More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4005 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4005  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  413  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5807  SNARE associated Golgi protein  57.75 
 
 		 215 aa  243  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.468515  normal  0.433949 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  49.22 
 
 		 214 aa  196  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2768  hypothetical protein  50.75 
 
 		 212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.375842  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  46.46 
 
 		 213 aa  187  8e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2835  SNARE associated Golgi protein  47.8 
 
 		 215 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.691658  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2559  DEDA DSG-1 protein transmembrane  47.8 
 
 		 218 aa  182  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0105855  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2429  SNARE associated Golgi protein  47.32 
 
 		 215 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2907  hypothetical protein  48.1 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  47.2 
 
 		 227 aa  178  4e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  49.03 
 
 		 253 aa  176  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  47.66 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  47.66 
 
 		 223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  46.54 
 
 		 229 aa  167  8e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  42.05 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3296  DedA family membrane protein  49.03 
 
 		 226 aa  165  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0603316  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2313  dedA family protein  49.03 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.485565  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3307  hypothetical protein  49.03 
 
 		 283 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.370816  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2191  DedA family membrane protein  49.03 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0515  dedA family protein  49.03 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.557526  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1084  dedA family protein  49.03 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3263  DedA family membrane protein  49.03 
 
 		 242 aa  164  8e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.666613  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  41.67 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  40.78 
 
 		 244 aa  160  1e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  41.58 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  41.87 
 
 		 230 aa  159  4e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  39.72 
 
 		 222 aa  157  8e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  41.09 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  41.87 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0686  SNARE associated Golgi protein  48.54 
 
 		 257 aa  156  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.47961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  40.22 
 
 		 214 aa  155  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0735  SNARE associated Golgi protein  47.09 
 
 		 244 aa  155  4e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.633458  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3854  DedA family transmembrane protein  46.26 
 
 		 227 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  38.55 
 
 		 214 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000684044  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0282  DedA family transmembrane protein  47.09 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0766  DedA family transmembrane protein  47.09 
 
 		 244 aa  154  8e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0661  DedA family transmembrane protein  48.54 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  41 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  41.38 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  41.38 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1148  hypothetical protein  38.39 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  41.95 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  40.39 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  40.39 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  43.81 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  37.86 
 
 		 215 aa  145  5e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  39.02 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  43 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  38 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  39.06 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  37.11 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  142  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  38.35 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  38.54 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.54 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2156  SNARE associated Golgi protein  40.87 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2527  membrane protein, DedA family  40.87 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  38.54 
 
 		 219 aa  141  9e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2987  hypothetical protein  37.07 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  37.98 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  41.67 
 
 		 213 aa  138  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  39.5 
 
 		 219 aa  138  4.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  43.81 
 
 		 215 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  37.8 
 
 		 222 aa  136  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1269  SNARE associated Golgi protein  38.2 
 
 		 201 aa  136  2e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  36.15 
 
 		 220 aa  136  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  38.54 
 
 		 221 aa  137  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  38.5 
 
 		 213 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  39.62 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0540  SNARE associated Golgi protein  42.78 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0579  SNARE associated Golgi protein  42.78 
 
 		 215 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.6837  normal  0.582888 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  37.88 
 
 		 218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1452  hypothetical protein  35.94 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  decreased coverage  0.00552947  normal  0.0731246 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  38.92 
 
 		 252 aa  132  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  36.98 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  36.98 
 
 		 219 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0089  SNARE associated Golgi protein  39.77 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.061617 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3233  SNARE associated Golgi protein  41.57 
 
 		 230 aa  131  6e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  38.33 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  38.33 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 		 218 aa  131  6.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  38.33 
 
 		 220 aa  131  6.999999999999999e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  37.5 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  40.11 
 
 		 218 aa  131  9e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  35.23 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  38.54 
 
 		 232 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0667  DedA family protein  40.2 
 
 		 227 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.385755  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  37.24 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  41.79 
 
 		 215 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  40.3 
 
 		 216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  41.29 
 
 		 215 aa  124  9e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.9 
 
 		 231 aa  122  5e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  36.95 
 
 		 220 aa  121  7e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  41.57 
 
 		 262 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>