286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3236 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3236  PHP-like  100 
 
 
319 aa  646    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3274  phosphotransferase domain-containing protein  78.57 
 
 
287 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.156936  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3707  phosphotransferase domain-containing protein  77.5 
 
 
287 aa  441  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1005  PHP-like  78.57 
 
 
286 aa  435  1e-121  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00117289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2763  PHP domain protein  74.31 
 
 
292 aa  431  1e-120  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.417679  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3431  phosphotransferase domain-containing protein  74.31 
 
 
292 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4021  PHP domain protein  75.7 
 
 
285 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2756  hypothetical protein  74.29 
 
 
287 aa  419  1e-116  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.308411  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2582  phosphotransferase domain-containing protein  73.59 
 
 
298 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00424426 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1626  phosphotransferase domain-containing protein  73.1 
 
 
303 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5411  phosphotransferase domain-containing protein  73.43 
 
 
287 aa  410  1e-113  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.861836 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1140  hypothetical protein  66.55 
 
 
286 aa  377  1e-103  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0844  phosphotransferase domain-containing protein  64.6 
 
 
282 aa  376  1e-103  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0982  PHP domain protein  67.16 
 
 
286 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.727883  normal  0.091006 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0994  PHP domain protein  62.91 
 
 
283 aa  366  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000016176  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1078  PHP domain protein  66.79 
 
 
286 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0351695  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1064  PHP-like protein  59.45 
 
 
322 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0429351  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2553  PHP domain protein  60.81 
 
 
276 aa  345  6e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000196897  normal  0.153793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1580  hypothetical protein  60.81 
 
 
276 aa  341  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126849  normal  0.792239 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1100  PHP, C-terminal  61.4 
 
 
281 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1683  phosphoesterase, putative  62.64 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.478385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2570  putative phosphoesterase  62.64 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1458  putative phosphoesterase  62.64 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.525021  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2185  putative phosphoesterase  62.64 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3132  putative phosphoesterase  62.64 
 
 
276 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322538  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2624  putative phosphoesterase  62.27 
 
 
276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2703  metal-dependent phosphoesterase  62.27 
 
 
276 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1174  phosphotransferase domain-containing protein  62.5 
 
 
279 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806701  decreased coverage  0.000000145397 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1432  phosphotransferase domain-containing protein  59.34 
 
 
277 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5406  PHP-like metal-dependent phosphoesterase  63.37 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.272926  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5977  PHP-like  62.64 
 
 
279 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2100  phosphotransferase domain-containing protein  62.64 
 
 
279 aa  318  9e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2118  phosphotransferase domain-containing protein  62.64 
 
 
279 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00317755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1901  phosphoesterase, putative  62.27 
 
 
276 aa  315  7e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2010  phosphotransferase domain-containing protein  61.9 
 
 
276 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  hitchhiker  0.000228692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2137  phosphotransferase domain-containing protein  61.9 
 
 
276 aa  305  6e-82  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2462  PHP, C-terminal  51.75 
 
 
295 aa  293  3e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.735424  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2314  PHP-like  54.78 
 
 
279 aa  290  2e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1683  PHP domain protein  56.73 
 
 
301 aa  281  1e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1528  phosphoesterase PHP  54.95 
 
 
287 aa  278  6e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0724488 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2384  PHP family metal-dependent phosphoesterase  50.18 
 
 
278 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1877  PHP-like protein  48.91 
 
 
284 aa  265  7e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0359  phosphotransferase domain-containing protein  47.08 
 
 
277 aa  231  1e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.663247  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1101  PHP domain protein  44.81 
 
 
286 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0987  hypothetical protein  44.81 
 
 
286 aa  223  3e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.561558  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1718  hypothetical protein  41.7 
 
 
278 aa  221  9e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2402  phosphotransferase domain-containing protein  45.36 
 
 
286 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2700  phosphotransferase domain-containing protein  45.23 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2800  phosphotransferase domain-containing protein  45.23 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.660004  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2721  phosphotransferase domain-containing protein  45.23 
 
