77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2861 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2861  transposase  100 
 
 		 178 aa  354  2.9999999999999997e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1189  transposase, IS605 OrfB family  92.21 
 
 		 382 aa  254  4e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3330  Transport-associated OB domain protein  59.74 
 
 		 418 aa  172  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0133521  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3626  transposase, IS605 OrfB family  57.06 
 
 		 425 aa  171  5.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0681  transposase, IS605 OrfB family  55.83 
 
 		 427 aa  164  5.9999999999999996e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.146428  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2488  transposase, IS605 OrfB family  55.83 
 
 		 439 aa  164  6.9999999999999995e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.143837 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2779  transposase, IS605 OrfB family  55.83 
 
 		 412 aa  164  8e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.306797  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3539  transposase, IS605 OrfB family  50.98 
 
 		 375 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.3879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0563  transposase, IS605 OrfB family  50.98 
 
 		 375 aa  145  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.11437 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1200  transposase, IS605 OrfB family  51.63 
 
 		 374 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0919979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1116  transposase, IS605 OrfB family  51.63 
 
 		 374 aa  139  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.309085  normal  0.355527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1604  transposase, IS605 OrfB family  43.31 
 
 		 360 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2867  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1167  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000668854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0585  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0284  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000238986  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0234  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3136  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2654  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00128227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2358  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0658803  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2261  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2682  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0586461  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2228  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00238783  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2095  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1921  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1854  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00011315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1851  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000015791  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1768  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2274  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.118023  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1586  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000279316  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0162  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0171  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0456  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1753  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0530  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0632  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000767619  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1257  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000319001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1446  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.252161  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1577  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0615  transposase, IS605 OrfB family  42.68 
 
 		 360 aa  106  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.562099  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2240  transposase, IS605 OrfB family  42.04 
 
 		 360 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000297406  n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2881  transposase, IS605 OrfB family  39.26 
 
 		 388 aa  100  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2686  transposase  38.85 
 
 		 372 aa  90.1  1e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.442816  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7429  transposase  37.74 
 
 		 358 aa  79.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2065  transposase, IS1341 family  35.44 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0861  transposase, IS1341 family  33.54 
 
 		 404 aa  74.7  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4063  transposase, IS1341 family  31.1 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4652  transposase, IS1341 family  31.1 
 
 		 400 aa  72.8  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000354278 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2125  transposase, IS605 OrfB family  39.1 
 
 		 370 aa  70.9  0.000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00617237  decreased coverage  0.0000396034 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1833  IS605 family transposase OrfB  35.1 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.383909 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2493  transposase, IS605 OrfB family  29.41 
 
 		 401 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.904299 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1399  transposase, IS605 OrfB family  29.41 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2941  transposase, IS605 OrfB family  28.82 
 
 		 401 aa  69.3  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.644537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2211  transposase IS605  32.54 
 
 		 371 aa  68.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1161  transposase, IS605 OrfB family  34.55 
 
 		 372 aa  68.2  0.00000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1692  transposase  33.96 
 
 		 358 aa  65.1  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153302  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2198  transposase IS605  36.42 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0541  transposase, IS605 OrfB family  31.25 
 
 		 372 aa  62.4  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2561  transposase, IS605 OrfB family  27.71 
 
 		 440 aa  52  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.467488  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1086  transposase, IS605 OrfB family  28.32 
 
 		 434 aa  51.2  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0928  transposase, IS605 OrfB  26.97 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.621318  normal  0.596351 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3043  IS605 family transposase OrfB  26.97 
 
 		 450 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0563  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 372 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2346  transposase, IS605 OrfB family  31.93 
 
 		 401 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1250  transposase, IS605 OrfB family  28.57 
 
 		 372 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6879  IS605 family transposase OrfB  30.81 
 
 		 387 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.642554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2685  transposase, IS605 OrfB family  25.31 
 
 		 351 aa  45.1  0.0005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1428  transposase, IS605 OrfB family  29.05 
 
 		 385 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2840  transposase, IS605 OrfB family  25.31 
 
 		 351 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2621  transposase, IS605 OrfB family  27.22 
 
 		 412 aa  43.9  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2374  transposase, IS605 OrfB family  24.69 
 
 		 351 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1635  transposase, IS605 OrfB family  24.07 
 
 		 351 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3343  transposase, IS605 OrfB family  24.69 
 
 		 351 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2549  transposase, IS605 OrfB family  23.46 
 
 		 400 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4205  transposase, IS605 OrfB family  24.55 
 
 		 417 aa  41.6  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1982  transposase, IS605 OrfB family  24.69 
 
 		 351 aa  41.6  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2219  quinone oxidoreductase, YhdH/YhfP family  26.54 
 
 		 588 aa  41.2  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>