73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3293 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_3293  hypothetical protein  100 
 
 
87 aa  173  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.587635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3594  hypothetical protein  98.85 
 
 
87 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.198532  normal  0.280923 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3695  hypothetical protein  94.25 
 
 
87 aa  167  4e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2455  conserved hypothetical protein-like protein  85.71 
 
 
280 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.167082  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2680  hypothetical protein  83.13 
 
 
90 aa  121  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.212729  normal  0.217102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2034  hypothetical protein  68 
 
 
85 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.492763 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1161  hypothetical protein  62.03 
 
 
85 aa  101  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.178544  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1620  hypothetical protein  64.1 
 
 
89 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2535  hypothetical protein  58.97 
 
 
94 aa  90.9  5e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3694  hypothetical protein  54.88 
 
 
98 aa  89.4  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1740  hypothetical protein  51.9 
 
 
80 aa  89  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.205429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1042  hypothetical protein  64.1 
 
 
93 aa  89.4  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.980568  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0876  hypothetical protein  59.74 
 
 
89 aa  88.2  4e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.271927  normal  0.154424 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2443  hypothetical protein  62.35 
 
 
175 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4670  hypothetical protein  66.67 
 
 
90 aa  87.4  6e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.315448  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0989  hypothetical protein  68.92 
 
 
89 aa  87  7e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.684189 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3737  hypothetical protein  53.16 
 
 
83 aa  87  8e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.00728994  normal  0.292015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1502  hypothetical protein  54.43 
 
 
88 aa  86.7  1e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3367  hypothetical protein  70.51 
 
 
87 aa  86.3  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2635  hypothetical protein  55.13 
 
 
94 aa  84.7  4e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0490604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2497  hypothetical protein  52.56 
 
 
90 aa  84.3  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.514422  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0130  hypothetical protein  63.64 
 
 
85 aa  84  7e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5200  hypothetical protein  63.29 
 
 
88 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2750  hypothetical protein  66.67 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.897901  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2872  hypothetical protein  66.67 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.751283  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3979  hypothetical protein  64.1 
 
 
89 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.121303  normal  0.274015 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1313  hypothetical protein  53.16 
 
 
108 aa  82.8  0.000000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.214688 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1734  hypothetical protein  55.13 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1480  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1405  hypothetical protein  64.1 
 
 
90 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.479596  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1426  hypothetical protein  64.1 
 
 
90 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2977  hypothetical protein  66.67 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.734498  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6866  hypothetical protein  63.75 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0427033  normal  0.022304 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1691  hypothetical protein  64.56 
 
 
86 aa  82.8  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5968  hypothetical protein  64.1 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.235147  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2948  hypothetical protein  48.24 
 
 
93 aa  82  0.000000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.594423  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1419  hypothetical protein  52.56 
 
 
92 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.500406  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1798  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.320432 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1221  hypothetical protein  62.82 
 
 
89 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.661908  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0164  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.360985  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0166  hypothetical protein  51.95 
 
 
91 aa  80.9  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0084  hypothetical protein  50.65 
 
 
91 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1752  hypothetical protein  63.29 
 
 
86 aa  80.5  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0557  hypothetical protein  46.25 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3227  hypothetical protein  61.33 
 
 
104 aa  79.3  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0077  hypothetical protein  50.67 
 
 
93 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.932951  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1557  hypothetical protein  43.53 
 
 
206 aa  78.2  0.00000000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5542  hypothetical protein  44.83 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7962  hypothetical protein  44.83 
 
 
90 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.027631  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4248  hypothetical protein  47.5 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287019  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2066  hypothetical protein  61.84 
 
 
87 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.576605  normal  0.483261 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1049  hypothetical protein  50 
 
 
90 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0123  hypothetical protein  56.25 
 
 
97 aa  74.3  0.0000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.366607 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3610  hypothetical protein  51.95 
 
 
131 aa  73.6  0.0000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2078  hypothetical protein  51.95 
 
 
132 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3699  hypothetical protein  58.67 
 
 
84 aa  73.2  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0234443 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3346  hypothetical protein  51.95 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.319255  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1659  hypothetical protein  51.95 
 
 
131 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.178857  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0462  hypothetical protein  41.77 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.781265  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0576  hypothetical protein  43.04 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.191205  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1916  hypothetical protein  49.3 
 
 
269 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.863299  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3184  hypothetical protein  53.33 
 
 
90 aa  66.6  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.34429  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0339  hypothetical protein  60 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0341011  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3122  hypothetical protein  59.49 
 
 
87 aa  63.9  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0430  hypothetical protein  56.36 
 
 
78 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.102123  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0915  hypothetical protein  54.43 
 
 
91 aa  62.4  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1696  hypothetical protein  49.09 
 
 
132 aa  61.6  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000802562  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2963  hypothetical protein  42.53 
 
 
90 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0180  hypothetical protein  53.16 
 
 
91 aa  59.3  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2697  hypothetical protein  47.27 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.576435  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3985  hypothetical protein  46.75 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1346  hypothetical protein  46.75 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.439397  hitchhiker  0.000296751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4810  hypothetical protein  44.44 
 
 
98 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>