22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4289 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  897    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5361  hypothetical protein  29.92 
 
 		 409 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0691141 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5030  protein of unknown function DUF1173  26.67 
 
 		 441 aa  140  3e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6249  hypothetical protein  28.72 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5425  hypothetical protein  27.1 
 
 		 451 aa  134  3.9999999999999996e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4991  hypothetical protein  25.64 
 
 		 489 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354735  hitchhiker  0.00100031 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1568  hypothetical protein  27.71 
 
 		 406 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5232  hypothetical protein  27.48 
 
 		 406 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.500943  normal  0.262246 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5585  hypothetical protein  27.7 
 
 		 410 aa  104  3e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6533  hypothetical protein  26.54 
 
 		 408 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.350446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4238  hypothetical protein  23.57 
 
 		 403 aa  95.5  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6826  hypothetical protein  22.59 
 
 		 480 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0336179  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4154  hypothetical protein  23.56 
 
 		 406 aa  87.4  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0603844  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6244  hypothetical protein  23.67 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1564  hypothetical protein  21.89 
 
 		 422 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.144406  normal  0.0475856 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4329  hypothetical protein  23.89 
 
 		 399 aa  79  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.00310641  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1674  hypothetical protein  23.48 
 
 		 380 aa  77  0.0000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.252915 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2244  hypothetical protein  23.09 
 
 		 406 aa  70.9  0.00000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.311601 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2564  hypothetical protein  24.65 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.188396 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4748  hypothetical protein  22.1 
 
 		 429 aa  68.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4994  hypothetical protein  22.46 
 
 		 398 aa  68.2  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3958  hypothetical protein  21.76 
 
 		 408 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>