34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2404 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007971  Rmet_6181  Tn6049 mobility protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.14752  normal  0.961677 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6334  protein involved in mobility of Tn6049  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000564545  hitchhiker  0.000732588 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0322  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.498296 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2001  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0792422 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2007  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.699687  normal  0.0916492 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2404  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000263432  decreased coverage  0.00000320816 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2553  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.273061  normal  0.545866 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2838  hypothetical protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3932  Tn6049 mobility protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.123254  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4425  Tn6049 mobility protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000754166  normal  0.287587 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5481  Tn6049 mobility protein  100 
 
 
189 aa  381  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.149189  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3143  hypothetical protein  100 
 
 
153 aa  311  3.9999999999999997e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0711  hypothetical protein  41.95 
 
 
192 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.149819 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1123  hypothetical protein  41.95 
 
 
192 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0131  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0100  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7261  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6583  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0521516 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6467  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00106702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5180  hypothetical protein  41.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7428  hypothetical protein  40.8 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.620538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2401  hypothetical protein  45.11 
 
 
182 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2033  hypothetical protein  45.11 
 
 
182 aa  106  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0330  hypothetical protein  44.36 
 
 
182 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.197697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0665  hypothetical protein  44.36 
 
 
182 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0505  hypothetical protein  44.36 
 
 
182 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0831  hypothetical protein  44.36 
 
 
182 aa  105  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2856  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2272  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2126  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1329  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000101397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1323  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0941  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0457  hypothetical protein  36.18 
 
 
157 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>