163 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_2446 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2446  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  100 
 
 
379 aa  785    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.370845  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2825  DNA methylase N-4/N-6  39.64 
 
 
373 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.364595 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0864  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  37.36 
 
 
299 aa  225  1e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2345  DNA methylase N-4/N-6  36.04 
 
 
330 aa  197  3e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0319452  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3152  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.25 
 
 
359 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1062  DNA binding domain protein, excisionase family  33.43 
 
 
365 aa  191  2e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00013023  unclonable  0.00000741257 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2524  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.71 
 
 
368 aa  190  4e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000139446  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0646  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  32.14 
 
 
368 aa  190  4e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000621493  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1670  DNA methylase  30.75 
 
 
378 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000519085  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1029  gp56  31.33 
 
 
378 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0905816  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1434  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.94 
 
 
345 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.927906  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0560  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  31.56 
 
 
323 aa  159  8e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013925  Nmag_4235  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  31.97 
 
 
459 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0833  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.76 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3617  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  36.57 
 
 
296 aa  140  3e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0379764  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2404  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  30.06 
 
 
305 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7332  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  33.47 
 
 
345 aa  130  5.0000000000000004e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000215646  hitchhiker  0.0000000024237 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4634  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  34.45 
 
 
352 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3353  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.39 
 
 
314 aa  122  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.665349 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6269  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.25 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0229  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.15 
 
 
399 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0324708 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2240  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  25.07 
 
 
356 aa  97.1  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162757  hitchhiker  0.0000599239 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4169  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  48 
 
 
379 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2670  DNA methylase N-4/N-6  27.35 
 
 
388 aa  83.2  0.000000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000248914  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4183  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.73 
 
 
370 aa  80.9  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.712653  hitchhiker  0.00000333681 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1670  DNA methyltransferase  43.21 
 
 
380 aa  73.9  0.000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2525  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  45.07 
 
 
396 aa  67  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000796245  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2466  DNA methylase N-4/N-6  25.67 
 
 
311 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.235465 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1982  DNA-methyltransferase (DNA-modification methylase) protein  24.4 
 
 
270 aa  64.7  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0159066 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0022  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.9 
 
 
412 aa  63.9  0.000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4974  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  22.73 
 
 
597 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1812  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.76 
 
 
273 aa  63.2  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500335  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2136  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.15 
 
 
273 aa  62.4  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.113526  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2398  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.11 
 
 
313 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0192  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  38.03 
 
 
446 aa  62  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.151287  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0024  adenine-specific methyltransferase  24.73 
 
 
368 aa  62  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.109862  normal  0.210092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2305  DNA methylase N-4/N-6  24.16 
 
 
304 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6841  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.27 
 
 
301 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.463976 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0704  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.92 
 
 
379 aa  60.5  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0571  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  38.24 
 
 
361 aa  60.5  0.00000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00032193 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2010  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.45 
 
 
370 aa  59.7  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393522  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2880  putative modification methylase  27.03 
 
 
301 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150564  normal  0.487096 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4367  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.6 
 
 
358 aa  58.9  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.721631 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2196  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.39 
 
 
292 aa  58.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.79 
 
 
373 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984822  hitchhiker  0.00505908 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0675  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.68 
 
 
416 aa  57.8  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0413  modification methylase CcrMI  24.65 
 
 
378 aa  57.8  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1084  cell cycle regulated site-specific DNA-methyltransferase protein  26.32 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4576  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.6 
 
 
382 aa  57  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0649  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.45 
 
 
380 aa  57  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.909315  normal  0.229003 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0054  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  36.23 
 
 
416 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.549481  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2649  DNA methylase N-4/N-6  26.37 
 
 
389 aa  56.2  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2101  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.24 
 
 
376 aa  56.2  0.0000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.528087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0768  DNA methylase  26.18 
 
 
258 aa  55.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2193  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.17 
 
 
359 aa  55.5  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0073  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  34.78 
 
 
429 aa  55.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1720  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.18 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1650  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.18 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1859  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.18 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.229539  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2444  DNA modification methylase RsrI  26.18 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.462592  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2306  DNA modification methylase RsrI  26.18 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.436701  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0530  DNA modification methylase RsrI  26.18 
 
 
282 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.675032  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1810  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.24 
 
 
329 aa  55.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.729703  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2242  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  27.03 
 
 
329 aa  55.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.310751  hitchhiker  0.0000644694 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0680  N-6 adenine-specific DNA methylase  25.79 
 
 
259 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.846805  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4408  DNA methylase N-4/N-6  25.27 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3959  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.27 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135356  normal  0.18075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4513  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28 
 
 
279 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0040831  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0541  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  26.96 
 
 
398 aa  54.7  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0336098  normal  0.888289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3569  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.27 
 
 
283 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.570267  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3008  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.54 
 
 
370 aa  54.3  0.000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.367581 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3854  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.4 
 
 
283 aa  53.9  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2124  DNA methylase N-4/N-6  25.54 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.775437  normal  0.0115493 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3349  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.54 
 
 
283 aa  53.5  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.206831  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0627  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  27.54 
 
 
274 aa  53.9  0.000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3210  DNA methylase N-4/N-6  37.36 
 
 
367 aa  53.5  0.000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3343  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.22 
 
 
369 aa  53.5  0.000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  hitchhiker  0.00000416126 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4621  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.54 
 
 
283 aa  53.5  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0315645  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1468  site-specific DNA-methyltransferase  25.25 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.661815  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0119  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.25 
 
 
372 aa  53.1  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.222875  normal  0.070794 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1650  modification methylase BslI  32.05 
 
 
413 aa  53.1  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000000235232  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2231  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.22 
 
 
369 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0921492  hitchhiker  0.000652955 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1367  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  24.88 
 
 
360 aa  53.1  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1840  DNA methylase N-4/N-6  25.4 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0373756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0392  DNA methylase N-4/N-6  24.75 
 
 
367 aa  52.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.723409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0041  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.68 
 
 
441 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4375  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.6 
 
 
305 aa  52.4  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0066  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  24.75 
 
 
372 aa  51.6  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.711822  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1474  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  26.67 
 
 
368 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.180864  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0605  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.83 
 
 
377 aa  51.6  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.220402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0941  DNA methylase  29.65 
 
 
309 aa  51.6  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0702  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.84 
 
 
367 aa  51.6  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0606262  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0286  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  37.14 
 
 
271 aa  52  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.684049  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1593  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  35.44 
 
 
308 aa  51.6  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0446322  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0750  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  28.02 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.296291  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1099  DNA modification methylase-like  33.33 
 
 
413 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000152418  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1449  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  25.26 
 
 
360 aa  51.2  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103238  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2784  DNA methylase N-4/N-6 domain-containing protein  22.54 
 
 
282 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0534146  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2333  DNA methylase N-4/N-6 domain protein  28.08 
 
 
276 aa  51.2  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0137927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3157  DNA methylase N-4/N-6  25 
 
 
266 aa  50.4  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>