More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3420 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3420  cell division protein FtsZ  100 
 
 		 417 aa  837    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00000881551  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1080  cell division protein FtsZ  86.6 
 
 		 409 aa  646    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.000000021674  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0924  cell division protein FtsZ  79.62 
 
 		 406 aa  594  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00449879  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3665  cell division protein FtsZ  77.91 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0666491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2975  cell division protein FtsZ  77.91 
 
 		 409 aa  588  1e-167  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00368493  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3412  cell division protein FtsZ  80.91 
 
 		 394 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000669167  normal  0.43069 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0826  cell division protein FtsZ  77.43 
 
 		 410 aa  566  1e-160  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.177304  normal  0.584414 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1475  cell division protein FtsZ  78.44 
 
 		 412 aa  567  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.658975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4575  cell division protein FtsZ  72.21 
 
 		 413 aa  539  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00213965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0467  cell division protein FtsZ  70.92 
 
 		 405 aa  498  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0310638  normal  0.0832153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0527  cell division protein FtsZ  69.5 
 
 		 405 aa  495  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3123  cell division protein FtsZ  62.35 
 
 		 396 aa  437  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.250037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2974  cell division protein FtsZ  61.87 
 
 		 398 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00404653  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2719  cell division protein FtsZ  61.58 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.147554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3084  cell division protein FtsZ  61.34 
 
 		 399 aa  424  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.15044  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2839  cell division protein FtsZ  61.1 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.412963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3650  cell division protein FtsZ  61.63 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000000496958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0491  cell division protein FtsZ  61.63 
 
 		 398 aa  419  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00000439122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3545  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0493  cell division protein FtsZ  61.47 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0466  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.593752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1325  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.928937  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2545  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3539  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3238  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1123  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2831  cell division protein FtsZ  61.63 
 
 		 398 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  unclonable  0.0000000000122218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0535  cell division protein FtsZ  61.47 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000909703  normal  0.779082 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0082  cell division protein FtsZ  61.47 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.00000000308232  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0468  cell division protein FtsZ  61.47 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3520  cell division protein FtsZ  60.77 
 
 		 398 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710344  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0564  cell division protein FtsZ  61.47 
 
 		 398 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000000183043  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3465  cell division protein FtsZ  60.29 
 
 		 398 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000236029  hitchhiker  0.00102035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2668  cell division protein FtsZ  60.91 
 
 		 397 aa  408  1e-113  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000509241  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3493  cell division protein FtsZ  58.89 
 
 		 398 aa  405  1.0000000000000001e-112  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00398885  normal  0.338691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0172  cell division protein FtsZ  55.58 
 
 		 446 aa  354  1e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000198295  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0186  cell division protein FtsZ  55.13 
 
 		 446 aa  354  2e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103682  normal  0.437906 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2263  cell division protein FtsZ  55.15 
 
 		 387 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00432482  hitchhiker  0.000536698 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0125  cell division protein FtsZ  53.96 
 
 		 380 aa  349  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0593594  normal  0.066745 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3422  cell division protein FtsZ  55.98 
 
 		 380 aa  350  4e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.588634  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2488  cell division protein FtsZ  54.66 
 
 		 389 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0022713  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2423  cell division protein FtsZ  50.51 
 
 		 382 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0258249  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2085  cell division protein FtsZ  50.38 
 
 		 386 aa  300  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.150448  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3513  cell division protein FtsZ  49.25 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000471065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0641  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000009696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3382  cell division protein FtsZ  49.25 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.0000000104455  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2913  cell division protein FtsZ  49.25 
 
 		 383 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000966875  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00096  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00002823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3505  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000963693  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0615  cell division protein FtsZ  48.11 
 
 		 383 aa  298  8e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000348627  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3562  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000263859  normal  0.0129736 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00095  hypothetical protein  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000162497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0101  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.47391e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0088  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000379659  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0097  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000652178  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0103  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000359609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0100  cell division protein FtsZ  48.61 
 
 		 383 aa  299  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000245858  normal  0.622573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0653  cell division protein FtsZ  49.36 
 
