More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6645 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6645  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
377 aa  769    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.548908  normal  0.064075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5692  putative amidase expression-regulating protein  97.61 
 
 
377 aa  755    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0892365  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4419  putative amidase expression-regulating protein  65.5 
 
 
384 aa  497  1e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2996  putative amidase expression-regulating protein  57.84 
 
 
391 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1305  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.99 
 
 
397 aa  443  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.614657  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5905  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  55.59 
 
 
391 aa  433  1e-120  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.607996  normal  0.0988317 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0049  putative amidase expression-regulating protein  50.68 
 
 
380 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1951  putative aliphatic amidase expression-regulating protein (amiC)  45.36 
 
 
388 aa  349  5e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1846  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  47.41 
 
 
380 aa  341  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.280778 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3638  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.69 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.13399  normal  0.0727576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4902  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  44.96 
 
 
405 aa  330  2e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0462  chain B, amide receptor of the amidase operon (Amic)  43.97 
 
 
388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.564198 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2143  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  42.93 
 
 
385 aa  322  8e-87  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5753  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  43.58 
 
 
384 aa  318  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.887831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2778  urea ABC transporter, urea binding protein  41.16 
 
 
418 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2206  regulatory protein, putative  40.05 
 
 
382 aa  302  5.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.137264  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2419  regulatory protein, putative  39.89 
 
 
382 aa  299  5e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.816344  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4596  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  44.96 
 
 
372 aa  298  7e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1823  extracellular ligand-binding receptor  40.28 
 
 
419 aa  296  3e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.158541  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0803  ABC branched chain amino acid family transporter, periplasmic ligand binding protein  40.44 
 
 
388 aa  295  7e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.123562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20580  aliphatic amidase expression-regulating protein  40 
 
 
385 aa  293  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0172164  normal  0.861433 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1766  aliphatic amidase expression-regulating protein  40.27 
 
 
385 aa  290  4e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2205  extracellular ligand-binding receptor  41.55 
 
 
393 aa  287  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.327939  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2418  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  41.27 
 
 
393 aa  285  9e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2661  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, AmiC  40.7 
 
 
385 aa  277  2e-73  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.547475  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2862  urea ABC transporter, urea binding protein  41 
 
 
443 aa  275  8e-73  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1674  urea ABC transporter, urea binding protein  39.56 
 
 
407 aa  270  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0130  extracellular ligand-binding receptor  40.22 
 
 
423 aa  271  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0243473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3240  urea ABC transporter, urea binding protein  38.33 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00360419  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3498  urea ABC transporter, urea binding protein  39.17 
 
 
419 aa  267  2e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0969064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1289  putative substrate-binding component of ABC transporter  36.86 
 
 
436 aa  263  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1506  putative substrate-binding component of ABC transporter  37.4 
 
 
436 aa  261  1e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2338  extracellular ligand-binding receptor  37.12 
 
 
421 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2291  extracellular ligand-binding receptor  37.12 
 
 
421 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.553297  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4910  extracellular ligand-binding receptor  37.99 
 
 
397 aa  261  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.618157  normal  0.278899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3022  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, AmiC  39.68 
 
 
384 aa  260  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.486671 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3780  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  36.39 
 
 
404 aa  259  7e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.583472  hitchhiker  0.00053565 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1662  ABC transporter, periplasmic binding protein, putative  38.55 
 
 
428 aa  258  1e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5281  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  39.78 
 
 
425 aa  258  1e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0700  urea ABC transporter, urea binding protein  38.06 
 
 
463 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0172324  hitchhiker  0.0000000649369 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3881  putative aliphatic amidase expression-regulating protein  37.03 
 
 
411 aa  257  2e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3798  extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 
402 aa  257  2e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2596  extracellular ligand-binding receptor  35.79 
 
 
402 aa  256  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.677611 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1139  urea ABC transporter, urea binding protein  36.86 
 
 
413 aa  256  4e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2330  extracellular ligand-binding receptor  36.01 
 
 
421 aa  256  7e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26288  normal  0.0264278 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3324  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, AmiC  39.68 
 
 
402 aa  255  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1687  extracellular ligand-binding receptor  37.91 
 
 
413 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1200  urea ABC transporter, urea binding protein  36.59 
 
 
413 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.12535 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1360  urea ABC transporter, urea binding protein  36.59 
 
 
413 aa  253  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.396806  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4361  extracellular ligand-binding receptor  37.5 
 
