45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3535 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3535  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  234  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.477092  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0595  hypothetical protein  54.78 
 
 		 98 aa  111  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0332  hypothetical protein  50.88 
 
 		 107 aa  104  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1148  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0778  hypothetical protein  49.58 
 
 		 111 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3615  hypothetical protein  56.14 
 
 		 98 aa  96.7  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.265329 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3956  hypothetical protein  47.46 
 
 		 111 aa  82.4  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333987 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0452  hypothetical protein  51.33 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.384235  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0461  hypothetical protein  51.33 
 
 		 107 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.44765  normal  0.192979 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2044  hypothetical protein  40.87 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0126  hypothetical protein  38.6 
 
 		 105 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5036  hypothetical protein  35.71 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.137842  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0095  hypothetical protein  39.66 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5120  hypothetical protein  36.44 
 
 		 106 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.335981  normal  0.0327803 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0189  hypothetical protein  35.29 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1687  hypothetical protein  34.21 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0669  hypothetical protein  38.52 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4244  hypothetical protein  34.17 
 
 		 108 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.616901  normal  0.194441 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0474  hypothetical protein  33.33 
 
 		 108 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0560582 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2569  hypothetical protein  33.9 
 
 		 106 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1978  hypothetical protein  35.34 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3465  hypothetical protein  32.2 
 
 		 106 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.353832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5288  hypothetical protein  31.36 
 
 		 106 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.704122  normal  0.85496 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0083  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2293  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.199117  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2918  hypothetical protein  33.9 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0593  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.321001  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6261  hypothetical protein  33.9 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2304  hypothetical protein  33.9 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3101  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.953527  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1995  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0412  ribosomal protein L1  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0432  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2933  hypothetical protein  33.62 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0386  hypothetical protein  33.91 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0565373 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0356  hypothetical protein  34.19 
 
 		 107 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6376  hypothetical protein  35.29 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0039  hypothetical protein  36.52 
 
 		 109 aa  52.8  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.698775 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0288  hypothetical protein  33.05 
 
 		 105 aa  52.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.603115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2830  hypothetical protein  32.52 
 
 		 107 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2967  hypothetical protein  32.52 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0146  hypothetical protein  32.77 
 
 		 107 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0138  hypothetical protein  32.77 
 
 		 107 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3027  hypothetical protein  28.57 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3632  hypothetical protein  29.17 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000778847  hitchhiker  0.00000131595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>