70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4119 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_4119  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  100 
 
 
89 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3280  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  49.33 
 
 
86 aa  72  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00156646 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1666  iron-sulfur cluster-binding protein  56.9 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127853  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1611  hypothetical protein  44.07 
 
 
160 aa  61.6  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000553331  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2707  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  44.83 
 
 
73 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.670596  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0563  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  47.37 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.978670000000001e-32 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3953  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  43.86 
 
 
72 aa  55.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000616189  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.28 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0010  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.62 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4153  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1309  dihydropyrimidine dehydrogenase  31.82 
 
 
432 aa  50.8  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0664  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  34.29 
 
 
503 aa  50.4  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.633094 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1885  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.98 
 
 
1016 aa  49.7  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2219  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.98 
 
 
373 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0830  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  46.15 
 
 
435 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0014  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  36.36 
 
 
1116 aa  47  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.952368 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2418  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  37.93 
 
 
652 aa  46.2  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0557  sulfite reductase, subunit C  33.33 
 
 
322 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1569  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  37.14 
 
 
431 aa  45.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.433482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1425  anaerobic sulfite reductase, subunit C  32.26 
 
 
326 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.199179  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1359  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.21 
 
 
238 aa  45.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.98127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3119  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.82 
 
 
392 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000930886  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0546  Glutamate synthase (NADPH)  38.71 
 
 
507 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0113147 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1691  anaerobic sulfite reductase, subunit C  32.26 
 
 
326 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0354563  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1546  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  38.98 
 
 
377 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1226  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.06 
 
 
432 aa  44.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3050  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 
432 aa  44.3  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2167  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  30 
 
 
914 aa  44.3  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0333  glutamate synthase (NADPH)  31.43 
 
 
505 aa  43.9  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.495212  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1168  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  35.48 
 
 
327 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00249386  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20700  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.82 
 
 
370 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.921643  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2222  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  38.33 
 
 
276 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0191527  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0781  glutamate synthase (NADPH)  28.75 
 
 
503 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0188816  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4113  formate dehydrogenase, alpha subunit  33.78 
 
 
901 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.163208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4316  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44 
 
 
632 aa  42.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.689523  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1127  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  36.92 
 
 
282 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000190957  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  44.23 
 
 
296 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2247  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.29 
 
 
427 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000011371  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1814  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  35.48 
 
 
507 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1337  glutamate synthase (NADPH)  37.1 
 
 
507 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.958593 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2793  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  32.26 
 
 
97 aa  41.6  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00379398  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1277  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.79 
 
 
1005 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.404382 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1576  methyl-viologen-reducing hydrogenase, delta subunit  36.67 
 
 
791 aa  42  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1409  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  39.06 
 
 
288 aa  41.6  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00176124  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0194  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  31.25 
 
 
292 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1691  glutamate synthase (NADPH)  30.43 
 
 
503 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.528981  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0099  NADH dehydrogenase (quinone)  36.21 
 
 
597 aa  41.6  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.953797  hitchhiker  0.000000556523 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0452  hypothetical protein  42.22 
 
 
128 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2709  Glutamate synthase (NADPH)  31.43 
 
 
502 aa  41.6  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0261  pyruvate ferredoxin/flavodoxin oxidoreductase, delta subunit  35.48 
 
 
92 aa  41.2  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1426  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.38 
 
 
228 aa  41.2  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  unclonable  0.00000000192957  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  37.14 
 
 
334 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0551  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 
425 aa  40.8  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2341  iron hydrogenase  30.77 
 
 
572 aa  40.8  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0675  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.82 
 
 
249 aa  40.8  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00451529  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1876  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  28.57 
 
 
293 aa  40.8  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0143  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.82 
 
 
1010 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2943  hypothetical protein  40.38 
 
 
796 aa  40.8  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  decreased coverage  0.00440971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4164  CoB--CoM heterodisulfide reductase subunit A  42 
 
 
632 aa  40.4  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1184  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  38.71 
 
 
97 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.68406  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2064  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  29.41 
 
 
355 aa  40.8  0.007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000413474  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0310  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.48 
 
 
128 aa  40.4  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2655  iron hydrogenase  30.77 
 
 
572 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1055  ferredoxin III, nif-specific  28.57 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08160  4Fe-4S protein  35.82 
 
 
322 aa  40  0.009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.127337 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1385  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.71 
 
 
368 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3505  NADH dehydrogenase (quinone)  38.18 
 
 
619 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.960223  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1396  glycerol dehydratase activating enzyme  32.76 
 
 
322 aa  40  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.214688  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2635  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.85 
 
 
392 aa  40.4  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000007278  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2122  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  32.31 
 
 
421 aa  40  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00612142  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>