60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2302 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2302  5-keto 4-deoxyuronate isomerase-like protein  100 
 
 		 285 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.929628  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0119  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomer ase  23.9 
 
 		 278 aa  63.5  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0646  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  27.32 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000177298  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2384  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26.47 
 
 		 276 aa  62.8  0.000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6827  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0670  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol- isomerase  22.22 
 
 		 276 aa  56.6  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.208996  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0643  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  28.9 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2539  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  26.36 
 
 		 283 aa  55.8  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3915  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.49 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.809964  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0399  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26.44 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02654  hypothetical protein  27.92 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02691  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.92 
 
 		 278 aa  54.7  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.86 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4107  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.49 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1910  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  21.26 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000905199  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4112  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.41 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000651475 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2990  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.41 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.163  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0872  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.41 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0847  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronate ketol-isomerase  27.41 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3165  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.41 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2991  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.41 
 
 		 278 aa  53.1  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.050045 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0395  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.86 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3017  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.18 
 
 		 274 aa  52.4  0.000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6603  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00127323 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3894  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  34.15 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.787438  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0995  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  27.8 
 
 		 285 aa  50.4  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1757  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.5 
 
 		 283 aa  50.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0391  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.86 
 
 		 276 aa  50.1  0.00004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2738  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.48 
 
 		 276 aa  50.4  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171059  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2203  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  20.87 
 
 		 278 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.128768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2642  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.27 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.198375 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1804  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.27 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0956788  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5662  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.12 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.425748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1694  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  27.27 
 
 		 278 aa  50.1  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.730903  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2839  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  20.72 
 
 		 276 aa  49.7  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604596  normal  0.144576 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2600  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.45 
 
 		 289 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.161713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4264  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.25 
 
 		 279 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.968678  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3403  4-deoxy-L-threo-5-hexosulose-uronateketol- isomerase  22.32 
 
 		 286 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0682424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0197  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.48 
 
 		 279 aa  48.9  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.500456  normal  0.130457 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3296  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.89 
 
 		 278 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.578239  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4744  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  26.29 
 
 		 281 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00116126 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3169  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.87 
 
 		 278 aa  47  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2944  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.38 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.842443 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3234  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.87 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00037687 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0950  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  21.71 
 
 		 280 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.73185  hitchhiker  0.0000165673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1280  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.87 
 
 		 276 aa  46.6  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000000000894745  normal  0.234685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3249  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.87 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3350  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.87 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.40902 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3186  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.87 
 
 		 278 aa  46.6  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.659097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0482  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.7 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2134  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  23.7 
 
 		 274 aa  46.2  0.0006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4263  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  25.12 
 
 		 274 aa  45.8  0.0008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0938  myo-inositol catabolism IolB region  25.69 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.197949  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1420  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  25.69 
 
 		 272 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2031  5-keto-4-deoxyuronate isomerase  24.62 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0416  iolB protein  27.81 
 
 		 280 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4564  myo-inositol catabolism IolB region  26.09 
 
 		 271 aa  43.1  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0796544  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1343  Myo-inositol catabolism IolB domain protein  23.78 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.185473  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1398  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.7 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.696969 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1339  myo-inositol catabolism IolB domain-containing protein  24.7 
 
 		 272 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>