43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1014 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_1014  DNA binding domain protein, excisionase family  100 
 
 
64 aa  123  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.174874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0484  DNA binding domain-containing protein  39.62 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.111356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8339  excision promoter, Xis  40 
 
 
74 aa  49.7  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1943  hypothetical protein  45 
 
 
65 aa  49.3  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.605997  normal  0.11028 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0912  DNA binding domain protein, excisionase family  46.15 
 
 
78 aa  48.5  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0537  hypothetical protein  40.38 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5007  DNA binding domain protein, excisionase family  39.62 
 
 
67 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0520811  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4450  DNA binding domain protein, excisionase family  40.38 
 
 
67 aa  47  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4589  DNA binding domain protein, excisionase family  42.31 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0682  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160899  normal  0.175021 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0838  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.38625  normal  0.385284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0662  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.87984 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0074  DNA binding domain-containing protein  37.04 
 
 
90 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2705  excisionase/Xis, DNA-binding  38.46 
 
 
77 aa  46.2  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.34571  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0669  excisionase/Xis, DNA-binding protein  37.04 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.873991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0251  excisionase family DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.23187  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0244  DNA binding domain-containing protein  42.31 
 
 
85 aa  45.4  0.0002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  decreased coverage  0.00265398  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0612  phage transcriptional regulator, AlpA  38.46 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.274045  normal  0.0916726 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0661  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10510  hypothetical protein  35.19 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1004  DNA binding domain protein, excisionase family  35.85 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0413  DNA binding domain-containing protein  38.46 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00229992 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0201  DNA binding domain-containing protein  35.19 
 
 
305 aa  42.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01990  DNA-binding protein, excisionase family  37.1 
 
 
315 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000725149  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02760  DNA-binding protein, excisionase family  34.62 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0246  putative molybdopterin biosynthesis protein  35.19 
 
 
306 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0222  putative molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 
306 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0204  molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 
306 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0190  molybdate-binding protein  33.33 
 
 
315 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0223  molybdopterin biosynthesis protein, putative  35.19 
 
 
315 aa  42  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0194  molybdate-binding protein  35.19 
 
 
315 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0205  molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 
306 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1237  putative transcriptional regulator  37.74 
 
 
74 aa  41.6  0.003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6742  DNA binding domain protein, excisionase family  37.25 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0061  DNA binding domain protein, excisionase family  52.17 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3301  phage transcriptional regulator, AlpA  35.29 
 
 
84 aa  41.6  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3099  excision promoter, Xis  35.29 
 
 
70 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2744  DNA binding domain protein, excisionase family  38.33 
 
 
78 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.587836  hitchhiker  0.00613887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0229  putative molybdopterin biosynthesis protein  31.48 
 
 
306 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2088  phage transcriptional regulator, AlpA  38.6 
 
 
65 aa  40.4  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0343  DNA binding domain-containing protein  35.09 
 
 
69 aa  40.4  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.683411  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5098  periplasmic molybdate-binding protein  31.48 
 
 
306 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3952  DNA binding domain-containing protein  34.69 
 
 
317 aa  40.4  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.581977  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>