More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1845 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01688  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 642 aa  660    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0363313  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1923  threonyl-tRNA synthetase  49.61 
 
 		 642 aa  660    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000181503  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2219  threonyl-tRNA synthetase  49.22 
 
 		 635 aa  664    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00166056  normal  0.0562711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2746  threonyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 690 aa  697    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.180783 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2465  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 640 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0717195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2400  threonyl-tRNA synthetase  53.54 
 
 		 639 aa  706    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.459202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2136  threonyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 644 aa  682    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000263348  hitchhiker  0.00165189 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0427  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 640 aa  697    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0436469  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0693  threonyl-tRNA synthetase  52.04 
 
 		 638 aa  688    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.287981  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0978  threonyl-tRNA synthetase  53.14 
 
 		 633 aa  717    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1577  threonyl-tRNA synthetase  55.66 
 
 		 635 aa  731    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.704052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1638  threonyl-tRNA synthetase  75.79 
 
 		 660 aa  1067    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.360122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2154  threonyl-tRNA synthetase  79.09 
 
 		 661 aa  1088    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2909  threonyl-tRNA synthetase  49.23 
 
 		 636 aa  667    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2039  threonyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 646 aa  763    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1071  threonyl-tRNA synthetase  78.61 
 
 		 658 aa  1080    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2299  threonyl-tRNA synthetase  49.53 
 
 		 642 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2378  threonyl-tRNA synthetase  50.47 
 
 		 640 aa  683    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.423573  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2196  threonyl-tRNA synthetase  59.42 
 
 		 640 aa  818    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.163846  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18621  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 640 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.450861 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5204  threonyl-tRNA synthetase  70.11 
 
 		 688 aa  985    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.144339 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06531  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 640 aa  676    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1976  threonyl-tRNA synthetase  50.08 
 
 		 640 aa  668    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.30647  normal  0.0664699 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0202  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00540019  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1096  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.869704  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2770  threonyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 637 aa  684    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2643  threonyl-tRNA synthetase  52.24 
 
 		 637 aa  686    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2162  threonyl-tRNA synthetase  50.31 
 
 		 640 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.749908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2098  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 644 aa  670    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000824061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2677  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  53.09 
 
 		 638 aa  711    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.123605 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0033  threonyl-tRNA synthetase  50 
 
 		 641 aa  680    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.611945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1275  threonyl-tRNA synthetase  55.23 
 
 		 635 aa  743    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.966183  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0934  threonyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 633 aa  674    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.026136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1007  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  56.24 
 
 		 637 aa  740    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.245371  normal  0.0129716 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2035  threonyl-tRNA synthetase  69.96 
 
 		 686 aa  993    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2018  threonyl-tRNA synthetase  48.52 
 
 		 642 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000164437  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1890  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.190857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2668  threonyl-tRNA synthetase  58.97 
 
 		 652 aa  808    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.107403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1931  threonyl-tRNA synthetase  49.84 
 
 		 640 aa  660    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0165537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0385  threonyl-tRNA synthetase  57.65 
 
 		 646 aa  763    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.752042  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0851  threonyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 646 aa  765    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4615  threonyl-tRNA synthetase  53.49 
 
 		 635 aa  726    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00961863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0641  threonyl-tRNA synthetase  71.67 
 
 		 658 aa  1012    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2859  threonyl-tRNA synthetase  49.54 
 
 		 639 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.248456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2148  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 642 aa  659    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00500642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3225  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 640 aa  677    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.529889 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1724  threonyl-tRNA synthetase  49.46 
 
 		 642 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0116827  normal  0.392039 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1667  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 642 aa  664    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.301446  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1035  threonyl-tRNA synthetase  78.61 
 
 		 693 aa  1078    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.233676  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1888  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 635 aa  709    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0150098 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1712  threonyl-tRNA synthetase  48.84 
 
 		 642 aa  656    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000703633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0487  threonyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 		 638 aa  698    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.348528  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3487  threonyl-tRNA synthetase  58.93 
 
 		 643 aa  822    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0963  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0747512  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2595  threonyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 635 aa  726    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2032  threonyl-tRNA synthetase  48.9 
 
