hypothetical protein  68.75 
 
 		 144 aa  74.7  0.0000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000594814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2300  cold-shock DNA-binding domain-containing protein  42.22 
 
 		 197 aa  74.7  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000153423  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4753  hypothetical protein  62.75 
 
 		 97 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  9.86615e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1141  hypothetical protein  73.33 
 
 		 101 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000497055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0159  hypothetical protein  60.78 
 
 		 106 aa  72  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1830  hypothetical protein  73.33 
 
 		 98 aa  72  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000324096  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2926  hypothetical protein  62.5 
 
 		 52 aa  72  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0281  hypothetical protein  67.39 
 
 		 99 aa  71.6  0.000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.62891e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0613  hypothetical protein  68.18 
 
 		 51 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.2389  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1432  hypothetical protein  68.18 
 
 		 58 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.205478  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0627  hypothetical protein  68.18 
 
 		 51 aa  70.5  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.236913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2849  hypothetical protein  68.89 
 
 		 99 aa  70.1  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000349551  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_359  nucleoside diphosphate kinase  65.31 
 
 		 116 aa  69.3  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000000760928  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0762  hypothetical protein  65.91 
 
 		 51 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000292428  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0747  hypothetical protein  65.91 
 
 		 51 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0273409  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0078  hypothetical protein  58.49 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000380908  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0467  hypothetical protein  61.7 
 
 		 77 aa  69.3  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000182221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2013  hypothetical protein  62.5 
 
 		 98 aa  68.6  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.0000000000448055  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0416  hypothetical protein  65.91 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00356821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0442  hypothetical protein  73.17 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000619685  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2914  hypothetical protein  60.87 
 
 		 96 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000841625  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0395  hypothetical protein  63.64 
 
 		 116 aa  67.4  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000985967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3064  hypothetical protein  60.87 
 
 		 102 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000666653  decreased coverage  0.0000000585819 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32335  predicted protein  59.57 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00362382  normal  0.710049 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2057  hypothetical protein  58 
 
 		 67 aa  65.9  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.32922  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1296  hypothetical protein  56 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0998728  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1080  hypothetical protein  56 
 
 		 105 aa  66.2  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000189247  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0369  hypothetical protein  63.64 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000090387  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1108  hypothetical protein  54 
 
 		 106 aa  64.3  0.000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.019539  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0236  hypothetical protein  72.97 
 
 		 96 aa  63.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000525985  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2664  hypothetical protein  63.64 
 
 		 62 aa  63.5  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1068  hypothetical protein  57.45 
 
 		 51 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000000882951  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1256  hypothetical protein  57.45 
 
 		 51 aa  60.5  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000019657  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1209  hypothetical protein  52.83 
 
 		 151 aa  56.6  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.99637  normal  0.446055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>