 
438 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000367621  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3200  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, amiC  37.53 
 
 
386 aa  253  5.000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0701  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  37.1 
 
 
421 aa  250  3e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.525993  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6186  urea ABC transporter, urea binding protein  38.15 
 
 
410 aa  249  4e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.411723  normal  0.830735 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0593  urea ABC transporter, urea binding protein  36.78 
 
 
418 aa  249  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0692994 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5512  ABC transporter substrate-binding protein  37.6 
 
 
422 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.115941  normal  0.320522 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3867  extracellular ligand-binding receptor  37.02 
 
 
421 aa  246  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0654  branched chain amino-acid ABC transporter substrate-binding protein  36.14 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.379667 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0810  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 
840 aa  243  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643579  normal  0.828908 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4295  putative aliphatic amidase expression-regulating protein, AmiC  37.87 
 
 
388 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0107993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64270  hypothetical protein  36.02 
 
 
421 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00916173  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5668  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.6 
 
 
424 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.851164  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5579  hypothetical protein  35.75 
 
 
421 aa  241  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3732  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.6 
 
 
424 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4636  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  37.6 
 
 
424 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0220  urea ABC transporter, urea binding protein  36.24 
 
 
421 aa  239  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.618006  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2260  urea ABC transporter, urea binding protein  36.74 
 
 
440 aa  240  4e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3572  ABC transporter substrate-binding protein  36.24 
 
 
422 aa  239  4e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.536665  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3211  twin-arginine translocation pathway signal  34.85 
 
 
420 aa  239  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.35137  normal  0.840301 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3864  amide-urea binding protein  35.6 
 
 
420 aa  239  5e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601855  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3381  ABC transporter substrate-binding protein  36.04 
 
 
417 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3690  urea ABC transporter, urea binding protein  36.04 
 
 
417 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0564  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  36.14 
 
 
420 aa  239  5.999999999999999e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1252  amide-urea binding protein  35.33 
 
 
392 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0854371  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2161  urea ABC transporter, urea binding protein  36.02 
 
 
422 aa  239  9e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.269161  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0976  urea ABC transporter, urea binding protein  35.42 
 
 
426 aa  238  9e-62  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3587  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.69 
 
 
418 aa  238  9e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3145  urea ABC transporter, urea binding protein  36.31 
 
 
422 aa  238  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0952  twin-arginine translocation pathway signal  34.77 
 
 
419 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.553309  normal  0.40345 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2500  urea ABC transporter, urea binding protein  36.02 
 
 
422 aa  238  2e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.172849  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1084  urea ABC transporter, urea binding protein  35.81 
 
 
425 aa  236  3e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1443  twin-arginine translocation pathway signal  34.85 
 
 
420 aa  236  4e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0590  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.83 
 
 
421 aa  236  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3931  urea ABC transporter, urea binding protein  36.19 
 
 
417 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.606906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1443  urea ABC transporter, urea binding protein  35.33 
 
 
420 aa  236  4e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3500  twin-arginine translocation pathway signal  33.78 
 
 
420 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1255  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic protein  34.77 
 
 
445 aa  236  5.0000000000000005e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.857524 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1421  putative substrate-binding periplasmic transport protein  35.48 
 
 
422 aa  236  6e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3112  urea ABC transporter, urea binding protein  38.78 
 
 
416 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1393  twin-arginine translocation pathway signal  33.33 
 
 
428 aa  236  6e-61  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.656328  normal  0.386042 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4078  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.69 
 
 
414 aa  236  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.749846  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0997  twin-arginine translocation pathway signal  33.24 
 
 
427 aa  235  7e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4426  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein  35.22 
 
 
421 aa  235  8e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.171999 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0994  branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  35.66 
 
 
454 aa  235  9e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.603537  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1711  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  36.41 
 
 
421 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0299695  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4719  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  35.29 
 
 
421 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.14369  normal  0.0383938 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4012  urea ABC transporter, urea binding protein  33.6 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3381  twin-arginine translocation pathway signal  33.87 
 
 
419 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4841  branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic amino acid-binding protein, putative  35.29 
 
 
421 aa  234  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.365474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4898  urea ABC transporter, urea binding protein  35.29 
 
 
421 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0308389 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2746  urea ABC transporter, urea binding protein  35.22 
 
 
423 aa  233  3e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276837  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>