More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3210 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3210  dihydrodipicolinate reductase  100 
 
 		 269 aa  538  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3053  dihydrodipicolinate reductase  90.33 
 
 		 269 aa  497  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3680  dihydrodipicolinate reductase  56.27 
 
 		 267 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.17516  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2136  dihydrodipicolinate reductase  35.44 
 
 		 273 aa  139  3e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.337218  normal  0.177934 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08640  dihydrodipicolinate reductase  32.82 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3555  Dihydrodipicolinate reductase  36.26 
 
 		 275 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.526529  normal  0.518947 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3623  dihydrodipicolinate reductase  35.79 
 
 		 275 aa  138  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.295207 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0347  dihydrodipicolinate reductase  34.96 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1655  dihydrodipicolinate reductase  33.96 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0311  dihydrodipicolinate reductase  33.7 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0616212 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1909  dihydrodipicolinate reductase  34.43 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1256  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0330544  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1661  dihydrodipicolinate reductase  31.09 
 
 		 266 aa  130  3e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.414457  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0474  dihydrodipicolinate reductase  34.89 
 
 		 278 aa  129  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.760412  normal  0.0967493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3663  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 267 aa  130  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000998818  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1699  dihydrodipicolinate reductase  30.86 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.044918  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1680  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1698  dihydrodipicolinate reductase  34.8 
 
 		 275 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3169  dihydrodipicolinate reductase  32.95 
 
 		 266 aa  128  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.151717  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1458  dihydrodipicolinate reductase  29.81 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0186004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1442  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0101605  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1415  dihydrodipicolinate reductase  29.7 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000679486  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1555  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.769504  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0495  dihydrodipicolinate reductase  32.45 
 
 		 265 aa  126  3e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1027  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 251 aa  126  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1414  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0832957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1626  dihydrodipicolinate reductase  29.32 
 
 		 266 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.261081 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3757  dihydrodipicolinate reductase  29.81 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.970638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1588  dihydrodipicolinate reductase  29.81 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2124  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 266 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0763016  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07590  dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 255 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.736666  normal  0.996553 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1944  dihydrodipicolinate reductase  30.83 
 
 		 265 aa  122  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0616  dihydrodipicolinate reductase  29.89 
 
 		 259 aa  122  7e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2107  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826821  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0862  dihydrodipicolinate reductase  32.46 
 
 		 263 aa  121  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2153  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 245 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.214546 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1627  dihydrodipicolinate reductase  34.2 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.106572  hitchhiker  0.0000465979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2090  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.102525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4013  dihydrodipicolinate reductase  31.44 
 
 		 245 aa  119  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.944692  decreased coverage  0.00563446 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0952  dihydrodipicolinate reductase  31.85 
 
 		 251 aa  119  7e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0971  dihydrodipicolinate reductase  32.2 
 
 		 263 aa  117  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1063  dihydrodipicolinate reductase  33.57 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000472206  hitchhiker  0.00178207 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1273  dihydrodipicolinate reductase  30.97 
 
 		 266 aa  118  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.124784  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_844  dihydrodipicolinate reductase  31.56 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0379  dihydrodipicolinate reductase  30.85 
 
 		 282 aa  117  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14710  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1656  dihydrodipicolinate reductase  34.22 
 
 		 242 aa  115  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12786  dihydrodipicolinate reductase  31.82 
 
 		 245 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.506442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1468  Dihydrodipicolinate reductase  35.09 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0942  dihydrodipicolinate reductase  32.17 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0826  dihydrodipicolinate reductase  32.01 
 
 		 277 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0297  dihydrodipicolinate reductase  28.63 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.320787  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1896  dihydrodipicolinate reductase  28.63 
 
 		 239 aa  114  2.0000000000000002e-24  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10611  dihydrodipicolinate reductase  29.75 
 
 		 282 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0309689 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2374  dihydrodipicolinate reductase  31.44 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.049694 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10400  dihydrodipicolinate reductase  32.45 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0154197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1148  dihydrodipicolinate reductase  30.48 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13941  dihydrodipicolinate reductase  31.16 
 
 		 283 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.101233 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0968  dihydrodipicolinate reductase  31.39 
 
 		 282 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3321  dihydrodipicolinate reductase  33.07 
 
 		 246 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.240589  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0460  dihydrodipicolinate reductase  32.83 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5110  dihydrodipicolinate reductase  30.74 
 
 		 253 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188253  normal  0.135082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1070  dihydrodipicolinate reductase  32.7 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00416614 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1341  dihydrodipicolinate reductase  31.99 
 
 		 256 aa  109  5e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000215564 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2172  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 249 aa  109  6e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.178425  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10381  dihydrodipicolinate reductase  30.66 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09071  dihydrodipicolinate reductase  29.82 
 
 		 282 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3553  dihydrodipicolinate reductase  36.59 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.460519  normal  0.378798 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3058  dihydrodipicolinate reductase  31.06 
 
 		 248 aa  108  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1383  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10381  dihydrodipicolinate reductase  31.39 
 
 		 282 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0602305  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1829  dihydrodipicolinate reductase  31.29 
 
 		 277 aa  106  4e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2134  Dihydrodipicolinate reductase  31.75 
 
 		 245 aa  106  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.115039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1191  dihydrodipicolinate reductase  35.12 
 
 		 247 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0118297  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2472  dihydrodipicolinate reductase  31.97 
 
 		 247 aa  103  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.448881  normal  0.609009 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23350  dihydrodipicolinate reductase  36.95 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.821091  normal  0.0199255 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5821  dihydrodipicolinate reductase  32.28 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.908653  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3234  dihydrodipicolinate reductase  33.06 
 
 		 218 aa  102  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.802216  normal  0.68901 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0671  dihydrodipicolinate reductase  30.45 
 
 		 240 aa  102  9e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0645  dihydrodipicolinate reductase  31.6 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0786  dihydrodipicolinate reductase  32.3 
 
 		 246 aa  100  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773473  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1521  dihydrodipicolinate reductase  32.59 
 
 		 252 aa  100  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.97008  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0641  dihydrodipicolinate reductase  31.35 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.682115 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1756  dihydrodipicolinate reductase  30.54 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1506  dihydrodipicolinate reductase  33.46 
 
 		 252 aa  99.4  6e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.195551  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3951  dihydrodipicolinate reductase  33.83 
 
 		 268 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1219  dihydrodipicolinate reductase  31.16 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09351  dihydrodipicolinate reductase  28.78 
 
 		 283 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.029054  hitchhiker  0.000319573 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1448  dihydrodipicolinate reductase  33.7 
 
 		 252 aa  93.2  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.62245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7874  dihydrodipicolinate reductase  31.99 
 
 		 261 aa  92.8  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  0.122831 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3167  dihydrodipicolinate reductase  28.46 
 
 		 247 aa  92.4  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2227  dihydrodipicolinate reductase  33.33 
 
 		 252 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180899  normal  0.489753 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0131  dihydrodipicolinate reductase  26.89 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3648  dihydrodipicolinate reductase  30.5 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0775  dihydrodipicolinate reductase  27.31 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0146  dihydrodipicolinate reductase  26.89 
 
 		 243 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1450  dihydrodipicolinate reductase  31.34 
 
 		 256 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000298229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07120  dihydrodipicolinate reductase  35.53 
 
 		 263 aa  77  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.45507  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0825  dihydrodipicolinate reductase  27.42 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.742909  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0476  dihydrodipicolinate reductase  28.88 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>