10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6170 on replicon NC_007971
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007971  Rmet_6170    100 
 
 		 783 bp  1552    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000628127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6343    100 
 
 		 366 bp  73.8  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00153722  unclonable  0.000000047635 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2997  hypothetical protein  100 
 
 		 468 bp  73.8  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.520237 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3827  MobA/MobL protein  100 
 
 		 705 bp  73.8  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 468 bp  73.8  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.572298  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1204  RNA polymerase, sigma-24 subunit, ECF subfamily  100 
 
 		 405 bp  73.8  0.00000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4597    97.3 
 
 		 342 bp  65.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00627223  hitchhiker  0.00430609 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0084  streptomycin phosphotransferase B  100 
 
 		 783 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.707576 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1572  hypothetical protein  96.97 
 
 		 228 bp  58  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  100 
 
 		 1338 bp  54  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>