More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2856 on replicon NC_013502
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013502  Rmar_2856  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 1243 aa  2521    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.27 
 
 		 1156 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.61 
 
 		 607 aa  222  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.61 
 
 		 607 aa  222  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.61 
 
 		 607 aa  221  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.9 
 
 		 603 aa  221  8.999999999999998e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00344  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.35 
 
 		 625 aa  220  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.25 
 
 		 607 aa  220  1e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2576  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 620 aa  219  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0400145  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.06 
 
 		 607 aa  218  4e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.55 
 
 		 615 aa  218  4e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.57 
 
 		 599 aa  218  5e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 		 611 aa  218  5.9999999999999996e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.53 
 
 		 793 aa  218  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.34 
 
 		 626 aa  217  9.999999999999999e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0333  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.89 
 
 		 607 aa  217  9.999999999999999e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.510755  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.57 
 
 		 599 aa  216  1.9999999999999998e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.59 
 
 		 601 aa  215  3.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3474  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.48 
 
 		 610 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3974  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.77 
 
 		 609 aa  215  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.172016  normal  0.841537 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  38.05 
 
 		 621 aa  214  5.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0383  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 607 aa  214  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0224  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.9 
 
 		 611 aa  213  1e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0469  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.92 
 
 		 607 aa  214  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0409  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 607 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000268253 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 607 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0391  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.46 
 
 		 607 aa  213  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000840098 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 613 aa  213  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.32 
 
 		 594 aa  213  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.09 
 
 		 602 aa  213  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0395  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 		 607 aa  213  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000632462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4552  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.96 
 
 		 608 aa  213  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00645821 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.94 
 
 		 602 aa  212  3e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  36.97 
 
 		 611 aa  212  4e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  36.97 
 
 		 609 aa  212  4e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 		 707 aa  212  4e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 		 615 aa  211  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.59 
 
 		 596 aa  211  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.97 
 
 		 611 aa  211  9e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 611 aa  211  9e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 609 aa  211  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 609 aa  211  9e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 609 aa  210  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.97 
 
 		 611 aa  210  1e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.64 
 
 		 563 aa  210  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.52 
 
 		 615 aa  209  2e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 609 aa  209  3e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.7 
 
 		 705 aa  208  5e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4285  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 615 aa  207  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.362747 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35 
 
 		 602 aa  207  8e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 		 705 aa  207  9e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.6 
 
 		 705 aa  207  9e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.5 
 
 		 606 aa  207  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 615 aa  207  1e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  37.33 
 
 		 705 aa  206  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4187  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 615 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4345  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.27 
 
 		 615 aa  206  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 705 aa  206  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  37.33 
 
 		 705 aa  205  3e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.41 
 
 		 607 aa  205  4e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.93 
 
 		 599 aa  205  5e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 705 aa  205  6e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.33 
 
 		 705 aa  205  6e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.55 
 
 		 608 aa  204  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1991  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.8 
 
 		 593 aa  204  7e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.29 
 
 		 608 aa  203  9.999999999999999e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.42 
 
 		 1376 aa  203  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.07 
 
 		 724 aa  202  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  35.56 
 
 		 597 aa  202  3e-50  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2466  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.07 
 
 		 705 aa  202  3e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.425923  normal  0.631246 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0137  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.01 
 
 		 631 aa  202  3.9999999999999996e-50  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.837204  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.07 
 
 		 721 aa  202  3.9999999999999996e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.68 
 
 		 665 aa  201  5e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  35.56 
 
 		 654 aa  201  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.94 
 
 		 779 aa  201  7.999999999999999e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2826  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.07 
 
 		 705 aa  201  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1951  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.55 
 
 		 729 aa  200  1.0000000000000001e-49  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.68 
 
 		 592 aa  201  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1165  hypothetical protein  33.25 
 
 		 724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.402826 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.25 
 
 		 708 aa  200  2.0000000000000003e-49  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.63 
 
 		 706 aa  200  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.73 
 
 		 614 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.486098  normal  0.649708 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.31 
 
 		 658 aa  200  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.93 
 
 		 593 aa  199  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.07 
 
 		 728 aa  199  4.0000000000000005e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.93 
 
 		 593 aa  199  4.0000000000000005e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.87 
 
 		 662 aa  199  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.4 
 
 		 662 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3877  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.27 
 
 		 717 aa  198  6e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  33.51 
 
 		 493 aa  198  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4296  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 715 aa  198  7e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0839194  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.15 
 
 		 646 aa  197  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 662 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.17 
 
 		 659 aa  197  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1065  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.42 
 
 		 709 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.42 
 
 		 681 aa  197  1e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1036  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.42 
 
 		 709 aa  197  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 		 662 aa  196  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  34.5 
 
 		 615 aa  196  2e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.31 
 
 		 658 aa  196  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.171649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>