 		 383 aa  298  9e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0000229  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0149  cell division protein FtsZ  48.36 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000359528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3775  cell division protein FtsZ  49.24 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000884705  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0145  cell division protein FtsZ  48.36 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.000120308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0145  cell division protein FtsZ  49.62 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0351517  hitchhiker  0.00000964056 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3587  cell division protein FtsZ  49.24 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00015207  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0150  cell division protein FtsZ  48.36 
 
 		 383 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000113704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0766  cell division protein FtsZ  48.24 
 
 		 384 aa  297  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000874251  normal  0.238426 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004486  cell division protein FtsZ  49.62 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000238427  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0142  cell division protein FtsZ  48.11 
 
 		 383 aa  295  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.000809484  normal  0.893784 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00906  cell division protein FtsZ  59.12 
 
 		 415 aa  295  1e-78  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0359  cell division protein FtsZ  50.75 
 
 		 395 aa  294  2e-78  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000196316  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0517  cell division protein FtsZ  48.7 
 
 		 390 aa  294  2e-78  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1975  cell division protein FtsZ  48.35 
 
 		 398 aa  293  5e-78  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.0000000000000804348  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3807  cell division protein FtsZ  50.12 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000351722  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0358  cell division protein FtsZ  51.27 
 
 		 394 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000326456  unclonable  0.00000763444 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3514  cell division protein FtsZ  48.35 
 
 		 390 aa  289  6e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0000411228  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0414  cell division protein FtsZ  50.64 
 
 		 391 aa  289  6e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000271858  hitchhiker  0.00156987 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0853  cell division protein FtsZ  50.13 
 
 		 390 aa  289  7e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3800  cell division protein FtsZ  51.65 
 
 		 388 aa  288  1e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000000371095  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0775  cell division protein FtsZ  49.62 
 
 		 384 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0613024  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0927  cell division protein FtsZ  48.6 
 
 		 397 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000000829839  normal  0.686673 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0491  cell division protein FtsZ  50.64 
 
 		 395 aa  285  8e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000254603  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2447  cell division protein FtsZ  51.01 
 
 		 385 aa  285  8e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00131547  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2640  cell division protein FtsZ  48.23 
 
 		 411 aa  285  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.000115675  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0405  cell division protein FtsZ  50.64 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119039  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0417  cell division protein FtsZ  50.64 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000886919  unclonable  0.00000557557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0431  cell division protein FtsZ  50.64 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000694635  hitchhiker  0.0000000000669331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3566  cell division protein FtsZ  50.13 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000796919  decreased coverage  0.000000000512084 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0390  cell division protein FtsZ  50.13 
 
 		 395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00071655  unclonable  0.00003574 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4215  cell division protein FtsZ  50.13 
 
 		 395 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3739  cell division protein FtsZ  50.13 
 
 		 395 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000117784  unclonable  0.000000000119361 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0406  cell division protein FtsZ  50.38 
 
 		 395 aa  284  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000385865  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4529  cell division protein FtsZ  49.36 
 
 		 392 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000237057  unclonable  0.0000000285866 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0059  cell division protein FtsZ  42.96 
 
 		 427 aa  283  5.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.000000000225371  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4668  cell division protein FtsZ  48.1 
 
 		 398 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000910639  normal  0.472139 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0379  cell division protein FtsZ  49.72 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  decreased coverage  0.000173126  normal  0.037859 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0200  cell division protein FtsZ  49.72 
 
 		 387 aa  281  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.719937  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2890  cell division protein FtsZ  43.12 
 
 		 430 aa  280  2e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000804366  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2609  cell division protein FtsZ  49.24 
 
 		 409 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000986054  unclonable  0.00000000000462824 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0560  cell division protein FtsZ  49.02 
 
 		 396 aa  280  4e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012227  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4979  cell division protein FtsZ  48.48 
 
 		 394 aa  280  4e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.0056047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4459  cell division protein FtsZ  47.37 
 
 		 386 aa  279  6e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>