17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C5905 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C5905    100 
 
 		 281 bp  557  1e-157  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.544701  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5906  excinuclease ABC subunit A  100 
 
 		 2694 bp  204  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3073  excinuclease ABC, A subunit  91.89 
 
 		 2853 bp  145  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0673699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0918  excinuclease ABC subunit A  95.65 
 
 		 2700 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4178  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89.39 
 
 		 687 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3700  ThiJ/PfpI domain-containing protein  89.39 
 
 		 687 bp  75.8  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1737  ThiJ/PfpI family protein  88.89 
 
 		 687 bp  69.9  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0276901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4272  ThiJ/PfpI domain-containing protein  87.3 
 
 		 687 bp  61.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3245  ThiJ/PfpI domain-containing protein  87.3 
 
 		 687 bp  61.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.433904  normal  0.585476 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4094  ThiJ/PfpI  87.3 
 
 		 687 bp  61.9  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.19903  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4323  ThiJ/PfpI domain-containing protein  86.36 
 
 		 687 bp  60  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.224439 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0745  Fis family transcriptional regulator  84.42 
 
 		 681 bp  58  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.201506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6320  excinuclease ABC, A subunit  90.24 
 
 		 2658 bp  50.1  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.687364  normal  0.941375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0819  ThiJ/PfpI domain protein  87.76 
 
 		 693 bp  50.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0093  ThiJ/PfpI  85 
 
 		 696 bp  48.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_92674  predicted protein  100 
 
 		 783 bp  46.1  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.214243  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4773  excinuclease ABC, A subunit  89.74 
 
 		 2553 bp  46.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.235666  normal  0.0143445 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>