55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6662 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6662  protein of unknown function DUF1206  100 
 
 
295 aa  583  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00899754 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5742  protein of unknown function DUF1206  61.94 
 
 
273 aa  314  9e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2313  protein of unknown function DUF1206  42.16 
 
 
283 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357658  normal  0.179664 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2038  hypothetical protein  41.79 
 
 
283 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1999  protein of unknown function DUF1206  40.6 
 
 
283 aa  158  8e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.246852  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0539  hypothetical protein  38.78 
 
 
283 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1591  protein of unknown function DUF1206  40 
 
 
284 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3834  protein of unknown function DUF1206  37.84 
 
 
284 aa  131  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.39439  normal  0.124542 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3969  protein of unknown function DUF1206  35.4 
 
 
272 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2471  hypothetical protein  33.2 
 
 
277 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0974762  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0683  hypothetical protein  38.04 
 
 
294 aa  122  6e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.110823  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5191  hypothetical protein  36.65 
 
 
269 aa  119  6e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.512035  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1812  hypothetical protein  40.6 
 
 
283 aa  117  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00564055 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1709  protein of unknown function DUF1206  31.85 
 
 
289 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000926359  normal  0.0545957 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1671  protein of unknown function DUF1206  35.58 
 
 
278 aa  112  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1983  hypothetical protein  31.8 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.322506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2029  hypothetical protein  31.8 
 
 
284 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0458377  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1963  hypothetical protein  31.8 
 
 
286 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.423067  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2723  hypothetical protein  30.3 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2236  hypothetical protein  33.46 
 
 
278 aa  106  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.514357  normal  0.546802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3823  protein of unknown function DUF1206  36.68 
 
 
281 aa  106  5e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.603923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3147  protein of unknown function DUF1206  32.6 
 
 
270 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0781732  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5287  hypothetical protein  32.54 
 
 
280 aa  104  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0255037  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29580  protein of unknown function (DUF1206)  33.07 
 
 
281 aa  104  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4559  protein of unknown function DUF1206  33.46 
 
 
283 aa  103  4e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.613819  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5830  hypothetical protein  29.81 
 
 
264 aa  102  7e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04045  hypothetical protein  30.45 
 
 
267 aa  100  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3704  hypothetical protein  33.84 
 
 
288 aa  99  9e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.529135  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2300  hypothetical protein  32.58 
 
 
272 aa  97.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4141  hypothetical protein  30.8 
 
 
282 aa  95.5  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0424  hypothetical protein  35.88 
 
 
279 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449204  hitchhiker  0.00637263 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4644  protein of unknown function DUF1206  33.2 
 
 
264 aa  92.4  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.810903  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2420  hypothetical protein  32.28 
 
 
278 aa  90.5  3e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.884647  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0199  hypothetical protein  31.6 
 
 
276 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3785  hypothetical protein  27.44 
 
 
296 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2650  protein of unknown function DUF1206  29.7 
 
 
269 aa  77  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2809  protein of unknown function DUF1206  24.81 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00372728 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1765  protein of unknown function DUF1206  29.7 
 
 
274 aa  75.9  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000356487 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3108  hypothetical protein  25.66 
 
 
275 aa  75.1  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1176  hypothetical protein  30.08 
 
 
257 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25465  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0210  hypothetical protein  31.2 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.461264  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0219  hypothetical protein  31.2 
 
 
276 aa  72.8  0.000000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.369564  normal  0.923449 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3010  hypothetical protein  29.72 
 
 
327 aa  72.4  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10228  hypothetical protein  26.77 
 
 
258 aa  72.4  0.000000000009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3507  protein of unknown function DUF1206  29.1 
 
 
282 aa  72  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2200  hypothetical protein  30.48 
 
 
280 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  0.303929 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3824  protein of unknown function DUF1206  31.37 
 
 
288 aa  70.5  0.00000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6964  protein of unknown function DUF1206  28.63 
 
 
247 aa  69.7  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2673  protein of unknown function DUF1206  29.13 
 
 
279 aa  66.6  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1905  hypothetical protein  33.73 
 
 
284 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.024613 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0822  protein of unknown function DUF1206  27.1 
 
 
287 aa  63.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2124  hypothetical protein  26.25 
 
 
263 aa  58.9  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.481773  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2160  protein of unknown function DUF1206  34.78 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35130  protein of unknown function (DUF1206)  33.47 
 
 
252 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3412  protein of unknown function DUF1206  34.69 
 
 
269 aa  49.7  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.167588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>