37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2866 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2866  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 117 aa  235  1e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4607  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 		 119 aa  66.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2919  DNA polymerase beta domain protein region  29.46 
 
 		 173 aa  56.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1643  DNA polymerase beta domain protein region  30.84 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5202  DNA polymerase beta domain protein region  35 
 
 		 152 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.430498 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0018  DNA polymerase beta domain protein region  35.24 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.21199  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4035  DNA polymerase beta domain protein region  38.71 
 
 		 113 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0524  DNA polymerase beta subunit  33.65 
 
 		 113 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0076  nucleotidyltransferase domain protein  45.1 
 
 		 110 aa  47  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.467951  normal  0.54284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0086  DNA polymerase beta subunit  36.11 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.109385  normal  0.256886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1725  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 111 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000013917  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4164  DNA polymerase beta domain protein region  29.09 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2432  DNA polymerase beta subunit  46.15 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.71469  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0399  DNA polymerase beta subunit  34.88 
 
 		 155 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  29.2 
 
 		 111 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2850  DNA polymerase beta domain protein region  27.1 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.787876  normal  0.338784 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  50 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2316  DNA polymerase beta domain protein region  31.76 
 
 		 155 aa  43.1  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.763015  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1221  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.110223  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5274  hypothetical protein  34.12 
 
 		 119 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1748  3'-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.193296  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0040  3'-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1714  3''-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0040  3''-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0203  DNA polymerase beta subunit  32.14 
 
 		 155 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2509  streptomycin 3''-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1344  Tn554, streptomycin 3''-adenylyltransferase  35 
 
 		 260 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.166071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0216  hypothetical protein  40.38 
 
 		 103 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0242312  hitchhiker  0.0000000000000575833 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0037  nucleotidyltransferase domain-containing protein  43.48 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0304  DNA polymerase beta subunit  48.65 
 
 		 116 aa  40.4  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3070  DNA polymerase, beta-like region  51.43 
 
 		 116 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.531751 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1550  DNA polymerase beta subunit  39.06 
 
 		 225 aa  40.4  0.008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0936126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0323  DNA polymerase beta subunit  45.95 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.103671  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  61.54 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1405  hypothetical protein  29.66 
 
 		 117 aa  40.4  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.11002 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1299  hypothetical protein  34.48 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.614992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1277  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 		 111 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>