20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3767 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3767  hypothetical protein  100 
 
 		 73 aa  143  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0303  hypothetical protein  76.47 
 
 		 126 aa  103  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1312  hypothetical protein  62.5 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00893975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0189  hypothetical protein  48.28 
 
 		 113 aa  57.4  0.00000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.948948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0187  hypothetical protein  48.28 
 
 		 113 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.704355  normal  0.309268 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0132  hypothetical protein  50.91 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.633937  normal  0.655967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1807  hypothetical protein  52 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.250952  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0395  hypothetical protein  54.35 
 
 		 129 aa  53.9  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0802537 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1216  hypothetical protein  54.17 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934469  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3059  hypothetical protein  54.17 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5059  hypothetical protein  45.31 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.210325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2776  hypothetical protein  51.02 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1078  hypothetical protein  54 
 
 		 113 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3109  hypothetical protein  53.19 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0052  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0964  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2825  hypothetical protein  47.06 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.712693  normal  0.211414 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0934  hypothetical protein  41.18 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0435  hypothetical protein  51.06 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.425168 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1290  hypothetical protein  46 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>