180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3555 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3555  glutathione S-transferase-like  100 
 
 		 212 aa  433  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0580476  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2363  hypothetical protein  76.92 
 
 		 211 aa  327  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0713613  normal  0.732087 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0025  Glutathione S-transferase domain protein  65.35 
 
 		 204 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2231  Glutathione S-transferase domain protein  66.34 
 
 		 202 aa  258  6e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0030  Glutathione S-transferase domain  63.9 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.591162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2587  hypothetical protein  60.29 
 
 		 202 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0129  hypothetical protein  61.39 
 
 		 202 aa  236  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0405  hypothetical protein  63.38 
 
 		 217 aa  234  8e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.631465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0989  glutathione S-transferase domain-containing protein  58.13 
 
 		 202 aa  234  9e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0668  Glutathione S-transferase domain  56.44 
 
 		 204 aa  228  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4031  putative glutathione S-transferase  55.94 
 
 		 204 aa  225  5.0000000000000005e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1498  glutathione S-transferase domain-containing protein  55.88 
 
 		 233 aa  223  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1267  hypothetical protein  56.44 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14290  hypothetical protein  56.44 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.128982  normal  0.822767 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3329  glutathione S-transferase-like protein  53.47 
 
 		 201 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1595  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.33 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2794  glutathione S-transferase domain-containing protein  54.33 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.149996  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1461  glutathione S-transferase  54.33 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1491  glutathione S-transferase family protein  54.33 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0987  glutathione S-transferase-like protein  53.81 
 
 		 204 aa  203  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4422  glutathione S-transferase-like protein  52.4 
 
 		 209 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.178474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0798  glutathione S-transferase-like  52.88 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762924  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1279  glutathione S-transferase-like protein  52.88 
 
 		 209 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0111795  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1251  glutathione S-transferase domain-containing protein  52.88 
 
 		 209 aa  198  5e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.119917 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1157  glutathione S-transferase-like protein  50.48 
 
 		 209 aa  189  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1169  glutathione S-transferase domain-containing protein  50.48 
 
 		 209 aa  187  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00510554  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1395  glutathione S-transferase like protein  34.83 
 
 		 208 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.00727348  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0372  glutathione S-transferase domain-containing protein  33.67 
 
 		 211 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.360497  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0759  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 		 129 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1269  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 		 129 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0366351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0601  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 		 129 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.178944  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0552  glutathione S-transferase domain-containing protein  51.56 
 
 		 129 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7065  putative glutathione transferase  35.68 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2272  Glutathione S-transferase-like protein  34.16 
 
 		 209 aa  105  6e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1266  glutathione S-transferase  67.69 
 
 		 78 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.00947497  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0604  GST-like protein  67.69 
 
 		 78 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.899714  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2782  glutathione S-transferase-like protein  40.52 
 
 		 142 aa  84.7  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.724853  normal  0.967961 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2721  putative glutathione S-transferase protein  30.5 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2555  Glutathione S-transferase domain protein  30 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.736156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2965  Glutathione S-transferase domain  30 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1795  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.14 
 
 		 221 aa  78.2  0.00000000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.277101  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1512  Glutathione S-transferase domain  27.14 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.553363 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2242  glutathione S-transferase-like protein  30.35 
 
 		 202 aa  75.1  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.025244  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2729  glutathione S-transferase domain-containing protein  34.07 
 
 		 227 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2957  glutathione S-transferase-like protein  28.16 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3913  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 204 aa  68.9  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0846475  normal  0.026606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3336  Glutathione S-transferase domain  29.03 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287023  normal  0.088058 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1089  Glutathione S-transferase domain  30.71 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.600559  hitchhiker  0.000151531 
 
 
-
 
NC_004310  BR0702  glutathione S-transferase family protein  30.77 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2688  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.96 
 
 		 204 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.761571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2584  glutathione S-transferase domain-containing protein  30.77 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0089  putative glutathione S-transferase  29.38 
 
 		 201 aa  66.6  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0693  glutathione S-transferase family protein  30.77 
 
 		 199 aa  67  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0624  glutathione S-transferase  28.49 
 
 		 206 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.531247  normal  0.512939 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2820  glutathione S-transferase  26.7 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294123  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1255  glutathione S-transferase  25 
 
 		 203 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3289  glutathione S-transferase  27.32 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3623  putative glutathione S-transferase protein  26.57 
 
 		 206 aa  64.7  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0893077  normal  0.362102 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2361  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3398  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0276  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1137  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3356  glutathione S-transferase family protein  24.51 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3392  glutathione S-transferase family protein  24.51 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2542  glutathione S-transferase  24.51 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1835  Glutathione S-transferase domain protein  32.29 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.583884  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0615  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.715776  normal  0.218032 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0589  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.61 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2548  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.63 
 
 		 202 aa  62.8  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.24256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0663  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0212  glutathione S-transferase-like  25.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0696  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.41 
 
 		 205 aa  62  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4668  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.24 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3782  glutathione S-transferase-like protein  24.12 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0363  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.55 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115928 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0448  glutathione S-transferase, putative  27.72 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3883  Glutathione S-transferase domain protein  27.32 
 
 		 203 aa  61.2  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1562  glutathione S-transferase related protein  23.21 
 
 		 198 aa  60.5  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.572147  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4661  glutathione S-transferase-like  24.76 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.39586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1159  glutathione S-transferase domain-containing protein  25.37 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4913  Glutathione S-transferase domain  36.36 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.413564  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1204  glutathione S-transferase domain-containing protein  28.24 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1397  glutathione S-transferase  32.65 
 
 		 202 aa  58.9  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4050  glutathione S-transferase-like  24 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.767967  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0064  glutathione S-transferase  32.65 
 
 		 202 aa  58.2  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.876217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0846  glutathione S-transferase  25.65 
 
 		 202 aa  57.8  0.0000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.289081  normal  0.806951 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1545  glutathione S-transferase domain-containing protein  27.62 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0116241 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0785  glutathione S-transferase domain-containing protein  24.14 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.238617  normal  0.0753849 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4727  glutathione S-transferase, putative  27.32 
 
 		 209 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.981894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0226  glutathione S-transferase domain-containing protein  32.95 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4868  glutathione S-transferase domain-containing protein  26.5 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.895586  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0572  hypothetical protein  26.53 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3647  Glutathione S-transferase domain  26.44 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0997379 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4025  glutathione S-transferase domain-containing protein  25 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.638139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3375  Glutathione S-transferase domain protein  25 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1878  glutathione S-transferase domain-containing protein  31.72 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3758  Glutathione S-transferase domain  26.92 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.177098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7162  Glutathione S-transferase domain protein  27.45 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4086  glutathione S-transferase-like  26.06 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0139  putative glutathione S-transferase  36.49 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>