More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5931 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007336  Reut_C5931  endoribonuclease L-PSP  100 
 
 
126 aa  266  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2407  endoribonuclease L-PSP  79.2 
 
 
140 aa  212  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.098074  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4266  endoribonuclease L-PSP  76 
 
 
141 aa  207  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.727317  normal  0.315127 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_4019  endoribonuclease L-PSP  42.86 
 
 
130 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4793  endoribonuclease L-PSP  37.7 
 
 
133 aa  103  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.192695  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0725  Endoribonuclease L-PSP  33.58 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.107947 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3238  endoribonuclease L-PSP  38.24 
 
 
151 aa  65.1  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.635376 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0613  Endoribonuclease L-PSP  38.94 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1213  endoribonuclease L-PSP  36.71 
 
 
129 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1336  endoribonuclease L-PSP  37.11 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5927  endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0894752  normal  0.145489 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25710  endoribonuclease L-PSP, putative  32.41 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2069  endoribonuclease L-PSP, putative  37.08 
 
 
125 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0171544  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04783  hypothetical protein  33.6 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05655  hypothetical protein  33.6 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1726  endoribonuclease L-PSP  34.65 
 
 
126 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.622366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2754  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 
129 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.155396  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0610  putative endoribonuclease L-PSP  32.5 
 
 
126 aa  58.9  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.00344225  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0821  endoribonuclease L-PSP  32.73 
 
 
126 aa  58.5  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2006  YjgF-like protein  34.65 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.011339 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0245  endoribonuclease L-PSP  33.88 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.836469  normal  0.336264 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4840  putative endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4711  putative endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.44833  normal  0.31675 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4861  putative endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0051  endoribonuclease L-PSP  36.17 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0150  endoribonuclease L-PSP  32.32 
 
 
126 aa  57.4  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000335683  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4742  putative endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4805  putative endoribonuclease L-PSP  35.11 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163261  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0355  endoribonuclease L-PSP  34.31 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000606003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1265  endoribonuclease L-PSP  33.06 
 
 
124 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0109  endoribonuclease L-PSP  33.91 
 
 
140 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.748315  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0603  putative endoribonuclease L-PSP  39.39 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_8140  predicted protein  33.93 
 
 
131 aa  56.2  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0191964  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2343  putative endoribonuclease L-PSP  35.19 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.435007  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0574  putative endoribonuclease L-PSP  32.77 
 
 
131 aa  55.8  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000328511  hitchhiker  0.00876549 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1258  putative endoribonuclease L-PSP  33.68 
 
 
126 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.768034  normal  0.325919 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002892  endoribonuclease L-PSP  31.53 
 
 
126 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1288  YjgF family translation initiation inhibitor  34.65 
 
 
128 aa  55.1  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.633e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1523  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.383106 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0208  YjgF-like protein  35.78 
 
 
126 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01013  hypothetical protein  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2632  Endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.763803  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1125  rutC protein  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1128  rutC protein  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2585  endoribonuclease L-PSP  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0607666 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2115  rutC protein  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01020  hypothetical protein  28.83 
 
 
128 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1160  hypothetical protein  35.11 
 
 
128 aa  53.9  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1723  endoribonuclease L-PSP  30.51 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.136811  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0192  endoribonuclease L-PSP  28.44 
 
 
125 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0935  YjgF-like protein  30.63 
 
 
130 aa  53.5  0.0000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1267  putative endoribonuclease L-PSP  34.55 
 
 
126 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.686095  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07040  conserved hypothetical protein  29.52 
 
 
134 aa  53.5  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1052  endoribonuclease L-PSP, putative  29.03 
 
 
125 aa  53.1  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0968171  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0792  Endoribonuclease L-PSP  29.52 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0072  endoribonuclease L-PSP, putative  34.86 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3740  endoribonuclease L-PSP  32.26 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5489  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.285458  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0434  putative endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04590  endoribonuclease L-PSP, putative  29.41 
 
 
126 aa  52.8  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0655  YjgF-like protein  34.18 
 
 
130 aa  53.1  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3783  endoribonuclease L-PSP  33.04 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4111  Endoribonuclease L-PSP  32.74 
 
 
127 aa  53.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.745875  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1089  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0498  endoribonuclease L-PSP  34.04 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1894  putative endoribonuclease L-PSP  34.95 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.373962  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3572  endoribonuclease L-PSP  31.91 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0517  Endoribonuclease L-PSP  32.29 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2582  endoribonuclease L-PSP  34.52 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1096  endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3898  putative endoribonuclease L-PSP  33.07 
 
 
123 aa  52.8  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5351  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.120193  normal  0.233615 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5552  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0445  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
128 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.013198 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0412  putative endoribonuclease L-PSP  29.7 
 
 
127 aa  51.6  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0170  endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
126 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0281593 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5303  endoribonuclease  33.64 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.141797 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16660  endoribonuclease L-PSP  35.87 
 
 
127 aa  51.6  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5212  putative endoribonuclease L-PSP  33.64 
 
 
126 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.36615 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3322  endoribonuclease L-PSP  32.91 
 
 
94 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.939467  normal  0.143493 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0418  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
128 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.891288  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0496  endoribonuclease L-PSP  31.87 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0676524  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3904  putative endoribonuclease L-PSP  33.33 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.147099 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0734  endoribonuclease L-PSP, putative  35.29 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3980  endoribonuclease L-PSP  27.88 
 
 
129 aa  50.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.370858 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2982  Endoribonuclease L-PSP  38.27 
 
 
123 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3858  L-PSP family endoribonuclease  30.95 
 
 
125 aa  50.4  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.956298  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2283  endoribonuclease L-PSP  31.73 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000755149  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2798  endoribonuclease L-PSP  33 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000409658  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3737  endoribonuclease L-PSP  31.91 
 
 
128 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04111  ketoacid-binding protein  35.79 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3751  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0041  endoribonuclease L-PSP  32.1 
 
 
124 aa  50.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4166  putative endoribonuclease L-PSP  30 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1582  endoribonuclease L-PSP  30.53 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4724  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4816  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
128 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3768  endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
128 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5765  putative endoribonuclease L-PSP  35.79 
 
 
141 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_920  translation initiation inhibitor, yjgF family  28.71 
 
 
138 aa  50.4  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000322084  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>