More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6101 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6101  ABC transporter related  100 
 
 
239 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.840532  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3291  hypothetical protein  43.4 
 
 
237 aa  184  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0999  ABC transporter related  40.76 
 
 
246 aa  180  1e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0800  ABC transporter related  39.83 
 
 
238 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.595603 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  40.85 
 
 
235 aa  177  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0788  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 
238 aa  176  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1726  ABC transporter related  39.24 
 
 
237 aa  176  2e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.972485  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0799  ABC transporter related  46.26 
 
 
240 aa  176  3e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23010  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  42.86 
 
 
255 aa  176  4e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.409418  normal  0.0665453 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0838  ABC transporter related  42.06 
 
 
239 aa  176  4e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1444  ABC transporter related  39.66 
 
 
237 aa  176  4e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4073  ABC transporter related  40.85 
 
 
243 aa  175  5e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.131918 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5343  ABC transporter related  40.6 
 
 
235 aa  174  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.163228  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1865  ABC transporter related  41.6 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0882  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  unclonable  0.000000000000026853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1146  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.98 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  decreased coverage  0.000313887  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0356  ABC transporter related  42.13 
 
 
240 aa  173  1.9999999999999998e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4257  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  41.2 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.309186  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0992  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00134652  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0986  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.0000000350992  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0266  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  unclonable  0.0000000214299  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2185  ABC transporter related protein  40.08 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0943  hydrophobic amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.98 
 
 
238 aa  173  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00876691  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2432  ABC transporter related protein  36.05 
 
 
237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198447  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1970  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 
234 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000000796203  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4391  ABC transporter-related protein  41.2 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4412  ABC transporter related  41.2 
 
 
238 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4412  ABC transporter related  41.2 
 
 
238 aa  172  5e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.376021  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1776  ABC transporter related  41.2 
 
 
244 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.372719 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3555  ABC transporter related  40.77 
 
 
232 aa  172  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.651056  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4379  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
240 aa  171  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.957322  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2552  ABC transporter-related protein  41.88 
 
 
237 aa  171  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2042  ABC transporter related  39.66 
 
 
247 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000858552 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5826  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  38.56 
 
 
238 aa  171  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.455686  normal  0.134982 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5682  ABC transporter related  42.49 
 
 
258 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2756  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  41.2 
 
 
234 aa  170  1e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.211076  normal  0.384438 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6115  ABC transporter related  38.98 
 
 
238 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2412  ABC transporter related  38.98 
 
 
238 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0329519 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1724  ABC transporter related  38.63 
 
 
235 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1393  ABC transporter related protein  41.03 
 
 
236 aa  170  2e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1859  ABC transporter related  38.98 
 
 
238 aa  170  2e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3532  ABC transporter related  38.2 
 
 
236 aa  169  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.10442  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0565  ABC transporter related  41.9 
 
 
238 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2310  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
237 aa  169  3e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2541  ABC transporter related  38.56 
 
 
238 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2437  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  38.63 
 
 
244 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.313666  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3684  ABC transporter related  41.2 
 
 
246 aa  169  5e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.218691  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1895  branched-chain amino acid ABC transporter ATPase  37.77 
 
 
234 aa  169  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.250393  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0473  ABC transporter-like  38.2 
 
 
260 aa  168  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.492847  normal  0.175391 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0592  ABC transporter related  38.2 
 
 
238 aa  168  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.479264  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2519  ABC transporter related  38.14 
 
 
238 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.644805  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0262  ATPase  39.91 
 
 
238 aa  168  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2494  ABC transporter related  38.14 
 
 
238 aa  168  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0796  ABC transporter related  41.18 
 
 
236 aa  168  7e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.787877  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3770  ABC transporter related protein  39.08 
 
 
237 aa  168  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.160524  normal  0.0116376 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5535  ABC transporter related  39.06 
 
 
234 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1730  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 
247 aa  168  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6415  ABC transporter related  38.4 
 
 
237 aa  167  9e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.581107  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1883  ABC transporter related  38.14 
 
 
238 aa  167  9e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2705  ABC transporter related  38.2 
 
 
238 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.663286  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3725  ABC transporter component  40.77 
 
 
246 aa  167  1e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0944457  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5326  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  41.1 
 
 
243 aa  167  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.740565  normal  0.577425 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2960  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
256 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.587097  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2552  branched-chain amino acid ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 
234 aa  167  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2315  ABC transporter related  38.2 
 
 
238 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.129419  hitchhiker  0.000435411 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0476  ABC transporter related  41.2 
 
 
236 aa  167  1e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2611  ABC transporter related  38.89 
 
 
234 aa  166  2e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2855  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
245 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000134885  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2791  ABC transporter related protein  44.44 
 
 
233 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.889429  normal  0.152706 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4754  ABC transporter related  37.77 
 
 
238 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.616033  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1819  ABC transporter-related protein  37.55 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2125  ABC transporter related  39.33 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3141  ABC transporter related  38.2 
 
 
238 aa  165  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0818776  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1435  ABC transporter-related protein  38.03 
 
 
234 aa  165  5e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2614  ABC transporter related  41.53 
 
 
247 aa  165  5e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.796579  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2863  ABC transporter-related protein  38.2 
 
 
238 aa  165  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113573  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2393  ABC transporter related  39.32 
 
 
234 aa  165  5e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361611  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2428  ABC branched-chain amino acid transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3396  ABC transporter related  39.83 
 
 
229 aa  164  8e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2725  ABC transporter related  38.2 
 
 
238 aa  164  9e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.605648  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1384  ABC transporter related  37.34 
 
 
234 aa  164  9e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  39.32 
 
 
238 aa  164  9e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1600  ABC transporter related  40.17 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.94084  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2212  ABC transporter, ATPase subunit  40.34 
 
 
247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.618749 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0408  ABC transporter-like protein  44.76 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.314132  normal  0.281925 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3686  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.87 
 
 
248 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0747254  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0825  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  37.77 
 
 
238 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.472761  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1451  ABC transporter related  37.61 
 
 
234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.544969  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0484  ABC-type branched-chain amino acid transport systems, ATPase component  38.17 
 
 
237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4102  ABC transporter related  37.61 
 
 
249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2009  branched-chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  38.46 
 
 
234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.378013  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2498  ABC transporter related  39.91 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0405923  normal  0.181063 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3793  ABC transporter related  37.77 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1001  branched chain amino acid ABC transporter ATPase  39.91 
 
 
238 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.284976  normal  0.367562 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1677  ABC transporter related  39.83 
 
 
247 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1672  ABC transporter related  39.74 
 
 
239 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3377  urea ABC transporter, ATP-binding protein UrtE  40.87 
 
 
248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1530  ABC transporter related  37.61 
 
 
234 aa  162  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0589  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4486  ABC transporter related  41.77 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.064197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>