 		 642 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0621532  hitchhiker  0.0000404638 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2168  threonyl-tRNA synthetase  70.71 
 
 		 661 aa  995    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.762302  normal  0.0294607 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0204  threonyl-tRNA synthetase  53.6 
 
 		 664 aa  688    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2597  threonyl-tRNA synthetase  51.02 
 
 		 645 aa  669    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000186587  hitchhiker  0.000386738 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0006  threonyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 		 633 aa  676    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.999215  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1098  threonyl-tRNA synthetase  55.24 
 
 		 648 aa  714    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00129909  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1336  threonyl-tRNA synthetase  52.89 
 
 		 669 aa  714    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1577  threonyl-tRNA synthetase  51.41 
 
 		 636 aa  689    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.219126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3121  threonyl-tRNA synthetase  71.67 
 
 		 679 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2003  threonyl-tRNA synthetase  52.57 
 
 		 635 aa  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00562927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2102  threonyl-tRNA synthetase  53.41 
 
 		 635 aa  711    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.692107  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1371  threonyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 635 aa  719    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1705  threonyl-tRNA synthetase  47.82 
 
 		 642 aa  645    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0371819  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3261  threonyl-tRNA synthetase  70.11 
 
 		 687 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.565813  normal  0.0408031 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1799  threonyl-tRNA synthetase / Ser-tRNA(Thr) hydrolase  49 
 
 		 632 aa  665    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.302616  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1669  threonyl-tRNA synthetase  71.99 
 
 		 681 aa  1018    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115883  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2417  threonyl-tRNA synthetase  50.32 
 
 		 644 aa  672    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00010604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1160  threonyl-tRNA synthetase  55.04 
 
 		 635 aa  745    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.139321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2222  threonyl-tRNA synthetase  48.83 
 
 		 642 aa  659    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000682535  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1712  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.713127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1539  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1721  threonyl-tRNA synthetase  59.3 
 
 		 648 aa  772    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0692  threonyl-tRNA synthetase  50.97 
 
 		 667 aa  656    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.86772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0993  threonyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 635 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.31786  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2854  threonyl-tRNA synthetase  53.1 
 
 		 635 aa  717    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336987 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2499  threonyl-tRNA synthetase  50.15 
 
 		 638 aa  669    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0219257  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1007  threonyl-tRNA synthetase  77.58 
 
 		 656 aa  1072    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585418  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3089  threonyl-tRNA synthetase  51.68 
 
 		 639 aa  674    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.345995  normal  0.0971389 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0844  threonyl-tRNA synthetase  47.91 
 
 		 642 aa  646    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1765  threonyl-tRNA synthetase  48.54 
 
 		 642 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0145935  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1955  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 642 aa  659    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000861339  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2021  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 642 aa  659    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0151437  normal  0.0679206 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0768  threonyl-tRNA synthetase  52.32 
 
 		 641 aa  711    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.67512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2028  threonyl-tRNA synthetase  48.29 
 
 		 642 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.455146  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0829  threonyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 640 aa  744    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.127421  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2393  Ser-tRNA(Thr) hydrolase / threonyl-tRNA synthetase  57.6 
 
 		 644 aa  785    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.975747 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1359  threonyl-tRNA synthetase  53.8 
 
 		 635 aa  725    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28650  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 640 aa  674    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000737785 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2504  threonyl-tRNA synthetase  50.23 
 
 		 640 aa  673    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1475  threonyl-tRNA synthetase  52.87 
 
 		 635 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0274744  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1735  threonyl-tRNA synthetase  54.11 
 
 		 635 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261137  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2043  threonyl-tRNA synthetase  49.21 
 
 		 642 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000275607  normal  0.0123196 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1054  threonyl-tRNA synthetase  85.31 
 
 		 660 aa  1198    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.290687  normal  0.56724 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2061  threonyl-tRNA synthetase  50.99 
 
 		 641 aa  682    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.399726  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0955  threonyl-tRNA synthetase  57.99 
 
 		 648 aa  768    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.843203  normal  0.958295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>