26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_0352 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0384  putative succinoglycan biosynthesis transport protein  78.75 
 
 		 590 aa  837    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.69459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0352  putative succinoglycan biosynthesis transport protein  100 
 
 		 601 aa  1157    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0570325  normal  0.193411 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4243  lipopolysaccharide biosynthesis protein  27.61 
 
 		 595 aa  88.6  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0674  lipopolysaccharide biosynthesis  25.61 
 
 		 764 aa  78.2  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0975294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4500  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 537 aa  75.5  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.177123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4210  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.82 
 
 		 548 aa  74.7  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0093  putative polysaccharide accessory transport protein  26.58 
 
 		 572 aa  72.4  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0101  polysaccharide accessory transport protein, putative  26.78 
 
 		 572 aa  72  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4578  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.82 
 
 		 491 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.290602  normal  0.0783 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1794  chain length determinant protein  25.78 
 
 		 461 aa  57.4  0.0000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1385  hypothetical protein  26.11 
 
 		 756 aa  53.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.444045  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4355  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 		 696 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02477  putative Exopolysaccharide biosynthesis protein  22.32 
 
 		 738 aa  51.6  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2999  non-specific protein-tyrosine kinase  25.51 
 
 		 738 aa  50.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.821913  normal  0.521922 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2762  lipopolysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 		 748 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6014  exopolysaccharide polymerization/transport protein  28.81 
 
 		 737 aa  48.9  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3175  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.83 
 
 		 710 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.659876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5390  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 		 491 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.300037 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0387  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 509 aa  47.8  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4816  non-specific protein-tyrosine kinase  25.79 
 
 		 750 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0247  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.484556 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1073  protein-tyrosine kinase  21.73 
 
 		 755 aa  45.4  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.956847  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1490  protein-tyrosine kinase  25.83 
 
 		 734 aa  45.4  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1111  lipopolysaccharide biosynthesis  23.1 
 
 		 688 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1034  putative tyrosine-protein kinase injvolved in exopolysaccharide polymerization  21.88 
 
 		 756 aa  44.3  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.436669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1906  non-specific protein-tyrosine kinase  29.03 
 
 		 756 aa  44.3  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.320046  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>