 
302 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1231  PHP-like  39.07 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000070762  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1665  PHP domain protein  45 
 
 
286 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0193583  hitchhiker  0.000506182 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1878  phosphotransferase domain-containing protein  43.12 
 
 
288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2203  phosphotransferase domain-containing protein  44.69 
 
 
298 aa  210  2e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000209881 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3586  phosphoesterase PHP, N-terminal:PHP, C-terminal  43.53 
 
 
287 aa  207  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.604486  normal  0.45236 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0883  TrpH protein  39.48 
 
 
269 aa  206  5e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.33957  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1644  phosphotransferase domain-containing protein  43.42 
 
 
292 aa  205  9e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0687  phosphotransferase domain-containing protein  45.19 
 
 
284 aa  205  9e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.134262  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1487  PHP-like  43.37 
 
 
287 aa  204  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0371486  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2666  phosphotransferase domain-containing protein  43.91 
 
 
295 aa  204  2e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000470189 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1810  PHP domain protein  42.81 
 
 
287 aa  203  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1931  PHP domain protein  43.17 
 
 
297 aa  202  8e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2041  phosphotransferase domain-containing protein  45.02 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.67494  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1930  phosphotransferase domain-containing protein  45.02 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1430  phosphotransferase domain-containing protein  42.5 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2309  PHP domain protein  42.45 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.244375  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2311  phosphotransferase domain-containing protein  44.65 
 
 
310 aa  200  3e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1521  phosphotransferase domain-containing protein  45 
 
 
286 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0120017 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3017  TrpH family protein  44.64 
 
 
286 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2449  PHP-like protein  42.14 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1529  phosphotransferase domain-containing protein  44.64 
 
 
286 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.70197  normal  0.0178812 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1463  phosphotransferase domain-containing protein  44.29 
 
 
286 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2911  phosphotransferase domain-containing protein  42.7 
 
 
287 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.367074 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1898  putative phosphoesterase  41.34 
 
 
293 aa  195  1e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000460558 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2171  PHP domain protein  43.01 
 
 
290 aa  195  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.772956  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2250  phosphotransferase domain-containing protein  42.86 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00409955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1490  putative phosphoesterase  40.99 
 
 
286 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01240  hypothetical protein  41.34 
 
 
293 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1465  putative phosphoesterase  41.34 
 
 
286 aa  193  3e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.200678  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1867  putative phosphoesterase  41.34 
 
 
293 aa  193  3e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000652478 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1687  phosphotransferase domain-containing protein  42.7 
 
 
285 aa  193  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01250  hypothetical protein  41.34 
 
 
293 aa  193  3e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2383  PHP domain protein  41.34 
 
 
293 aa  192  4e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00108738  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2008  PHP domain protein  42.09 
 
 
296 aa  193  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.208855  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1412  phosphotransferase domain-containing protein  41.94 
 
 
286 aa  193  4e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0394495  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2362  phosphotransferase domain-containing protein  41.34 
 
 
293 aa  192  4e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1375  putative phosphoesterase  41.34 
 
 
286 aa  193  4e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1834  phosphotransferase domain-containing protein  42.96 
 
 
303 aa  192  7e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.297742  normal  0.423951 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4500  trpH family protein  41.58 
 
 
286 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655584  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1853  putative phosphoesterase  42.65 
 
 
282 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.25144 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1061  phosphotransferase domain-containing protein  39.85 
 
 
291 aa  191  2e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.145875  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1911  putative phosphoesterase  42.65 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000200072 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1425  putative phosphoesterase  42.65 
 
 
282 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.769482  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1848  putative phosphoesterase  42.65 
 
 
282 aa  189  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0559727  hitchhiker  0.000620806 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2128  PHP-like protein  41.91 
 
 
286 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4006  phosphotransferase domain-containing protein  41.58 
 
 
286 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000044787 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1607  putative phosphoesterase  42.28 
 
 
282 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000728178 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02756  hypothetical protein  38.24 
 
 
292 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1155  hypothetical protein  39.34 
 
 
281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.405335  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0150  phosphotransferase domain-containing protein  40.58 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>