63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_1143 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_1143  heavy metal transport/detoxification protein  100 
 
 		 127 aa  249  9.000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00252134  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4489  heavy metal transport/detoxification protein  60.55 
 
 		 145 aa  123  8.000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.485283  normal  0.0949598 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4491  copper-translocating P-type ATPase  81.69 
 
 		 889 aa  121  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217728 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1144  heavy metal translocating P-type ATPase  76.71 
 
 		 851 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0307276  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1513  heavy metal translocating P-type ATPase  45.45 
 
 		 817 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4524  copper-translocating P-type ATPase  42.42 
 
 		 823 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1713  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 814 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291358  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5330  heavy metal translocating P-type ATPase  40.62 
 
 		 814 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.8477 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0711  ATPase, E1-E2 type:copper-translocating P-type ATPase:heavy metal translocating P-type ATPase  44.44 
 
 		 812 aa  49.7  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.139476  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3779  heavy metal-transporting ATPase  38.46 
 
 		 805 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000381926  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1889  P-type copper-transporting ATPase  40 
 
 		 954 aa  47.8  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3496  heavy metal translocating P-type ATPase  37.5 
 
 		 806 aa  47.8  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.170842  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0021  copper ion binding protein  35.94 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00208737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0119  heavy metal translocating P-type ATPase  42.86 
 
 		 816 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0024  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 757 aa  47.4  0.00008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0738  copper ion binding protein  35.85 
 
 		 70 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0741164  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3575  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0131319  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3741  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000497644 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3859  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000448263  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1596  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 834 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0911  Heavy metal transport/detoxification protein  40.38 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3758  heavy metal-transporting ATPase  37.29 
 
 		 805 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000825532  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3487  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000442964  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3475  heavy metal-transporting ATPase  37.5 
 
 		 805 aa  46.6  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000616421  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2044  heavy metal translocating P-type ATPase  46.67 
 
 		 834 aa  46.2  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000418772  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3829  copper-translocating P-type ATPase  37.29 
 
 		 806 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0228727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0325  heavy metal translocating P-type ATPase  38.16 
 
 		 821 aa  44.7  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.1899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1877  heavy metal translocating P-type ATPase  39.13 
 
 		 837 aa  45.1  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000289142  hitchhiker  0.00605245 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2280  heavy metal translocating P-type ATPase  36.73 
 
 		 818 aa  44.3  0.0005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.252713  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3639  heavy metal translocating P-type ATPase  41.18 
 
 		 786 aa  44.3  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4377  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 750 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.172254 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4416  copper-translocating P-type ATPase  35.38 
 
 		 759 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2308  heavy metal translocating P-type ATPase  40.32 
 
 		 841 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3727  heavy metal translocating P-type ATPase  33.9 
 
 		 976 aa  43.9  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.671285  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1532  heavy metal translocating P-type ATPase  30.23 
 
 		 797 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1698  cation transport ATPases  34.33 
 
 		 799 aa  43.9  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.118388  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1888  mercury ion binding protein  34.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.399491 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3677  heavy metal translocating P-type ATPase  31.82 
 
 		 894 aa  43.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1472  copper-translocating P-type ATPase  35.59 
 
 		 806 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000228287  hitchhiker  0.0000337327 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1275  heavy metal translocating P-type ATPase  36.96 
 
 		 839 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2917  heavy metal translocating P-type ATPase  32.53 
 
 		 832 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.190789 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1882  mercury ion binding protein  29.41 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.174635  normal  0.821672 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4235  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 753 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.985979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2994  heavy metal translocating P-type ATPase  34.78 
 
 		 838 aa  42.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4847  copper-translocating P-type ATPase  36.67 
 
 		 818 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.24461 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2679  heavy metal translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 857 aa  42.7  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444851  normal  0.668216 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3586  heavy metal translocating P-type ATPase  34.65 
 
 		 824 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.845066  hitchhiker  0.000954776 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2923  heavy metal translocating P-type ATPase  33.85 
 
 		 795 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000167439  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3158  heavy metal transport/detoxification protein  34.38 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.299489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0518  copper-translocating P-type ATPase  29.51 
 
 		 796 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0422  heavy metal translocating P-type ATPase  31.15 
 
 		 723 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0905  heavy metal translocating P-type ATPase  38.3 
 
 		 802 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.631984  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1994  copper-translocating P-type ATPase  32.31 
 
 		 752 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2553  heavy metal translocating P-type ATPase  38.24 
 
 		 838 aa  40.8  0.006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0871604  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2592  heavy metal translocating P-type ATPase  32.93 
 
 		 836 aa  40.8  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0301903  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3170  heavy metal translocating P-type ATPase  25 
 
 		 936 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158229 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2140  copper-translocating P-type ATPase  38.3 
 
 		 803 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1114  Heavy metal transport/detoxification protein  31.34 
 
 		 68 aa  40.8  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0534  copper-translocating P-type ATPase  30.3 
 
 		 889 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.541541  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0518  copper-translocating P-type ATPase  30.77 
 
 		 889 aa  40.4  0.008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0924  heavy metal translocating P-type ATPase  30.65 
 
 		 835 aa  40.4  0.009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1313  heavy metal translocating P-type ATPase  28.99 
 
 		 868 aa  40  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000605467  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1042  copper-translocating P-type ATPase  33.33 
 
 		 813 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>