18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0384 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0384  putative succinoglycan biosynthesis transport protein  100 
 
 		 590 aa  1140    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0352  putative succinoglycan biosynthesis transport protein  78.58 
 
 		 601 aa  807    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570325  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  28.61 
 
 		 595 aa  84  0.000000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  26.01 
 
 		 764 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 548 aa  68.2  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 		 537 aa  67.8  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  27.49 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  27.49 
 
 		 572 aa  66.6  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.19 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 696 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.31 
 
 		 491 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.93 
 
 		 491 aa  48.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  29.65 
 
 		 738 aa  46.6  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05204  exopolysaccharide biosynthesis protein  21.94 
 
 		 731 aa  45.8  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  24.8 
 
 		 461 aa  45.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2815  lipopolysaccharide biosynthesis  25.67 
 
 		 770 aa  45.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.84 
 
 		 710 aa  44.7  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.55 
 
 		 509 aa  44.7  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>