25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1637 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1637  hypothetical protein  100 
 
 		 105 aa  216  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.124371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3817  hypothetical protein  68.48 
 
 		 95 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6740  hypothetical protein  47.62 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.548647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3639  hypothetical protein  48.24 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4716  hypothetical protein  48.24 
 
 		 90 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00617114 
 
 
-
 
NC_003296  RS00884  hypothetical protein  44.79 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.832169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3818  hypothetical protein  45.35 
 
 		 93 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000402129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3559  hypothetical protein  48.24 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.828725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4040  hypothetical protein  48.24 
 
 		 91 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.274742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1879  hypothetical protein  48.24 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.297694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4435  hypothetical protein  44.44 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0775286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1090  hypothetical protein  42.7 
 
 		 187 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0172689  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0858  hypothetical protein  40.7 
 
 		 93 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.291528 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0943  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.625077  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0355  hypothetical protein  42.86 
 
 		 113 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1808  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0848605  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1398  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.111153  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1894  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0207  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0439  hypothetical protein  42.86 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3365  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.203946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4151  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0305018  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4215  hypothetical protein  46.51 
 
 		 92 aa  70.1  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.736535  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4999  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.457501  normal  0.0845037 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5404  hypothetical protein  41.18 
 
 		 115 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.979033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>