14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1130 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1130  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.585084  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3104  sulfotransferase  29.24 
 
 
368 aa  85.5  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3813  ABC transporter related  32.37 
 
 
711 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.396147  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3578  hypothetical protein  31.07 
 
 
237 aa  84.7  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.584308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1720  sulfotransferase  30.51 
 
 
289 aa  82.8  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.192631  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1735  sulfotransferase  28.67 
 
 
289 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.857227 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3105  sulfotransferase  29.05 
 
 
388 aa  76.6  0.0000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3812  sulfotransferase  26.51 
 
 
244 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.946328  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0691  sulfotransferase  30.66 
 
 
269 aa  58.9  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18660  sulfotransferase family protein  45.61 
 
 
281 aa  57.4  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3528  hypothetical protein  24.65 
 
 
269 aa  53.9  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.753643  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3108  sulfotransferase  45.28 
 
 
370 aa  51.2  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0208  hypothetical protein  23.87 
 
 
119 aa  47  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.237856 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0854  sulfotransferase  21.92 
 
 
299 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>