More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_6098 on replicon NC_011370
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011370  Rleg2_6098  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 512 aa  1054    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4848  AMP-dependent synthetase and ligase  37.97 
 
 		 498 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  36.93 
 
 		 525 aa  289  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4840  AMP-dependent synthetase and ligase  33.62 
 
 		 522 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0208185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  34.07 
 
 		 520 aa  276  7e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6285  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 506 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.586819  normal  0.531753 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.33 
 
 		 514 aa  272  9e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.91 
 
 		 492 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.99 
 
 		 512 aa  264  2e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  34.24 
 
 		 490 aa  262  1e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1225  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.2 
 
 		 519 aa  259  6e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.399435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.8 
 
 		 513 aa  259  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 499 aa  258  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1864  AMP-dependent synthetase and ligase  35.07 
 
 		 506 aa  255  2.0000000000000002e-66  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.17 
 
 		 521 aa  254  3e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  31 
 
 		 518 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.26 
 
 		 510 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 		 510 aa  250  4e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2675  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 501 aa  250  4e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.65 
 
 		 510 aa  249  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 510 aa  249  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.06 
 
 		 510 aa  248  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 510 aa  248  2e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  31.86 
 
 		 662 aa  247  3e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 510 aa  247  3e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 510 aa  248  3e-64  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.85 
 
 		 510 aa  247  4e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26720  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  34.97 
 
 		 503 aa  246  4.9999999999999997e-64  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.371331  normal  0.219754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  31.83 
 
 		 512 aa  246  6.999999999999999e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0142  AMP-dependent synthetase and ligase  33.86 
 
 		 508 aa  245  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2105  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.72 
 
 		 524 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2447  AMP-dependent synthetase and ligase  35.14 
 
 		 505 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  31.76 
 
 		 587 aa  244  3e-63  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 521 aa  244  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 527 aa  244  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2158  putative long-chain-fatty-acid-CoA ligase  33.06 
 
 		 515 aa  242  1e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0827  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 566 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 522 aa  240  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4379  AMP-dependent synthetase and ligase  34.32 
 
 		 506 aa  240  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.177409 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4372  AMP-dependent synthetase and ligase  33.13 
 
 		 539 aa  238  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2407  AMP-dependent synthetase and ligase  32.3 
 
 		 498 aa  237  4e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.676828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1650  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 		 549 aa  237  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0843  acyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 513 aa  236  6e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.333452  normal  0.193709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  32.44 
 
 		 561 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3767  AMP-dependent synthetase and ligase  34.37 
 
 		 512 aa  236  8e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0143855  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  32.61 
 
 		 518 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0965  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.16 
 
 		 518 aa  234  3e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2693  AMP-dependent synthetase and ligase  30.39 
 
 		 562 aa  233  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  32.53 
 
 		 511 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3917  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 521 aa  233  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.287192  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2699  AMP-binding enzyme, putative long chain fatty acid Co-A ligase, acetyl-CoA synthetase  29.88 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0079  AMP-dependent synthetase and ligase  32.81 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.737985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.74 
 
 		 510 aa  232  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2083  AMP-dependent synthetase and ligase  32.67 
 
 		 544 aa  232  1e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2607  AMP-binding domain protein  33.4 
 
 		 570 aa  232  1e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0789  AMP-dependent synthetase and ligase  30.66 
 
 		 553 aa  232  1e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.109867  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1052  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.96 
 
 		 518 aa  232  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1739  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184325  hitchhiker  0.00142918 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2721  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.443793  normal  0.43387 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1998  putative acyl-CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  32.04 
 
 		 508 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3333  AMP-dependent synthetase and ligase  33.14 
 
 		 519 aa  231  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2646  AMP-binding domain protein  33.2 
 
 		 570 aa  231  2e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  31.42 
 
 		 1043 aa  231  2e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0308  AMP-binding domain protein  31.6 
 
 		 584 aa  230  4e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0171  AMP-dependent synthetase and ligase  30.16 
 
 		 630 aa  230  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217721  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7147  AMP-dependent synthetase and ligase  32.33 
 
 		 511 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0152334 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0557  AMP-binding domain protein  32.14 
 
 		 549 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 510 aa  229  8e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2593  AMP-binding domain protein  32.76 
 
 		 574 aa  229  9e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0927  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.43 
 
 		 518 aa  229  9e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4383  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 553 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.647475 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1980  AMP-dependent synthetase and ligase  32.09 
 
 		 532 aa  229  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0106234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3025  AMP-binding domain protein  31.01 
 
 		 576 aa  229  1e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0707  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.44 
 
 		 518 aa  229  1e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.413153  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  32.42 
 
 		 511 aa  229  1e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2503  AMP-binding domain protein  32.43 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3282  thioester reductase domain-containing protein  33.67 
 
 		 2374 aa  229  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1103  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2563  AMP-binding domain protein  30.31 
 
 		 549 aa  228  2e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.45341e-16 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2692  AMP-binding domain protein  30.71 
 
 		 552 aa  228  2e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.262026  normal  0.421392 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 559 aa  227  3e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6217  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 546 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.158197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4403  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.22 
 
 		 518 aa  228  3e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650953 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2905  AMP-dependent synthetase and ligase  32.7 
 
 		 502 aa  228  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.587257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1389  AMP-binding domain protein  30.57 
 
 		 549 aa  227  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000722424  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2283  AMP-dependent synthetase and ligase  31.38 
 
 		 513 aa  228  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1971  AMP-binding domain protein  32.43 
 
 		 578 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3306  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 511 aa  227  4e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000435597 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1573  AMP-binding domain protein  31.1 
 
 		 552 aa  227  4e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.116566  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2440  AMP-binding domain protein  29.98 
 
 		 544 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3296  AMP-dependent synthetase and ligase  31.95 
 
 		 502 aa  226  7e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0486472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3097  AMP-dependent synthetase and ligase  31.65 
 
 		 536 aa  226  7e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3403  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  32.76 
 
 		 579 aa  226  8e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4702  AMP-dependent synthetase and ligase  32.57 
 
 		 506 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2629  AMP-dependent synthetase and ligase  31.14 
 
 		 557 aa  226  8e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0494506  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0870  AMP-binding domain protein  31.49 
 
 		 548 aa  226  8e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0312  AMP-binding domain protein  31.81 
 
 		 550 aa  226  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  35.73 
 
 		 493 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>