118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4337 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4337  methyltransferase type 11  100 
 
 		 299 aa  614  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3989  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 249 aa  57.4  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.169635  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0572  hypothetical protein  27.89 
 
 		 243 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.519811  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0390  Methyltransferase type 11  30.61 
 
 		 239 aa  54.7  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.614689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0350  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.81 
 
 		 391 aa  53.9  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.19303  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6253  methyltransferase domain-containing protein  27.78 
 
 		 276 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4822  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.93 
 
 		 296 aa  52.4  0.000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  32.32 
 
 		 436 aa  52  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 242 aa  51.6  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1371  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.66 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1321  methyltransferase type 12  27.14 
 
 		 396 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0011  methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 222 aa  50.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5717  methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 241 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.753035  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 243 aa  50.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0742  type 11 methyltransferase  31.62 
 
 		 266 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.166057 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3600  methyltransferase type 11  34.29 
 
 		 293 aa  49.3  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 214 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1761  methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 257 aa  48.9  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  37.33 
 
 		 265 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 211 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  33.98 
 
 		 275 aa  48.5  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1285  hypothetical protein  27.17 
 
 		 249 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2260  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.06 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0516247  normal  0.429891 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.92 
 
 		 236 aa  48.1  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1903  hypothetical protein  24.82 
 
 		 376 aa  47.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.298907  normal  0.396986 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0241  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 255 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.114576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0355  methyltransferase type 12  25 
 
 		 342 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.896215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  28.83 
 
 		 293 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 239 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1664  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.28 
 
 		 230 aa  47  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3592  Methyltransferase type 11  30.63 
 
 		 251 aa  47  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0147  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 240 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.610455 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1658  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.36 
 
 		 230 aa  46.6  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  29.1 
 
 		 324 aa  46.6  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8231  methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 237 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 241 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  26.62 
 
 		 258 aa  46.6  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1175  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 		 247 aa  46.2  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.125464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  27.55 
 
 		 196 aa  46.2  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 293 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  22.09 
 
 		 194 aa  45.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3846  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 351 aa  45.8  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0403066  normal  0.436715 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2837  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31 
 
 		 247 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 272 aa  45.8  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0298  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.73 
 
 		 254 aa  45.8  0.0009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10226  methyltransferase  31.96 
 
 		 254 aa  45.8  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0218  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.679298  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  27.73 
 
 		 253 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0584  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 235 aa  45.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.950676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 264 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0228  methyltransferase type 11  31.91 
 
 		 252 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.237973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5454  methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 317 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.80361 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0080  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0077  hypothetical protein  30 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2138  Methyltransferase type 11  29.82 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  32.58 
 
 		 413 aa  45.4  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3019  hypothetical protein  25 
 
 		 306 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2465  hypothetical protein  27.39 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.16743  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5678  hypothetical protein  25 
 
 		 294 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.622302  normal  0.945039 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3081  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.609499  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30 
 
 		 247 aa  44.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 711 aa  44.3  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  27.34 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.23 
 
 		 710 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3360  methyltransferase type 11  26.44 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00148937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1618  Methyltransferase type 11  40 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  35.42 
 
 		 270 aa  44.3  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0718  glycosyl transferase family protein  32.69 
 
 		 1106 aa  44.3  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.411794  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  30 
 
 		 233 aa  44.3  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  23.93 
 
 		 278 aa  44.3  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 213 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3974  methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 284 aa  44.3  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1471  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 333 aa  43.9  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.133968 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 		 238 aa  44.3  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3659  Methyltransferase type 11  30.58 
 
 		 255 aa  43.9  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0109241  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1474  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.31 
 
 		 255 aa  44.3  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.760771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.29 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3663  hypothetical protein  36.36 
 
 		 262 aa  43.5  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2861  hypothetical protein  40.74 
 
 		 192 aa  43.9  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  29.63 
 
 		 216 aa  43.9  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0711  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.37 
 
 		 247 aa  43.9  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0438785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  40 
 
 		 271 aa  43.5  0.004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  52.63 
 
 		 1082 aa  43.5  0.004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  31.43 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5520  Methyltransferase type 12  23.39 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.281271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4848  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 241 aa  43.1  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0994  methyltransferase type 11  36.76 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295346  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  25.31 
 
 		 222 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1216  methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 510 aa  43.1  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.218616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  33.33 
 
 		 245 aa  43.5  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1110  hypothetical protein  32.31 
 
 		 267 aa  43.1  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2685  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  32.35 
 
 		 229 aa  42.7  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.469648 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2892  methyltransferase type 12  32.2 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0563  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 396 aa  43.1  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>