More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3009 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_2528  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 546 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0382557 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0698  chaperonin GroEL  59.01 
 
 		 551 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00000118072  unclonable  0.000000000086232 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1908  chaperonin GroEL  58.57 
 
 		 552 aa  635    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0707  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 545 aa  663    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.990756  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1704  chaperonin, 60 kDa subunit  60.48 
 
 		 542 aa  662    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.651544  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0642  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 547 aa  657    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03703  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 546 aa  647    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0945  chaperonin GroEL  60.6 
 
 		 545 aa  651    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0596122  normal  0.469876 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2333  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 546 aa  638    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0883149  normal  0.0155748 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1420  chaperonin GroEL  61.7 
 
 		 549 aa  676    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.038504  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0864  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 546 aa  639    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.0000144467  normal  0.0762282 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2001  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 550 aa  652    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0483  chaperonin GroEL  61.48 
 
 		 549 aa  659    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3997  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 546 aa  640    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.113268 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0426  chaperonin GroEL  59.81 
 
 		 550 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000639435  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2656  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 547 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0091  chaperonin GroEL (Hsp60, Cpn10)  61.67 
 
 		 547 aa  665    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000116999  normal  0.52877 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3661  chaperonin GroEL  58.79 
 
 		 547 aa  637    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738894  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3175  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 546 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.509223  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2921  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 554 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375677  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0579  chaperonin GroEL  61.67 
 
 		 547 aa  659    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158784  normal  0.586113 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3735  chaperonin GroEL  58.79 
 
 		 547 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.923686  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3955  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 546 aa  647    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0037978  normal  0.116505 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2616  chaperonin GroEL  60.72 
 
 		 546 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.534087 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0657  chaperonin GroEL  59.58 
 
 		 549 aa  645    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000001138  decreased coverage  0.00270634 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0535  chaperonin GroEL  62.05 
 
 		 547 aa  665    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.793994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2742  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 550 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2344  chaperonin GroEL  63.3 
 
 		 552 aa  686    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  unclonable  0.00000584882  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0831  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00374886  decreased coverage  0.00000389435 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1863  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 550 aa  652    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.120013  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3153  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 546 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0912  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 550 aa  652    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.31421  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1938  chaperonin GroEL  60.52 
 
 		 546 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1458  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3594  chaperonin GroEL  58.79 
 
 		 547 aa  638    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3626  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 549 aa  642    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0147  chaperonin GroEL  60.91 
 
 		 545 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1131  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 552 aa  648    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0000256117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3009  chaperonin GroEL  100 
 
 		 544 aa  1075    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0287  chaperonin GroEL  58.38 
 
 		 552 aa  635    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.0000393634  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0364  chaperonin GroEL  62.48 
 
 		 544 aa  678    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000174436  decreased coverage  0.00158274 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0759  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 550 aa  651    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000585799  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2609  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 540 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000319213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3815  chaperonin GroEL  60.15 
 
 		 546 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000160857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4544  chaperonin GroEL  60.41 
 
 		 540 aa  649    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000305433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1569  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 546 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0135  chaperonin GroEL  60.45 
 
 		 546 aa  640    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.129883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0439  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  659    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000414877  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0389  chaperonin GroEL  89.52 
 
 		 544 aa  971    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.271372 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0292  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 552 aa  652    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1805  chaperonin GroEL  59.01 
 
 		 550 aa  641    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000135763  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3117  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 546 aa  650    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.222092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0616  chaperonin GroEL  61.86 
 
 		 547 aa  645    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0352411 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3715  chaperonin GroEL  59.39 
 
 		 547 aa  636    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.36504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0699  chaperonin GroEL  59.77 
 
 		 546 aa  643    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.0116796 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1518  chaperonin GroEL  58.44 
 
 		 547 aa  635    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000106639  normal  0.660636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0428  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 548 aa  659    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.29083  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3427  chaperonin GroEL  59.67 
 
 		 540 aa  652    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0378  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0165789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1580  chaperonin GroEL  59.22 
 
 		 540 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6727  chaperonin GroEL  59.03 
 
 		 540 aa  641    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0750  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.20211  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0542  chaperonin GroEL  59.01 
 
 		 551 aa  639    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0884836  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0677  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.380553  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3451  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6096  chaperonin GroEL  59.63 
 
 		 540 aa  650    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1118  chaperonin GroEL  60.23 
 
 		 550 aa  645    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5661  chaperonin GroEL  59.96 
 
 		 547 aa  643    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00217744  hitchhiker  0.00916783 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0733  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 546 aa  649    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0551266  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3081  chaperonin GroEL  59.67 
 
 		 540 aa  652    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6392  chaperonin GroEL  59.26 
 
 		 540 aa  647    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0385642 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0860  chaperonin GroEL  60.53 
 
 		 546 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0348767  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3522  chaperonin GroEL  60.34 
 
 		 546 aa  640    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6251  chaperonin GroEL  59.22 
 
 		 540 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.775744 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2567  chaperonin GroEL  60.42 
 
 		 552 aa  646    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164094  normal  0.0779546 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5253  chaperonin GroEL  61.1 
 
 		 540 aa  634  1e-180  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04013  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3849  chaperonin GroEL  58.63 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4608  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 545 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4600  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0722  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3869  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.749849 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3675  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4384  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03975  hypothetical protein  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3822  chaperonin GroEL  59.2 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4748  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.729761  normal  0.333677 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4672  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4727  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4698  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5659  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.315114 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0591  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 546 aa  628  1e-179  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3753  chaperonin GroEL  59.01 
 
 		 548 aa  629  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4612  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  630  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.562715 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4691  chaperonin GroEL  58.82 
 
 		 548 aa  631  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0295  chaperonin GroEL  59.51 
 
 		 551 aa  628  1e-179  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.206807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1623  chaperonin GroEL  58.35 
 
 		 547 aa  629  1e-179  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.757187  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3403  chaperonin GroEL  58.44 
 
 		 548 aa  627  1e-178  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0646  chaperonin GroEL  60.75 
 
 		 548 aa  624  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.59396  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0330  chaperonin GroEL  58.63 
 
 		 547 aa  627  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000528969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>