More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_D6478 on replicon NC_007337
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007337  Reut_D6478  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  100 
 
 
295 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6475  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  99.66 
 
 
295 aa  578  1e-164  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1131  LysR family transcriptional regulator  57.84 
 
 
294 aa  317  2e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3799  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  41.89 
 
 
300 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00621197 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3313  LysR family transcriptional regulator  42.76 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30850  LysR family transcriptional regulator  41.1 
 
 
302 aa  209  3e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6467  regulatory protein, LysR  46.92 
 
 
228 aa  202  8e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0474  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
293 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.316429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0216  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
301 aa  183  2.0000000000000003e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1360  transcriptional regulator, LysR family  40.74 
 
 
303 aa  177  2e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.325341  normal  0.0430016 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4880  LysR family transcriptional regulator  38.31 
 
 
305 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.839587  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2279  LysR family transcriptional regulator  36.3 
 
 
299 aa  176  3e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.77751  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0824  LysR family transcriptional regulator  36.77 
 
 
295 aa  176  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.607099 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6318  LysR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
296 aa  175  7e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.149291  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5353  LysR family transcriptional regulator  39.42 
 
 
307 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.532482 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1424  transcriptional regulator, LysR family  40.96 
 
 
303 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.442699 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4650  transcriptional regulator, LysR family  36.64 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.70573  normal  0.347799 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3345  LysR family transcriptional regulator  37.41 
 
 
286 aa  173  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2320  LysR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
305 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00283549  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1131  LysR family transcriptional regulator  40 
 
 
310 aa  171  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3804  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
326 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.699235 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0474  transcriptional regulator CatR  37.67 
 
 
306 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3717  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
326 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.038308 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4646  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
326 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2394  LysR family transcriptional regulator  37.45 
 
 
305 aa  169  4e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.888535  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5457  LysR family transcriptional regulator  37.73 
 
 
305 aa  169  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0916  LysR family transcriptional regulator  37.96 
 
 
305 aa  169  6e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3601  LysR family transcriptional regulator  37.36 
 
 
305 aa  168  8e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.773221  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3126  LysR family transcriptional regulator  34.35 
 
 
296 aa  168  9e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.211157  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4401  LysR family transcriptional regulator  38.38 
 
 
305 aa  168  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0068  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
298 aa  167  1e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5585  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
298 aa  167  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462735  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3457  als operon regulatory protein AlsR  32.65 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.943458  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3423  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.141428  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3374  LysR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.08343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1538  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 
299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0429395 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3709  putative als operon regulatory protein AlsR  32.65 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.510407  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3685  putative als operon regulatory protein AlsR  32.65 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3729  als operon regulatory protein AlsR  32.65 
 
 
301 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3776  transcriptional regulator, LysR family  32.99 
 
 
299 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2154  transcriptional regulator, LysR family  36.99 
 
 
295 aa  167  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0821  transcriptional regulator, LysR family  37.63 
 
 
298 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0540741  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3702  als operon regulatory protein AlsR, putative  32.65 
 
 
301 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3354  LysR family transcriptional regulator  32.31 
 
 
302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.910894  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3771  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
296 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.382888  normal  0.377047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1589  transcriptional regulator, LysR family  37.68 
 
 
307 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.323043  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4592  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
296 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3752  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
296 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2114  LysR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
313 aa  166  5.9999999999999996e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.28902  normal  0.253639 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1553  LysR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
305 aa  165  8e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1688  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.18 
 
 
293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5056  LysR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
375 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0334022  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2107  LysR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.329852  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0999  transcriptional regulator CatR  36.3 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2728  transcriptional regulator CatR  40.07 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2327  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
296 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32200  transcriptional regulator CatR  39.72 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.156456  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3663  LysR family transcriptional regulator  37.72 
 
 
296 aa  163  3e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.148857  normal  0.207098 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1479  LysR family transcriptional regulator  36.81 
 
 
289 aa  163  3e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.175288 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4879  LysR family transcriptional regulator  35.94 
 
 
291 aa  163  3e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.735479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3244  LysR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
316 aa  163  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.634923  normal  0.10907 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2580  ben operon transcriptional regulator BenM  36.64 
 
 
306 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0216  ben operon transcriptional regulator BenM  36.64 
 
 
306 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0188  transcriptional regulator CatR  36.64 
 
 
304 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0666967  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2724  ben operon transcriptional regulator BenM  36.64 
 
 
306 aa  162  6e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4030  LysR family transcriptional regulator  36.99 
 
 
296 aa  162  6e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.3967  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1361  ben operon transcriptional regulator BenM  36.64 
 
 
306 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232512  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1557  ben operon transcriptional regulator BenM  36.64 
 
 
306 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4959  LysR family transcriptional regulator  38.08 
 
 
298 aa  162  9e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4876  LysR family transcriptional regulator  35.49 
 
 
335 aa  161  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0982311 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2212  LysR family transcriptional regulator  40.38 
 
 
296 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00538572  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1735  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 
296 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.185137  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1662  transcriptional regulator, LysR family  41.83 
 
 
296 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.204257  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0075  LysR family transcriptional regulator  36.55 
 
 
296 aa  160  2e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4630  LysR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
295 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.133598  hitchhiker  0.000277503 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0664  LysR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
295 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0825274 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66490  LysR family transcriptional regulator  35.57 
 
 
301 aa  159  5e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5500  LysR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
296 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0537  LysR family transcriptional regulator  35.97 
 
 
308 aa  159  7e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.747405  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0985  transcriptional regulator CatR  37 
 
 
295 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.460056  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2709  cat operon transcriptional activator CatR  37 
 
 
295 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.393204  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2565  cat operon transcriptional activator CatR  37 
 
 
295 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0232  cat operon transcriptional activator CatR  37 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.691367  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0201  transcriptional regulator CatR  37 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6430  LysR family transcriptional regulator  33.91 
 
 
296 aa  158  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00632877  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1376  cat operon transcriptional activator CatR  37 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.345874  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0486  transcriptional regulator CatR  36.76 
 
 
295 aa  157  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1573  cat operon transcriptional activator CatR  37 
 
 
295 aa  158  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0212  LysR family transcriptional regulator  36.15 
 
 
306 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1173  LysR family transcriptional regulator  37.06 
 
 
319 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0421  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  36.49 
 
 
296 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4359  LysR family transcriptional regulator  37.68 
 
 
303 aa  155  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5766  putative transcriptional regulator  35.57 
 
 
301 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3044  LysR family transcriptional regulator  35.53 
 
 
301 aa  155  8e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.727695 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1271  LysR family transcriptional regulator  33.22 
 
 
305 aa  154  1e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0459918  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2633  LysR family transcriptional regulator  35.45 
 
 
305 aa  155  1e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.787388  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08550  Transcriptional regulator, LysR family  35.74 
 
 
307 aa  154  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.763554  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0833  transcriptional regulator, LysR family  34.81 
 
 
294 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2052  LysR family transcriptional regulator  35.62 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.251194  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0175  LysR family transcriptional regulator  36.91 
 
 
302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.602241  normal  0.0372511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>