More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5677 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5677  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
391 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.673582  normal  0.0997985 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5143  transcriptional regulator LacI family  51.2 
 
 
343 aa  359  4e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423786  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  30.21 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3542  transcriptional regulator, LacI family  29.61 
 
 
335 aa  195  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  34.73 
 
 
342 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2074  transcriptional regulator, LacI family  30.51 
 
 
338 aa  192  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  35.21 
 
 
348 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  30.3 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.34 
 
 
352 aa  175  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 
342 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 
340 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  33.03 
 
 
332 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.63 
 
 
341 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.61 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 
336 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3423  transcriptional regulator, LacI family  33.82 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0558625 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.72 
 
 
330 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11530  transcriptional regulator, LacI family  31.74 
 
 
331 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809623 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  28.61 
 
 
341 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  31.1 
 
 
337 aa  160  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  28.66 
 
 
331 aa  160  4e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2609  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.96 
 
 
342 aa  160  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  29.73 
 
 
341 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  31.85 
 
 
347 aa  159  9e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  31.33 
 
 
347 aa  159  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  32.83 
 
 
334 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.4 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  28.4 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  28.4 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.4 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  28.4 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.4 
 
 
341 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3220  ribose operon repressor  32.5 
 
 
336 aa  158  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.396432  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.1 
 
 
342 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.4 
 
 
343 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.4 
 
 
343 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0008  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 
337 aa  157  2e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3283  LacI family transcription regulator  34.69 
 
 
338 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  31.1 
 
 
342 aa  157  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.64 
 
 
336 aa  157  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  30.18 
 
 
337 aa  157  4e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4790  DNA-binding transcriptional regulator CytR  30.09 
 
 
342 aa  157  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120208 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  29.9 
 
 
352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1019  LacI family transcription regulator  31.09 
 
 
340 aa  156  8e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.76 
 
 
336 aa  155  9e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  32.26 
 
 
346 aa  155  9e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  32.42 
 
 
343 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  28.83 
 
 
330 aa  155  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  31.94 
 
 
346 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00429  transcriptional repressor, LacI family protein  31.44 
 
 
334 aa  153  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1181  alanine racemase  30.24 
 
 
334 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0331058  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1214  LacI family transcription regulator  30.24 
 
 
334 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.692885  normal  0.113089 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3176  transcriptional regulator, LacI family  30.24 
 
 
334 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.143935  normal  0.494014 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0072  transcriptional regulator LacI family  34.41 
 
 
343 aa  153  5e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2691  LacI family transcription regulator  29.48 
 
 
335 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0345  transcriptional regulator for D-ribose, periplasmic binding protein, LacI family protein  29.13 
 
 
334 aa  152  7e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  28.66 
 
 
334 aa  152  7e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1129  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.24 
 
 
334 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  32.83 
 
 
346 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  31.21 
 
 
343 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  33.23 
 
 
353 aa  152  8e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  31.82 
 
 
343 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  29 
 
 
341 aa  152  1e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  31.82 
 
 
343 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  30.03 
 
 
352 aa  152  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04322  transcriptional regulator LacI family  30.75 
 
 
355 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  29.43 
 
 
334 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  26.2 
 
 
332 aa  151  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  31.52 
 
 
343 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 
343 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  32.12 
 
 
343 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 
356 aa  151  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0007  transcriptional regulator, LacI family  30.86 
 
 
337 aa  151  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5702  transcriptional regulator, LacI family  27.14 
 
 
343 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111509  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  31.5 
 
 
346 aa  150  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  27.65 
 
 
333 aa  150  3e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.43 
 
 
335 aa  150  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  31.52 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  31.52 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  31.52 
 
 
343 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  33.79 
 
 
348 aa  150  5e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  31.53 
 
 
333 aa  150  5e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1482  transcriptional regulator, LacI family  28.95 
 
 
337 aa  149  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  33.54 
 
 
326 aa  149  7e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  29.68 
 
 
334 aa  149  7e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  27.76 
 
 
334 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1400  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  31.27 
 
 
332 aa  149  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.665266  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5109  LacI family transcription regulator  31.8 
 
 
330 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187279  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0343  transcriptional regulator, LacI family  32.22 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  30.33 
 
 
332 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  28.45 
 
 
339 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0274  alanine racemase  32.25 
 
 
340 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  30.09 
 
 
334 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1367  ribose operon repressor  29.64 
 
 
333 aa  147  3e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.390962  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>